BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукциялар

Эукариоттук мРНК ырааттуулугу-Илюмина

mRNA секвенциясы белгилүү шарттарда клеткалардан транскрипцияланган бардык мРНКлардын профилин түзүүгө мүмкүндүк берет.Бул ген экспрессия профилин, ген структураларын жана кээ бир биологиялык процесстердин молекулярдык механизмдерин ачуу үчүн күчтүү технология.Бүгүнкү күнгө чейин мРНК секвенциясы фундаменталдуу изилдөөдө, клиникалык диагностикада, дарыларды иштеп чыгууда ж.б. кеңири колдонулат.

Платформа: Illumina NovaSeq платформасы


Кызматтын чоо-жайы

Биоинформатика

Демо натыйжалары

Артыкчылыктары

● Жогорку тажрыйбалуу: BMKде 200 000ден ашуун үлгүлөр ар кандай үлгүлөрдүн түрлөрүн камтыган, анын ичинде клетка маданияты, ткань, дене суюктугу ж.б. жана 7 000ден ашуун mRNA-Seq долбоорлору ар кандай изилдөө аймагын камтыган иштетилди.

● Катуу сапатты көзөмөлдөө системасы: үлгүлөрдү даярдоо, китепкананы даярдоо, секвенирлөө жана биоинформатика сыяктуу бардык кадамдар аркылуу сапатты көзөмөлдөөнүн негизги пункттары жогорку сапаттагы натыйжаларды берүү үчүн катуу көзөмөл астында турат.

● Ар кандай изилдөө максаттарын аткаруу үчүн функция аннотациялары жана байытуу изилдөөлөрү үчүн бир нече маалымат базалары бар.

● Сатуудан кийинки кызматтар: Долбоор аяктагандан кийин 3 айга жарактуу сатуудан кийинки кызматтар, анын ичинде долбоорлорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүү, суроолор жана жооптор ж.б.

Үлгү талаптары жана жеткирүү

Китепкана Секвенирлөө стратегиясы Берилиштер сунушталат Сапатты көзөмөлдөө
Poly A байытылган Illumina PE150

6 Гб

Q30≥85%

Үлгү талаптары:

Нуклеотиддер:

Конц.(нг/мкл)

Суммасы (мкг)

Тазалык

актык

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Чектелген же жок белок же ДНК булганышы гелде көрсөтүлгөн.

Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥6,5;

Жаныбарлар үчүн: RIN≥7,0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

чектелген же негизги бийиктиги жок

Кыртыш: Салмагы (кургак):≥1 г
*5 мг аз кыртыш үчүн, биз жарк-тоңдурулган (суюк азотто) кыртыш үлгүсүн жөнөтүүнү сунуштайбыз.

Клетка суспензиясы:Клеткалардын саны = 3×106- 1×107
*Биз тоңдурулган клетка лизатын жөнөтүүнү сунуштайбыз.Бул уяча 5×105тен кичине болсо.

Кан үлгүлөрү:Көлөмү≥1 мл

Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г

Сунушталган үлгү жеткирүү

Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)

Үлгү этикеткалоо: Топ+репликация, мисалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Жөнөтүү:

  1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
  2. RNAstable түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНК стабилдештирүү түтүкчөсүндө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жөнөтүүгө болот.

Кызматтын иш агымы

QC үлгүсү

Эксперимент дизайны

үлгү жеткирүү

Үлгү жеткирүү

Пилоттук эксперимент

РНК экстракциясы

Китепкана даярдоо

Китепкананын курулушу

Секвенциялоо

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Маалыматтарды талдоо

Сатуудан кийинки кызматтар

Сатуудан кийинки кызматтар


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • Биоинформатика

    wps_doc_10

    Эукариот mRNA секвенирлөө талдоо иш процесси

    Биоинформатика

    ØЧийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө

    ØМаалымдама геномунун тегиздөөсү

    ØТранскрипт структурасын талдоо

    ØЭкспрессиянын квантификациясы

    ØДифференциалдык экспрессияны талдоо

    ØФункцияга аннотация жана байытуу

    1.mRNA Маалыматтын каныккан ийри сызыгы

    3(1)

    2.Дифференциалдык туюнтма анализи-Вулкан сюжети

    4(1)

    3.DEGs боюнча KEGG аннотациясы

    5(1)

    4.DEG боюнча GO классификациясы

    6(1)

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: