-
Rêzkirina Metagenomîk -NGS
Metagenom tê wateya berhevoka maddeya genetîkî ya tevayî ya civakek organîzmayên tevlihev, wek metagenoma jîngehê, metagenoma mirov, hwd. Ew genomên mîkroorganîzmayên çandinî û neçandî dihewîne.Rêzkirina metagenomîk amûrek molekular e ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ku ji nimûneyên hawîrdorê têne derxistin, tê bikar anîn, ku di cûrbecûr û pirbûna cûreyan de, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora pêwendiyê bi faktorên jîngehê re agahdariya berfireh peyda dike.
Rawesta axaftevan:Platforma Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics amûrek molekular e ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ku ji nimûneyên hawîrdorê hatine derxistin, tê bikar anîn, ku agahdariya hûrgulî di pirrengî û pirbûna cureyan, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora têkildariyê bi faktorên jîngehê re, hwd. ji bo lêkolînên metagenomîk.Performansa wê ya berbiçav di dirêjahiya xwendinê de bi giranî analîza metagenomîkî ya jêrîn, nemaze kombûna metagenome zêde kir.Bi sûdwergirtina ji dirêjahiya xwendinê, lêkolîna metagenomîk a li ser bingeha Nanopore dikare li gorî metagenomîkên gulebaranê berhevkirina domdartir bi dest bixe.Hate weşandin ku metagenomîkên bingehîn ên Nanopore bi serfirazî genomên bakterî yên bêkêmasî û girtî ji mîkrobiomeyan hilberandine (Moss, EL, et.Nature Biotech, 2020)
Rawesta axaftevan:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Yekîneya li ser 16S û 18S rRNA ku hem herêmên pir parastî û hem jî yên hîper-guherbar dihewîne, şopa tiliya molekularî ya bêkêmasî ye ji bo naskirina organîzmayên prokaryotî û eukaryotî.Bi sûdwergirtina ji rêzgirtinê, ev amplikon dikarin li ser bingeha beşên parastî werin armanc kirin û deverên hîper-guhêrbar dikarin bi tevahî ji bo nasîna mîkrobial bêne destnîşan kirin û beşdarî lêkolînên ku analîza cihêrengiya mîkrobî, taksonomî, fîlogeny, hwd vedihewîne. Yek-molekulek rast-dem (SMRT ) rêzkirina platforma PacBio dihêle ku meriv xwendina dirêj a pir rast were bidestxistin, ku dikare amplikonên tev-dirêj (nêzîkî 1,5 Kb) veşêre.Nêrîna berfireh a qada genetîkî di nav bakterî an civata fungî de çareseriya di şîrovekirina celeban de pir zêde kir.
Rawesta axaftevan:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Rêzkirina amplikonê 16S/18S/ITS armanc dike ku fîlogeny, taksonomî, û pirbûna cureyan di civatek mîkrobialî de eşkere bike bi lêkolîna hilberên PCR-ê yên nîşankerên genetîkî yên malparêzî yên ku her du beşên pir guhezbar û hîperguhêrbar dihewîne.Danasîna van şopa tiliya molekularî ya bêkêmasî ji hêla Woeses et al, (1977) ve profîlkirina mîkrobiomê ya bê îzolekirinê hêz dike.Rêzkirina 16S (bakterî), 18S (fungî) û cîhêra transkrîpkirî ya navxweyî (ITS, fungî) dihêle ku hem celebên pir û hem jî celebên nadir û nenas bêne naskirin.Ev teknolojiyê di naskirina pêkhateya mîkrobial a cihêreng de li hawîrdorên cihêreng, wek devê mirovan, rûvî, feqî, hwd, bûye amûrek berfireh û sereke.
Rawesta axaftevan:Platforma Illumina NovaSeq
-
Ji nû ve Rêzkirina Tevahiya Genomê ya Bakterî û Fungal
Ji nû ve rêzikandina genomê ya bakterî û fungalî amûrek krîtîk e ji bo temamkirina genomên bakterî û fungî yên naskirî, û hem jî berhevkirina genomên pirjimar an nexşeya genomên zîndewerên nû.Ji bo afirandina genomên referansa rast, kirina nasnameya mîkrobial û lêkolînên din ên genomê yên berawirdî, rêzkirina tevaya genomên bakterî û fungî girîng e.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina Metatranscriptome
Rêzkirina metatranscriptome îfadeya genê ya mîkroban (hem eukaryot û prokaryotes) di nav hawîrdorên xwezayî de (ango ax, av, derya, fec û rûvî.) destnîşan dike. Bi taybetî, ev karûbar dihêle hûn profîla vegotina genê ya tevahî civakên mîkrobîkî yên tevlihev, analîza taksonomî bistînin. ji cureyan, analîza dewlemendkirina fonksiyonel a genên bi rengek cûda, û bêtir.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Genoma fungal
Biomarker Technologies li gorî armanca lêkolînê ya taybetî vekolînek genome, genomek baş û genoma pene-tevahî ya fungal peyda dike.Rêzkirina genomê, kombûn û annotasyona fonksiyonel dikare bi berhevkirina rêzikên nifşê pêşde + Rêzkirina nifşa sêyem were bidestxistin da ku bigihîje kombûna genomê ya asta bilind.Teknolojiya Hi-C jî dikare were bikar anîn da ku kombûna genomê di asta kromozomê de hêsantir bike.
Rawesta axaftevan:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Platforma Illumina NovaSeq
-
Bakterî Genoma Temamî
Biomarker Technologies karûbarê rêzgirtinê li ser avakirina genoma bêkêmasî ya bakteriyan bi valahiyek sifir peyda dike.Xebata sereke ya avakirina genom a bêkêmasî ya bakteriyan rêzgirtina nifşa sêyemîn, kombûn, annotasyona fonksiyonel û analîza biyoinformatîk a pêşkeftî ya ku armancên lêkolînê yên taybetî pêk tîne vedihewîne.Profîlek berfirehtir a genoma bakteriyan hêz dide eşkerekirina mekanîzmayên bingehîn ên di binê pêvajoyên wan ên biyolojîk de, ku di heman demê de dikare referansek hêja ji bo lêkolînên genomîk ên di celebên eukaryotî yên bilind de peyda bike.
Rawesta axaftevan:Nanopore PromethION P48 + Platforma Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
