Products

Rêzkirina RNAya prokaryotî

Rêzkirina RNA ya prokaryotî rêziknameya nifşê din (NGS) bikar tîne da ku hebûna û hêjahiya RNA di demek diyarkirî de eşkere bike, bi analîzkirina guheztina transkriptoma şaneyê.Rêzkirina RNA ya prokaryotî ya pargîdaniya me, bi taybetî prokaryotên bi genomên referansê re armanc dike, ji we re profîlên transkrîptomê, analîza strukturên genê, hwd peyda dike. Ew bi berfirehî ji bo lêkolîna zanistiya bingehîn, lêkolîn û pêşkeftina dermanan, û hwd.

Platform: Platforma Illumina NovaSeq

Paqij bûn

Details Service

Specifications Service

Platform: Platforma Illumina NovaSeq, PE150

Tîpa pirtûkxaneyê: 350bp pirtûkxaneya cDNA têxe (girêdayî belavkirina lûtkeyê)

Stratejiya rêzgirtinê: Paired-End 150 bp

Mîqdara daneyê pêşniyar bikin: Daneyên xav / nimûne 2 Gb

Bioinformatics

(1) Kontrolkirina kalîteya daneya rêzik: Dabeşkirina nukleotîd, dabeşkirina kalîteya bingehîn, nirxandina rêjeya rRNA;

(2) Analîzkirina hevrêziya rêzê: Statîstîkên encamên hevrêziyê, Têrbûna rêzgirtinê, Vegirtina rêzgirtinê;

(3) Annotasyona genomê ya referansê (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Analîzkirina derbirînê: Dabeşkirina derbirînê (Bi du an zêdetir nimûneyan), Analîzkirina derbirînê di navbera nimûneyan de (Analîzasyona Venn, Analîzkirina hevrêziyê, analîza PCA);

(5) Analîza îfadeya cihêreng (Bi du an zêdetir nimûneyan);

(6) Analîzkirina koma genê: Analîzkirina Venn, Analîzkirina Cluster, Analîzkirina annotasyona fonksiyonê (COG, GO, KEGG), Analîzkirina dewlemendkirina fonksiyonê (GO, KEGG), Grafika kordal a dewlemendkirina fonksiyonê, analîza Ipath;

(7) Analîzkirina sRNA: pêşbîniya sRNA, annotasyona sRNA (Teqîn, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), pêşbîniya avahiya duyemîn a sRNA, pêşbîniya gena hedefa sRNA;

(8) Analîzkirina strukturê transkrîptê: Analîzkirina operonê, pêşbînkirina malperên destpêk û dawiya transkrîpsiyonê, şîrovekirin û analîzkirina UTR, pêşbîniya rêza promoter, analîza SNP / InDel (Şîrovekirina SNP / InDel, belavkirina herêmî ya SNP / InDel, statîstîkên SNP).