Nûçe

Zêdekirina hêmana veguhezbar (TE) wekî hêzek ajotinê ku navbeynkariya mezinbûna genom û pêşkeftinê dike hate nas kirin, lê encamên ji bo şekildana mîmariya genomîk a 3D bi gelemperî di nebatan de nenas dimîne.Li vir, em civînên genom-pola referansê ji bo sê celebên pembû ku di mezinahiya genomê de sê qat in, angoGossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2), ûG. raimondii(D5), Oxford Nanopore Technologies bikar tîne.Analîzên genomê yên berawirdî hûrguliyên zêdekirina TE-ya-taybetî ya rêzê ku beşdarî cûdahiyên mezinahiya genomê dibe (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) belge dikin, û naveroka genê ya bi nisbeten parastî û têkiliyên hevrêziyê di nav genomeyan de destnîşan dikin.Me dît ku nêzîkê 17% ji genên syntenîk di navbera beşên çalak ("A") û neçalak ("B") de guherîna statûya kromatînê nîşan didin, û zêdekirina TE bi zêdebûna rêjeya beşa A li herêmên genê re têkildar bû (~ 7,000 gen. ) di K2 û A2 de li gorî D5.Tenê 42% ji sînorên topoolojîkî yên têkildar (TAD) di nav sê genoman de hatine parastin.Daneyên me li dû damezrandina sînorên TAD-ê yên rêzê-taybetî zêdekirina vê dawîyê ya TE-yê têkildar dike.Vê lêkolînê ronahiyê dide rola berfirehbûna genomê ya bi navbeynkariya transposonê di pêşkeftina strukturên kromatînê yên rêza bilind de di nebatan de.