Жаңылыктар

Transposable элементи (TE) күчөтүү геном өлчөмүн кеңейтүү жана эволюция ортомчу кыймылдаткыч күч катары таанылган, бирок 3D геномдук архитектура калыптандыруу кесепеттери өсүмдүктөрдө негизинен белгисиз бойдон калууда.Бул жерде биз геномдук өлчөмү боюнча үч эсеге жеткен пахтанын үч түрү үчүн маалымдама класстагы геномдук жыйындарды кабарлайбыз.Gossypium rotundifolium(K2),G. дендропарк(A2), жанаG. raimondii(D5), Oxford Nanopore Technologies колдонуу.Салыштырмалуу геномдук анализдер геномдун чоң өлчөмүнүн айырмачылыгына (K2, 2,44 Гб; A2, 1,62 Гб; D5, 750,19 Мб) көмөктөшүүчү геномдун спецификалык ТЭ күчөтүү деталдарын документтештирет жана салыштырмалуу сакталган ген мазмунун жана геномдор арасындагы синтения мамилелерин көрсөтөт.Синтендик гендердин болжол менен 17% активдүү (“А”) жана жигердүү эмес (“B”) бөлүмдөрдүн ортосунда хроматин абалынын өзгөрүшүн көрсөттү жана ТЭнин күчөшү ген аймактарында (~ 7000 ген) А бөлүгүнүн үлүшүнүн көбөйүшү менен байланышкан. ) D5ке салыштырмалуу K2 жана A2де.Үч геномдун арасында топологиялык ассоциацияланган домендин (TAD) чектеринин 42% гана сакталган.Биздин маалыматтар тукумга мүнөздүү TAD чек аралары пайда болгондон кийин ТЭнин жакында күчөгөнүн билдирет.Бул изилдөө өсүмдүктөрдүн жогорку тартиптеги хроматин структурасынын эволюциясында транспозондук геномдун кеңейүү ролуна жарык чачат.