-
Rêzkirina Amplicon PacBio-Tirêj 16S/18S/ITS
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) bi tecrûbeya salan ve di analîza projeya cihêrengiya mîkrobial de hatî pêşve xistin, ku analîza bingehîn a standardkirî û analîza kesane vedihewîne: analîza bingehîn naveroka analîza sereke ya lêkolîna mîkrobîkî ya heyî vedigire, naveroka analîzê dewlemend û berfireh e, û encamên analîzê di forma raporên projeyê de têne pêşkêş kirin;Naveroka analîzên kesane cihêreng e.Nimûne dikarin bêne hilbijartin û pîvan dikarin li gorî rapora analîza bingehîn û armanca lêkolînê bi nermî werin danîn, da ku daxwazên kesane bicîh bînin.Pergala xebitandinê ya Windows-ê, hêsan û bilez.
-
PacBio-Transkriptoma tevahî dirêj (ne-referans)
Daneyên rêzgirtina îsoformên Pacific Biosciences (PacBio) wekî têketinê digire, ev App dikare rêzikên transkriptê yên tev-dirêj (bêyî kombûnê) nas bike.Bi xêzkirina rêzikên tev-dirêj li dijî genoma referansê, transkrîpt dikare ji hêla genên naskirî, transkript, herêmên kodkirinê, hwd ve were xweşbîn kirin.Analîza hevbeş a bi daneya rêzgirtina transkrîptoma NGS re di asta transkrîptê de şîrovekirina berfirehtir û pîvandina rasttir di derbirînê de dike, ku bi giranî sûdê werdigire îfadeya cihêreng a jêrîn û analîza fonksiyonel.
-
Toolkits
BMKCloud platformek biyoinformatîk a pêşeng e ku ji bo bernameyên genomîk çareseriya yek-stop peyda dike, ku bi berfirehî ji hêla lêkolîneran ve di warên cihêreng de di nav de bijîjkî, çandinî, jîngeh, hwd. pê bawer e. , çavkaniyên komputerê, databasa giştî, qursên serhêl ên biyoinformtîk, hwd. BMKCloud xwedan amûrên biyoinformatîk ên cihêreng ên ku pir caran têne bikar anîn hene ku tê de annotasyona genê, amûrên genetîk ên pêşkeftî, ncRNA, kontrolkirina kalîteya daneyê, civandin, berhevkirin, derxistina daneyan, mutasyon, statîstîk, çêkerê jimaran, rêzik. analîz û hwd.
-
RNA biçûk
ARN-yên piçûk celebek ARN-ya kurt a ne-kodkirî ne ku dirêjahiya navînî 18-30 nt e, di nav de miRNA, siRNA û piRNA.Van RNAyên piçûk bi girseyî hatine ragihandin ku di pêvajoyên biyolojîkî yên cihêreng ên mîna hilweşandina mRNA, astengkirina wergerandinê, damezrandina heterokromatin, hwd. Platforma analîzê ya rêzgirtinê ji analîza standard û derxistina daneya pêşkeftî pêk tê.Li ser bingeha daneyên RNA-seq, analîza standard dikare nasname û pêşbîniya miRNA, pêşbîniya genê hedefa miRNA, şirovekirin û analîza vegotinê bi dest bixe.Analîzek pêşkeftî lêgerîn û derxistina miRNA-ya xwerû, hilberîna diagrama Venn, miRNA û avakirina tora genê armanc dike.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS platformek analîzê ya ji nû ve rêzikandina genomê ye, ku li ser bingeha ezmûna dewlemend a di Teknolojiyên Biomarker de hatî pêşve xistin.Vê platforma hêsan-karanîna hêsan dihêle ku bilez radestkirina xebatek analîzek yekbûyî bi tenê danîna çend parametreyên bingehîn, ku ji bo daneya rêzgirtina DNA ya ku hem ji platforma Illumina û hem jî ji platforma rêzgirtina BGI-yê hatî hilberandin, diguncîne.Vê platformê li ser servera hilberandina performansa bilind tête bicîh kirin, ku di demek pir tixûb de analîza daneya pir bikêr hêz dike.Kevirkirina daneya kesane li ser bingeha analîzên standard peyda dibe, di nav de pirsa genê mutated, sêwirana primer PCR, hwd.
-
mRNA (Çavkanî)
Transcriptome girêdana di navbera agahdariya genetîkî ya genomîk û proteoma fonksiyona biyolojîkî de ye.Rêzkirina asta transkripsiyonê awayê rêziknameya organîzmayan a herî girîng û herî berfireh e ku tê lêkolîn kirin.Rêzkirina transkrîptomê dikare di her kêliyek dem de an di bin her şert û mercî de, bi çareseriyek rast ji yek nukleotîdê re, transkrîptomê rêz bike. Ew dikare bi dînamîk asta transkrîpsiyona genê nîşan bide, bi hevdemî veguheztinên kêm û normal nas bike û bihejmêre, û agahdariya strukturel peyda bike. nimûneyên tîpên taybetî.
Heya nuha, teknolojiya rêzgirtina transkrîptomê bi berfirehî di agronomî, derman û warên din ên lêkolînê de, di nav de rêziknameya pêşkeftina heywan û nebatan, adaptasyona hawîrdorê, danûstendina belengaz, herêmîkirina genê, pêşkeftina genetîkî ya cûreyan û vedîtina nexweşiya tîmor û genetîkî bi berfirehî tête bikar anîn.
