ДНК/РНК секвенирлөө – Иллюминанын секвенсери
Кызматтын чоо-жайынын өзгөчөлүктөрү
| Платформа | Секвенция режими | Тиркемелер |
| Illumina Nova системасы | SE50 PE50 PE150 PE250 | 1. Бүтүндөй геномдорду тез ыраатташтыруу 2. Максаттуу аймактарды терең ырааттуулук менен кичирейтиңиз 3. РНКнын секвенирлөөсүн (РНК-Seq) жаңы РНК варианттарын жана сплайс жерлерин табуу үчүн колдонуңуз же ген экспрессиясын талдоо үчүн mRNAлардын санын аныктаңыз 4. Геном боюнча ДНК метилизациясы жана ДНК-белоктун өз ара аракеттенүүсү сыяктуу эпигенетикалык факторлорду талдоо 5. Рак үлгүлөрүн сейрек кездешүүчү соматикалык варианттарды, шишик субклондорун жана башкаларын изилдөө үчүн ырааттуулук менен тандаңыз Адамдардагы же айлана-чөйрөдөгү микробдук ар түрдүүлүктү изилдөө |
Кызматтын артыкчылыктары
● Illumina секвенирлөө платформасында ар кандай түрдөгү миңдеген жабык долбоорлор менен кеңири тажрыйба.
● Кыска убакыт менен жетилген секвенирлөө процесси.
● Толук төмөнкү агымдагы биоинформатика талдоо кызматтары.
● Катуу сапатты көзөмөлдөө системасы: секвенирлөө маалыматтардын катуу QC стандарты.
Үлгү талаптары*
| ырааттуу платформа & Секвенирлөө стратегиясы | Маалыматтын көлөмү |
Концентрация
| Көлөм | Суммасы | QC натыйжасы |
| Novaseq системасы, жупташкан аягы 150bp | X≤30Гб | ≥1нг/мкл | ≥20 мкл | ≥20нг | Квалификациялуу |
| 30Гб < X≤100Гб | ≥1нг/мкл | ≥25 мкл | ≥30нг | ||
| X>100Gb | ≥2нг/мкл | ≥25 мкл | ≥50нг |
-
Концентрациядан жана жалпы суммадан тышкары, ылайыктуу чоку үлгүсү да талап кылынат.
Жалгыз тилке (Illumina)
| Платформа
|
Концентрация
| Көлөм | QC натыйжасы |
| HiseqXten | ≥2,5нМ | ≥20μL | Квалификациялуу |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥2nM | ≥30μL | |
| NovaSeg 6000 SP | ≥2nM | ≥30μL |
Сураныч, үлгүлөрүңүз баштапкы материалдын талаптарына жооп бербесе, бизге кайрылыңыз.
Кызматтын иш процесси
Китепкананын сапатын көзөмөлдөө
Секвенциялоо
Маалыматтын сапатын көзөмөлдөө
Долбоорду жеткирүү
РНК үлгүсүндөгү маалыматтардын сапатын баалоо
Таблица 1. Маалыматтарды секвенирлөө боюнча статистика.
| Үлгү ID | BMKID | Чийки окуйт | Чийки дайындар (bp) | Таза окуулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Сүрөт 1. Ар бир үлгүдөгү окуулар боюнча сапаттын бөлүштүрүлүшү
2-сүрөт. Негизги мазмундун бөлүштүрүлүшү
3-сүрөт. Окулган мазмундун секвенирлөө маалыматтарында бөлүштүрүлүшү
