-
Rêzkirina Immunoprecipitation Chromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq ji bo guheztina hîstone, faktorên veguheztinê, û proteînên din ên girêdayî DNA-yê profîlên genom-berfireh ên armancên DNA peyda dike.Ew hilbijartî ya immuno-barînê ya kromatînê (ChIP) ji bo vegerandina kompleksên proteîn-DNA-ya taybetî, bi hêza rêzgirtina nifşê pêşeroj (NGS) re ji bo rêzgirtina bilind-rêveber a ADN-ya ku hatî vegerandin hev dike.Wekî din, ji ber ku kompleksên proteîn-ADN-ê ji hucreyên zindî têne derxistin, cihên girêdanê dikarin di celeb û tevnên cûda yên hucreyê de, an jî di bin şert û mercên cûda de werin berhev kirin.Serlêdan ji rêziknameya transkrîpsiyonê bigire heya rêyên pêşkeftinê heya mekanîzmayên nexweşiyê û pê ve.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina bisulfîtê ya tevaya genomê
Methylation DNA di pozîsyona pêncemîn de di cytosine (5-mC) de bandorek bingehîn li ser vegotina genê û çalakiya hucreyî heye.Nimûneyên methylasyonê yên nenormal bi gelek şert û nexweşiyan re, wekî penceşêrê, hatine girêdan.WGBS bûye standarda zêr ji bo lêkolîna metilasyonê ya genomê ya bi çareseriya bingehîn.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Assay ji bo kromatîna Transposase-Gihîn bi Rêzkirina Rêjeya Bilind (ATAC-seq)
ATAC-seq ji bo analîzkirina gihîştina kromatînê ya li seranserê genomê, ku ji bo kontrolkirina epigenetîk a gerdûnî ya vegotina genê girîng e, rêbazek rêzgirtinê ya bilind-rêveber e.Ji hêla transposaza Tn5 ya hîperaktîf ve adapterên rêzgirtinê di nav deverên kromatîn ên vekirî de têne danîn.Piştî zêdekirina PCR, pirtûkxaneyek rêzgirtinê tê çêkirin.Hemî herêmên kromatînê yên vekirî dikarin di bin şertek cîh-dem-demê ya taybetî de werin bidestxistin, ne tenê bi malperên girêdanê yên faktorek veguheztinê, an herêmek hin guhezbar a hîstone re sînordarkirî ne.
-
Rêzkirina Bisulfitê ya Nûnertiya Kêmkirî (RRBS)
Lêkolîna methylasyonê ya DNA di lêkolîna nexweşiyê de her gav mijarek germ e, û ji nêz ve bi vegotina genê û taybetmendiyên feno-tîpîk re têkildar e.RRBS ji bo lêkolîna methylasyonê ya DNA rêbazek rast, bikêr û aborî ye.Dewlemendkirina herêmên promotor û girava CpG bi perçebûna enzîmatîk (Msp I), ku bi rêzgirtina Bisulfite re hevgirtî ye, tespîtkirina methylasyonê ya DNA-ya rezîliya bilind peyda dike.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