-
Metagenomics (NGS)
Ev platforma analîzê ji bo analîzkirina daneya metagenomîk a gulebaranê li ser bingeha ezmûna salan hatî çêkirin.Ew ji xebata yekbûyî pêk tê ku di nav wan de pêvajokirina daneyê, lêkolînên asta cûrbecûr, lêkolînên asta fonksiyona genê, binavkirina metagenome, hwd. Digel vê yekê, amûrên hilberandina daneya xwerû li ser xebata analîza standard, di nav de lêpirsîna gene û cureyan, hene. , mîhengkirina parametreyê, hilberîna jimareya kesane, hwd.
-
LncRNA
ARN-yên ne-kodkirî yên dirêj (lncRNA) celebek transkrîpsiyonên bi dirêjiya 200 nt dirêjtir in, ku nikarin proteînan kod bikin.Delîlên berhevkirî destnîşan dikin ku pirraniya lncRNA pir bikêr in.Teknolojiyên rêzgirtina-berbiçav û amûrên analîzkirina biyoinformatîk me hêz dide ku em rêzikên lncRNA û agahdariya cîhê bi bandortir eşkere bikin û me rê li ber vedîtina lncRNAyên bi fonksiyonên birêkûpêk ên girîng dikin.BMKCloud serbilind e ku ji xerîdarên me platforma analîzkirina rêza lncRNA peyda dike da ku bigihîje analîza lncRNA ya bilez, pêbawer û maqûl.
-
GWAS
Lêkolîna komeleya berfireh a genomê (GWAS) armanc dike ku celebên genetîkî (jenotip) yên ku bi taybetmendiyên taybetî (fenotip) re têkildar in nas bike.Lêkolînên GWA vekolînên nîşankerên genetîkî li seranserê genomê ya hejmareke mezin a kesan derbas dikin û bi analîzên statîstîkî ve di asta nifûsê de têkiliyên genotype-fenotip pêşbînî dikin.Veguheztina tevahiya genomê dikare bi potansiyel hemî cûreyên genetîkî kifş bike.Bi daneyên fenotîpîk re, GWAS dikare were pêvajo kirin da ku SNP, QTL û genên berendam ên têkildar bi fenotîpê nas bike, ku bi hêz pişta xwedan heywan / nebatên nûjen digire.SLAF stratejiyek birêkûpêkkirina genomê ya hêsankirî-xwe-pêşkeftî ye, ku nîşankerên belavbûyî yên genomê, SNP, kifş dike.Van SNP, wekî nîşankerên genetîkî yên molekulî, dikarin ji bo lêkolînên komeleyê yên bi taybetmendiyên armanckirî bêne pêvajoyê kirin.Ew di nasandina taybetmendiyên tevlihev ên cûrbecûr genetîkî de stratejiyek lêçûn-bandor e.
-
Nanopore Transcriptomics Full-length
Îzoformên alternatîf ên tevlihev û guhêrbar ên di organîzmayan de mekanîzmayên genetîkî yên girîng in ji bo birêkûpêkkirina vegotina genê û cihêrengiya proteînan.Nasnameya rast a strukturên transkriptê bingehek ji bo lêkolîna kûr a şêwazên rêziknameya vegotina genê ye.Platforma rêzgirtina Nanopore bi serfirazî xwendina transkrîptomîkî gihand asta isoformê.Ev platforma analîzê ji bo analîzkirina daneyên RNA-Seq ku li ser platforma Nanopore hatî çêkirin li ser bingeha genoma referansê hatî çêkirin, ku hem di asta genê û hem jî di asta transkriptê de analîzên kalîteyî û jimareyî bi dest dixe.
-
circ-RNA
ARN-ya dorvekî (circRNA) cureyek RNA-ya ne-kodker e, ku di van demên dawîn de tê dîtin ku rolek girîng di torên rêkûpêk ên ku di pêşveçûnê de ne, berxwedana hawirdorê, hwd. de dilîze. Ji molekulên RNA yên rêzikî, mînak mRNA, lncRNA, 3' û 5'. dawiya circRNA bi hev re têne girêdan da ku avahiyek dorpêk ava bikin, ku wan ji digestina exonuclease xilas dike û ji piraniya ARNyên xêzik aramtir in.CircRNA di rêkûpêkkirina vegotina genê de xwedî fonksiyonên cihêreng hat dîtin.CircRNA dikare wekî ceRNA, ku miRNA bi pêşbazî ve girêdide, ku wekî miRNA sponge tê zanîn, pêk bîne.Platforma analîzê ya rêziknameya CircRNA bi celebên din ên molekulên RNA re hêz dide avahîsaziya circRNA û analîza vegotinê, pêşbîniya armanc û analîza hevbeş.
-
BSA
Platforma Analîza Segregant a Bulked ji analîza standard yek-gavekî û analîza pêşkeftî ya bi mîhenga pîvana xwerû pêk tê.BSA teknolojiyek e ku tê bikar anîn da ku zû nîşankerên genetîkî yên têkildar bi fenotîpê nas bike.Xebata sereke ya BSA dihewîne: 1. Hilbijartina du komên kesên xwedî fenotîpên pir dijber;2. ADN, RNA an SLAF-seq (Ji hêla Biomarker ve hatî pêşve xistin) ya hemî kesan berhev dike da ku du beşên DNA çêbike;3. Tesbîtkirina rêzikên cihêreng ên li hember genoma referansê an di navberê de, 4. Pêşbînkirina herêmên bijarte yên girêdayî bi algorîtmaya ED û SNP-index;5. Analîza fonksiyonel û dewlemendkirina li ser genên li herêmên berendam, hwd. Di daneyan de kanzayên pêşkeftî, di nav de nîşankerên genetîkî û sêwirana pêşîn jî hene.
