-
Rêzkirina ARNyê ya yek-nok
Pêşkeftina di girtina yek hucreyê de û teknîka avakirina pirtûkxaneyê ya kesane ya ku bi rêzgirtina berbelav-bilind re têkildar dibe destûr dide lêkolînên vegotina genê li ser bingeha şaneyek-hucre.Ew analîzek pergalê ya kûrtir û bêkêmasî li ser nifûsên hucreyên tevlihev dike, ku tê de ew bi giranî ji maskkirina heterojeniya wan bi girtina navînî ya hemî hucreyan dûr dikeve.
Lêbelê, hin şaneyên ne guncaw in ku di nav suspensiona yek-hucreyê de bêne çêkirin, ji ber vê yekê rêbazên din ên amadekirina nimûneyê - derxistina navokê ji tevnvîsan hewce ne, ango, navok rasterast ji tevn an şaneyê tê derxistin û ji bo yek-nukleusê tê amadekirin. rêza şaneyê.
BMK karûbarê rêzgirtina RNA ya yek-hucreyê ya 10× Genomics ChromiumTM peyda dike.Ev karûbar bi berfirehî di lêkolînên li ser lêkolînên têkildarî nexweşiyê de, wekî cihêrengiya hucreya berevaniyê, heterojeniya tumor, pêşkeftina tevnvî, hwd, bi berfirehî hatî bikar anîn.
Çîpa transkrîptoma cihî: 10× Genomîk
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Plant / Animal Tevahiya Genom Sequencing
Ji nû ve rêzgirtina tevaya genomê, ku wekî WGS jî tê zanîn, hem mutasyonên hevpar û hem jî yên nadir li ser tevahiya genomê di nav wan de Polîmorfîzma Yekane Nukleotide (SNP), Jêbirina Tevgerê (InDel), Guhertoya Strukturê (SV), û Guherîna Hejmara Kopî (CNV) dide xuyakirin. ).SV ji SNP-an beşek mezin a bingeha guherînê pêk tînin û bandorek mezin li ser genomê dikin, ku bandorek girîng li ser organîzmayên zindî dike.Veguhastina dirêj-xwendin rê dide naskirina rasttir a perçeyên mezin û guheztinên tevlihev ji ber ku xwendina dirêj derbaskirina kromozomî li ser deverên tevlihev ên wekî dûbarekirina hevdemî, herêmên dewlemend-GC/AT, û herêmên hîper-guhêrbar pir hêsantir dike.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Transcriptome Cihanî
Transkriptomîka mekanî li pêşiya nûjeniya zanistî radiweste, û lêkolîneran hêz dide ku di nav tevnehev de şêwazên vegotina genê yên tevlihev bişopînin dema ku çarçoweya cîhê xwe biparêzin.Di nav platformên cihêreng de, BMKGene Çîpa Transcriptome Spatial BMKManu S1000 pêşve xistiye, ku pesnê xwe dideçareseriya zêdekirî5 μM, digihîje rêza binehucreyî, û çalak dikemîhengên çareseriyê pir-asta.Çîpa S1000, ku bi qasî 2 mîlyon deqan vedihewîne, mîkrobişkên ku bi berikên ku bi sondayên girtina barkodkirî yên cîhî hatine barkirin, bikar tîne.Pirtûkxaneyek cDNA, ku bi barkodên cîhê ve hatî dewlemend kirin, ji çîpa S1000 tê amadekirin û dûv re li ser platforma Illumina NovaSeq tê rêz kirin.Kombûna nimûneyên barkodkirî yên cîh û UMI rastbûn û taybetmendiya daneya hatî çêkirin piştrast dike.Taybetmendiya bêhempa ya çîpê BMKManu S1000 di pirrengiya wê de ye, ku mîhengên çareseriyê yên pir-astî pêşkêşî dike ku dikarin bi hûrgulî li ser tevn û astên hûrguliyê yên cihêreng werin guheztin.Vê adaptebûnê çîpê wekî vebijarkek berbiçav ji bo lêkolînên cihêreng ên transkriptomîk ên cîhê cîh digire, komkirina cîhê ya rastîn bi dengek hindiktirîn misoger dike.
