● Максаттуу протеинди коддоо аймагы: протеинди коддоо аймагын басып алуу жана секвенирлөө аркылуу hWES белоктун структурасына тиешелүү варианттарды ачуу үчүн колдонулат;
● Жогорку тактык: жогорку секвенирлөө тереңдиги менен hWES жалпы варианттарды жана 1% дан төмөн жыштыктагы сейрек варианттарды табууга көмөктөшөт;
● Эффективдүү чыгымдар: hWES адам геномунун 1% адам ооруларынын мутацияларынын болжол менен 85% берет;
● Q30>85% кепилденген бүт процессти камтыган беш катуу QC процедурасы.
Платформа
| Китепкана
| Exon Capture Strategy
| Референциялоо стратегиясын сунуштоо
|
Illumina NovaSeq платформасы
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Гб 10 Гб |
Үлгү түрү
| Суммасы(Qubit®)
| Көлөм
| Концентрация
| Тазалык(NanoDrop™) |
Геномдук ДНК
| ≥ 300 нг | ≥ 15 мкл | ≥ 20 нг/мкл | OD260/280=1,8-2,0 деградация, булгануу жок
|
Mendelian бузулуулар / сейрек оорулар үчүн: 50 × жогору натыйжалуу секвенирлөө тереңдиги
Шишик үлгүлөрү үчүн: 100 × жогору натыйжалуу секвенирлөө тереңдиги
1. Тегиздөө статистикасы
Таблица 1 Картанын натыйжаларынын статистикасы
Таблица 2 Экзоманы басып алуу статистикасы
2.Variation Detection
1-сүрөт SNV жана InDel статистикасы
3. Advanced Analysis
2-сүрөт Геном боюнча зыяндуу SNV жана InDelдин Circos сюжети
Таблица 3 Ооруларды пайда кылуучу гендердин скрининги