Jenotîpkirina bilind, nemaze li ser nifûsa mezin, di lêkolînên komeleya genetîkî de gavek bingehîn e, ku bingehek genetîkî ji bo vedîtina genê fonksiyonel, analîza pêşkeftinê, hwd. ) ji bo kêmkirina lêçûna rêzkirinê ya her nimûneyê tête destnîşan kirin, di heman demê de ku karbidestiya maqûl li ser vedîtina nîşankera genetîkî biparêze.Ev bi gelemperî bi derxistina perçeya sînordarkirinê di nav rêza mezinahiya diyarkirî de, ku jê re pirtûkxaneya nûneriya kêmkirî (RRL) tê binav kirin, tê bidestxistin.Rêzkirina perçeyên zêdekirî yên taybetî-locus (SLAF-Seq) stratejiyek xwe-pêşkeftî ye ji bo vedîtina de novo SNP û genotipkirina SNP ya nifûsa mezin.
Xebata teknîkî
SLAF vs Rêbazên RRL yên heyî
Avantajên SLAF
Karbidestiya vedîtina nîşankera genetîkî ya bilind- Bi teknolojiya rêziknameya bilind-rêveberê re, SLAF-Seq dikaribû bi sed hezaran tagên ku di hundurê tevahî genomê de hatine vedîtin bi dest bixe da ku daxwaziya projeyên lêkolînê yên cihêreng, bi an bi genomek referansê re bicîh bîne.
Sêwirana ceribandî ya xwerû û maqûl- Ji bo armanc an celebên lêkolînê yên cihêreng, stratejiyên cudahiyê yên enzîmatîk hene, di nav de vejandina yek-enzîm, du-enzîm û pir-enzîm.Stratejiya digestionê dê di silico de pêş-nirxandibe da ku sêwirana enzîmê ya çêtirîn piştrast bike.
Di vejandina enzymatîk de berberiya bilind- Xwarina enzîmatîk a ji berê ve hatî sêwirandin SLAF-ên yeksantir li ser kromozomê belavkirî peyda dike.Berhevkirina perçeyê bi bandor dikare ji% 95 bigihîje.
Dûr rêzgirtina dubare- Di daneyên SLAF-Seq de rêjeya rêza dûbarekirî ji %5 kêmtir dibe, nemaze di celebên ku hêmanên xwedan astek bilind in, wek genim, merî, hwd.
Pêvajoya xebata biyoinformatîk ya bixwe-pêşveçû- BMK karûbarek biyoinformatîk a yekbûyî ya ku ji teknolojiya SLAF-Seq re tê sepandin pêşxist da ku pêbawerî û rastbûna hilbera dawîn misoger bike.
Serlêdana SLAF
Nexşeya girêdana genetîkî
Çêkirina nexşeya genetîkî ya bi tîrêjiya bilind û naskirina cîhên ku taybetmendiyên cûrbecûr ên kulîlkê di Chrysanthemum de kontrol dikin (Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Kovar: Lêkolîna Baxçevaniyê Weşandin: 2020.7
GWAS
Nasnameya genek berendamê ku bi naveroka isofavone ve girêdayî ye di tovên soya de bi karanîna komeleya genom-berfireh û nexşeya girêdanê.
Kovar: Kovara Plant Weşandin: 2020.08
Genetics Evolutionary
Analîzkirina genomîk a nifûsê û kombûna de novo eslê birincê zirav wekî lîstikek pêşveçûnê eşkere dike.
Kovar: Plant Molecular Weşandin: 2019.5
Analîza Veqetandî ya Mezin (BSA)
GmST1, ku sulfotransferase şîfre dike, berxwedanê dide çelên virusê mozaîk ên soya G2 û G3.
Kovar: Nebat, Xane & Jîngeh Weşandin: 2021.04
Balkêşî
Sun X, Liu D, Zhang X, et al.SLAF-Seq: rêbazek bikêrhatî ya vedîtin û genotîpkirina de novo SNP-ya mezin a ku bi karanîna rêzika berbi bilind[J] bikar tîne.Plos yek, 2013, 8 (3): e58700
Song X, Xu Y, Gao K, et al.Çêkirina nexşeya genetîkî ya bi tîrêjiya bilind û naskirina cîhên ku taybetmendiyên cûrbecûr kulîlk li Chrysanthemum (Chrysanthemum × morifolium Ramat.) kontrol dikin.Hortic Res.2020; 7:108.
Wu D, Li D, Zhao X, et al.Nasnameya genek berendamê ku bi naveroka isoflavone ve di tovên soyê de têkildar e bi karanîna komeleya genomê û nexşeya girêdanê.Plant J. 2020;104 (4): 950-963.
Sun J, Ma D, Tang L, et al.Analîza Genomîk a Nifûsê û Civîna De Novo Orjînala Weedy Rice wekî Lîstikek Pêşkeftinî eşkere dike.Mol Plant.2019; 12 (5): 632-647.Mol Plant.2018;11 (11): 1360-1376.
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al.GmST1, ku sulfotransferase kod dike, berxwedanê li hember cûreyên virusê mozaîka soya G2 û G3 dide.Hawirdora Hucreya Nebatê.2021; 10.1111 / pce.14066
Dema şandinê: Jan-04-2022