Bi karanîna çîpê BMKManu S1000 û teknolojiyên din ên transkriptomîk ên fezayî, lêkolîner dikarin têgihiştinek çêtir a rêxistina cîhê ya hucreyan û danûstendinên molekulî yên tevlihev ên ku di hundurê tevnan de çêdibin, bi dest bixin, di derheqê mekanîzmayên ku di binê pêvajoyên biyolojîkî de di gelek qadan de, di nav de onkolojî, neuroscience, biyolojiya pêşkeftinê, immunolojî û lêkolînên botanîkî.
Platform: BMKManu S1000 chip û Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transkriptomîka mekanî teknolojiyek pêşkeftî ye ku destûrê dide lêkolîneran ku li ser şêwazên vegotina genê di nav tevnan de lêkolîn bikin di heman demê de ku çarçoweya cîhê xwe diparêzin.Yek platformek hêzdar a di vê domanê de 10x Genomics Visium e ku bi rêzgirtina Illumina re têkildar e.Prensîba 10X Visium li ser çîpek pispor a bi deverek girtina destnîşankirî ye ku li wir beşên tevnvîsê têne danîn.Ev qada girtinê deqên barkodkirî vedihewîne, ku her yek bi cîhek cîhekî bêhempa di nav tevnê de têkildar e.Dûv re molekulên RNA yên ku ji tevneyê hatine girtin, di pêvajoya veguheztina berevajî de bi nasnameyên molekulî yên yekta (UMI) têne nîşankirin.Van deqên barkodkirî û UMI-ê nexşeya cîhê ya rastîn û pîvandina vegotina genê di çareseriyek yek-hucreyê de dihêle.Kombûna nimûneyên barkodkirî yên cîh û UMI rastbûn û taybetmendiya daneya hatî çêkirin piştrast dike.Bi karanîna vê teknolojiya Transcriptomics Spatial, lêkolîner dikarin têgihîştinek kûr a rêxistina cîhê ya hucreyan û danûstendinên molekulî yên tevlihev ên ku di hundurê tevneyan de çêdibin, peyda bikin, li ser mekanîzmayên ku di binê pêvajoyên biyolojîkî de di gelek waran de, di nav de onkolojî, neuroscience, biyolojiya pêşkeftinê, immunolojî de têgihiştinek bêqîmet peyda dikin. , û lêkolînên botanîkî.
Platform: 10X Genomics Visium û Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina mRNA ya Tev-Deng-Nanopore
Digel ku rêziknameya mRNA-ya NGS-ê wekî amûrek pirreng ji bo pîvandina vegotina genê kar dike, pêbaweriya wê bi xwendina kurt de bandora wê di analîzên tevlihev ên transkrîptomî de sînordar dike.Ji aliyekî din ve rêzgirtina Nanopore teknolojiyek dirêj-xwendin bi kar tîne, û rê dide rêzgirtina transkrîptên mRNA-ya tev-dirêj.Ev nêzîkatî vekolînek berfireh a veqetandina alternatîf, tevhevkirina genan, polî-adenîlasyon, û pîvandina isoformên mRNA hêsan dike.
Rêzkirina nanoporê xwe dispêre îşaretên elektrîkê yên rast-demê yên yek-molekûlê ya nanoporê.Ji hêla proteînên motor ve têne rêve kirin, ADN-ya dubendî bi proteînên nanoporê yên ku di biyofilmek de cih digirin ve girêdide, dema ku ew di kanala nanoporê re di bin cûdahiyek voltazê re derbas dibe vedigere.Nîşaneyên elektrîkî yên cihêreng ên ku ji hêla bingehên cihêreng ên li ser stûna ADNyê ve têne hilberandin, di wextê rast de têne kifş kirin û têne dabeş kirin, ku rêzikên nukleotîdê yên rast û domdar hêsan dikin.Vê nêzîkatiya nûjen sînorên xwendina kurt derbas dike û platformek dînamîkî ji bo analîza genomîkî ya tevlihev peyda dike, lêkolînên transkriptomî yên tevlihev vedigire.
