● Жогорку тажрыйбалуу: BMKде 200 000ден ашуун үлгүлөр ар кандай үлгүлөрдүн түрлөрүн камтыган, анын ичинде клетка маданияты, ткань, дене суюктугу ж.б. жана 7 000ден ашуун mRNA-Seq долбоорлору ар кандай изилдөө аймагын камтыган иштетилди.
● Катуу сапатты көзөмөлдөө системасы: үлгүлөрдү даярдоо, китепкананы даярдоо, секвенирлөө жана биоинформатика сыяктуу бардык кадамдар аркылуу сапатты көзөмөлдөөнүн негизги пункттары жогорку сапаттагы натыйжаларды берүү үчүн катуу көзөмөл астында турат.
● Ар кандай изилдөө максаттарын аткаруу үчүн функция аннотациялары жана байытуу изилдөөлөрү үчүн бир нече маалымат базалары бар.
● Сатуудан кийинки кызматтар: Долбоор аяктагандан кийин 3 айга жарактуу сатуудан кийинки кызматтар, анын ичинде долбоорлорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүү, суроолор жана жооптор ж.б.
Китепкана | Секвенирлөө стратегиясы | Берилиштер сунушталат | Сапатты көзөмөлдөө |
Poly A байытылган | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотиддер:
Конц.(нг/мкл) | Суммасы (мкг) | Тазалык | актык |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Чектелген же жок белок же ДНК булганышы гелде көрсөтүлгөн. | Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥6,5; Жаныбарлар үчүн: RIN≥7,0; 5.0≥28S/18S≥1.0; чектелген же негизги бийиктиги жок |
Кыртыш: Салмагы (кургак):≥1 г
*5 мг аз кыртыш үчүн, биз жарк-тоңдурулган (суюк азотто) кыртыш үлгүсүн жөнөтүүнү сунуштайбыз.
Клетка суспензиясы:Клеткалардын саны = 3×106- 1×107
*Биз тоңдурулган клетка лизатын жөнөтүүнү сунуштайбыз.Бул уяча 5×105тен кичине болсо.
Кан үлгүлөрү:Көлөмү≥1 мл
Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)
Үлгү этикеткалоо: Топ+репликация, мисалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Жөнөтүү:
Биоинформатика
Эукариот mRNA секвенирлөө талдоо иш процесси
Биоинформатика
ØЧийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө
ØМаалымдама геномунун тегиздөөсү
ØТранскрипт структурасын талдоо
ØЭкспрессиянын квантификациясы
ØДифференциалдык экспрессияны талдоо
ØФункцияга аннотация жана байытуу
1.mRNA Маалыматтын каныккан ийри сызыгы
2.Дифференциалдык туюнтма анализи-Вулкан сюжети
3.DEGs боюнча KEGG аннотациясы
4.DEG боюнча GO классификациясы