Геном боюнча ассоциациянын анализи
1. Кызматтын артыкчылыктары
● Долбоордун көп учурлары: 2009-жылы түзүлгөндөн бери, BMKGENE популяциялык GWAS изилдөөлөрүндө жүздөгөн түр долбоорлорун аяктады, изилдөөчүлөргө 100дөн ашык макалаларды жарыялоого жардам берди, ал эми кумулятивдик импакт фактору 500гө жетти.
● Кесипкөй аналитиктер.
● Кыскача талдоо цикли.
● Маалыматтарды так иштетүү.
2. Кызматтын спецификациялары
| Type | Популяциянын масштабы | Стратегия жана тереңдик |
| SLAF-GWAS | Үлгү номери ≥200 | Геномдун көлөмү < 400M, ref-геному менен WGS сунушталат |
| Геномдун өлчөмү ≤ 1G, 100K Tags жана 10X | ||
| 1G ≤ Геном өлчөмү ≤ 2G, 200K тэг жана 10X | ||
| Геномдун көлөмү > 2G, 300K Tags жана 10X | ||
| WGS-GWAS | Үлгү номери ≥200 | Ар бир үлгү үчүн 10X |
3. Материалды тандоо
Ар кандай сорттор, түрчөлөр, ландрасалар/генбанктар/аралаш үй-бүлөлөр/жапайы ресурстар
Ар кандай сорттор, түрчөлөр, жер кыртыштары
Жарым сибдүү үй-бүлө/толук сибдүү үй-бүлө/жапайы ресурстар
4. Биоинформациялык анализ
● Геном боюнча ассоциациянын анализи
● маанилүү SNP талдоо жана скрининг
● Талапкер генинин функционалдык аннотациясы
5. Кызматтын иш агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
РНК экстракциясы
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
а.Фенотип QC
Жыштыктарды бөлүштүрүү гистограммасы
Фенотип статистикасы
б.Ассоциация анализи (Модель: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ Plot
Манхэттен участогу
| Жыл | Журнал | IF | Title |
| 2022 | NC | 17.69 | Дарак пиондорунун гига-хромосомаларынын жана гига-геномунун геномдук негиздери Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7.43 | Үйдөгү изи сояда агрономиялык мааниге ээ геномдук аймактарды бириктирет |
| 2018 | MP | 9.32 | Рапс кошулмаларынын бүткүл дүйнөлүк коллекциясын бүтүндөй геномдук ресеквенсациялоо алардын экотиптеринин дивергенциясынын генетикалык негизин ачып берет. |
| 2022 | HR | 7.29 | Геномдук ассоциациянын анализи дарбыз уруктарынын өлчөмүнүн табигый өзгөрүшүнө молекулярдык түшүнүктөрдү берет |