Platform: Nanopore Promethion P48
-
Rêzkirina mRNA ya tev-dirêj -PacBio
Digel ku rêzgirtina mRNA-ya NGS-ê amûrek pirreng e ji bo pîvandina vegotina genê, pêbaweriya wê bi xwendina kurt de karanîna wê di analîzên tevlihev ên transkrîptomî de sînordar dike.Rêzkirina PacBio (Iso-Seq), ji hêla din ve, teknolojiyek dirêj-xwendin bi kar tîne, û rê dide rêzkirina transkrîptên mRNA-ya tev-dirêj.Ev nêzîkatî vekolînek berfireh a veqetandina alternatîf, tevhevkirina genan û polî-adenylasyonê hêsantir dike her çend ew ne bijareya bingehîn e ji bo pîvandina vegotina genê, ji ber ku jimareya zêde ya daneyan hewce dike.
Teknolojiya rêzgirtinê ya PacBio xwe dispêre rêzgirtina yek-molekulek, di dema rast (SMRT) de, ku di girtina transkrîptên mRNA-ya tev-dirêj de feydeyek berbiçav peyda dike.Ev nêzîkatiya nûjen bi karanîna pêlên sifir-mode (ZMWs), bîrên mîkrofabrîk ên ku di dema rêzgirtinê de çavdêriya rast-demê ya çalakiya DNA-polymerase vedihewîne.Di nav van ZMW-an de, ADN-ya polymerase ya PacBio zencîreyek temamker a ADN-yê sentez dike, xwendinên dirêj ên ku tevaya transkrîptên mRNA-yê vedihewîne çêdike.Operasyona PacBio di moda Rêzkirina Lihevhatina Circular (CCS) de rastbûna bi dubarekirina heman molekulê ve zêde dike.Xwendinên HiFi yên hatine çêkirin xwedan rastbûnek bi NGS-ê ye, ku bêtir beşdarî analîzek berfireh û pêbawer a taybetmendiyên tevlihev ên transkrîptomî dike.Platform: PacBio Sequel II
-
Rêzkirina mRNA-ya Eukaryotî-Illumina
Rêzkirina mRNA di bin şert û mercên taybetî de profîlkirina berfireh a hemî transkriptên mRNA di nav hucreyan de hêz dike.Ev teknolojiya pêşkeftî wekî amûrek hêzdar kar dike, profîlên vegotina genê ya tevlihev, strukturên genê, û mekanîzmayên molekulî yên ku bi pêvajoyên cihêreng ên biyolojîkî ve girêdayî ne vedike.Bi berfirehî di lêkolîna bingehîn, tespîtkirina klînîkî, û pêşkeftina dermanan de hatî pejirandin, rêzgirtina mRNA di nav tevliheviyên dînamîkên hucreyî û rêziknameya genetîkî de têgihiştinan pêşkêşî dike.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Rêzkirin-Illumina mRNA-ya ne-çavkanî
Rêzkirina mRNA di bin şert û mercên taybetî de profîlkirina berfireh a hemî transkriptên mRNA di nav hucreyan de hêz dike.Ev teknolojiya pêşkeftî wekî amûrek hêzdar kar dike, profîlên vegotina genê ya tevlihev, strukturên genê, û mekanîzmayên molekulî yên ku bi pêvajoyên cihêreng ên biyolojîkî ve girêdayî ne vedike.Bi berfirehî di lêkolîna bingehîn, tespîtkirina klînîkî, û pêşkeftina dermanan de hatî pejirandin, rêzgirtina mRNA di nav tevliheviyên dînamîkên hucreyî û rêziknameya genetîkî de têgihiştinan pêşkêşî dike.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Rêzkirina ne-kodkirina dirêj-Illumina
ARN-yên ne-kodker ên dirêj (lncRNA) ARN-yên ku ji 200 nukleotîdên dirêjtir in ku xwedan potansiyela kodkirina hindiktirîn in û di ARN-ya nekodker de hêmanên bingehîn in.Di navok û sîtoplazmayê de têne dîtin, ev RNA di rêziknameya epigenetîk, transkrîpsîyonî û piştî-transkrîpsiyonê de rolek girîng dileyzin, û girîngiya wan di şekilkirina pêvajoyên xaneyên û molekulî de destnîşan dikin.Rêzkirina LncRNA di cûdakirina Hucre, Ontogenesis û Nexweşiyên Mirovan de amûrek hêzdar e.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina RNA ya piçûk-Illumina
Molekulên RNA (sRNA) yên piçûk, bi gelemperî di bin dirêjahiya 200 nukleotîdan de, mîkroRNA (miRNA), ARN-yên piçûk ên navbeynkar (siRNA), û ARN-yên ku bi piwi-têkilî (piRNA) ve girêdayî ne, hene.Di nav van de, miRNAs, bi qasî 20-24 nukleotîdan dirêj in, bi taybetî ji ber rolên xwe yên birêkûpêk ên bingehîn di pêvajoyên cihêreng ên hucreyî de girîng in.Bi şêwazên vegotinê yên tevnvîs û qonax-taybetî, miRNA di nav cûreyên cûda de parastinek bilind nîşan dide.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina circRNA-Illumina
Rêzkirina ARN-ya dorhêlî (circRNA-seq) profîl û analîzkirina RNA-yên dordorî ye, çînek molekulên ARNyê yên ku ji ber bûyerên pevgirêdana ne-kanonîkî girêkên girtî çêdikin, û van ARNyê bi îstîqrara zêde peyda dikin.Digel ku hin circRNAs wekî spongên mîkroRNA tevdigerin, mîkroRNAyan vediqetînin û pêşî li wan nagirin ku mRNAyên xwe yên armanc birêkûpêk bikin, circRNAyên din dikarin bi proteînan re têkilî daynin, vegotina genê modul bikin, an jî di pêvajoyên şaneyê de xwedî rol bin.Analîzkirina îfadeya circRNA di derheqê rolên birêkûpêk ên van molekulan û girîngiya wan de di pêvajoyên cihêreng ên hucreyî, qonaxên pêşkeftinê û şert û mercên nexweşiyê de têgihiştinan peyda dike, ku beşdarî têgihiştinek kûr a tevliheviya rêziknameya RNA di çarçoweya vegotina genê de dibe.
-
Rêzkirina tevaya transkrîptomê - Illumina
Rêzkirina tevaya transkrîptomê ji bo profîlkirina molekulên RNA yên cihêreng, nêzîkatiyek berfireh pêşkêşî dike, ku hem RNA-yên kodker (mRNA) hem jî ne-kodker (lncRNA, circRNA, û miRNA) vedihewîne.Ev teknîk di demek diyarkirî de transkrîptoma tevahî ya hucreyên taybetî digire, ku rê dide têgihiştinek tevdeyî ya pêvajoyên hucreyî.Di heman demê de wekî "rêveberiya RNA-ya tevahî" tê zanîn, ew armanc dike ku torên rêkûpêk ên tevlihev di asta transkriptomeyê de eşkere bike, û analîzên kûr ên wekî pêşbaziya RNA-ya endogenous (ceRNA) û analîza RNA-ya hevbeş pêk bîne.Ev gava destpêkê ya berbi taybetmendiya fonksiyonel nîşan dide, nemaze di rakirina torên rêkûpêk ên ku bi danûstendinên ceRNA-ya-bingeha circRNA-miRNA-mRNA ve girêdayî ne.
