-
Rêzkirina Metagenomîk (NGS)
Metagenom tê wateya berhevoka maddeya genetîkî ya tevayî ya civatek organîzmayên tevlihev, wek metagenoma jîngehê, metagenoma mirovan, hwd. Ew genomên mîkroorganîzmayên çandinî û neçandî dihewîne.Rêzkirina metagenomîk amûrek molekularî ye ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ji nimûneyên hawîrdorê hatine derxistin tê bikar anîn, ku di pirrengî û pirbûna cureyan, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora pêwendiyê bi faktorên jîngehê re agahdariya berfireh peyda dike.
Rawesta axaftevan:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics amûrek molekular e ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ku ji nimûneyên hawîrdorê hatine derxistin, tê bikar anîn, ku agahdariya hûrgulî di pirrengî û pirbûna cureyan de, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora pêwendiyê bi faktorên jîngehê re, hwd. ji bo lêkolînên metagenomîk.Performansa wê ya berbiçav di dirêjahiya xwendinê de bi giranî analîza metagenomîkî ya jêrîn, nemaze kombûna metagenome zêde kir.Bi sûdwergirtina ji dirêjahiya xwendinê, lêkolîna metagenomîk a li ser bingeha Nanopore dikare li gorî metagenomîkên gulebaranê berhevkirina domdartir bi dest bixe.Hate weşandin ku metagenomîkên bingehîn ên Nanopore bi serfirazî genomên bakterî yên bêkêmasî û girtî ji mîkrobiomeyan hilberandine (Moss, EL, et.Nature Biotech, 2020)
Rawesta axaftevan:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Yekîneya li ser 16S û 18S rRNA ku hem herêmên pir parastî û hem jî yên hîper-guhêrbar dihewîne, şopa tiliya molekularî ya bêkêmasî ye ji bo naskirina organîzmayên prokaryotî û eukaryotî.Bi sûdwergirtina ji rêzgirtinê, ev amplikon dikarin li ser bingeha beşên parastî werin armanc kirin û deverên hîper-guhêrbar bi tevahî ji bo nasîna mîkrobial têne destnîşan kirin ku beşdarî lêkolînên ku analîza cihêrengiya mîkrobial, taksonomî, fîlogeny, hwd vedihewîne. Di dema rast yek-molekûl de (SMRT ) rêzkirina platforma PacBio dihêle ku meriv xwendina dirêj a pir rast were bidestxistin, ku dikare amplikonên tev-dirêj (nêzîkî 1,5 Kb) veşêre.Nêrîna berfireh a qada genetîkî di nav civata bakterî an fungî de çareseriya di annotasyona cureyan de pir zêde kir.
Rawesta axaftevan:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Rêzkirina amplikonê 16S/18S/ITS bi lêkolîna hilberên PCR-ê yên nîşankerên genetîkî yên ku hem beşên pir guhezbar û hem jî hîperguharbar vedihewîne, armanc dike ku fîlogeny, taksonomî, û pirbûna cureyan di civatek mîkrobialî de eşkere bike.Danasîna van şopa tiliya molekular a bêkêmasî ji hêla Woeses et al, (1977) ve profîlkirina mîkrobiomê ya bê îzolekirinê hêz dike.Rêzkirina 16S (bakterî), 18S (fungî) û cîhê transkrîpkirî yê hundurîn (ITS, fungî) dihêle ku hem celebên pir û hem jî celebên nadir û nenas bêne naskirin.Ev teknolojiyê di naskirina pêkhateya mîkrobial a cihêreng de di hawîrdorên cihêreng de, wek devê mirovan, rûvî, feq, hwd, bûye amûrek berfireh û sereke.
Rawesta axaftevan:Illumina NovaSeq6000
-
Ji nû ve rêzgirtina genomê ya bakterî û fungal
Ji nû ve rêzikandina genomê ya bakterî û fungalî amûrek krîtîk e ji bo temamkirina genomên bakterî û fungî yên naskirî, û hem jî berhevkirina genomên pirjimar an nexşeya genomên zîndewerên nû.Ji bo afirandina genomên referansa rast, ji bo çêkirina nasnameya mîkrobial û lêkolînên din ên genomê yên berawirdî, rêzkirina tevaya genomên bakterî û fungî girîng e.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Genoma fungal
Biomarker Technologies li gorî armanca lêkolînê ya taybetî vekolînek genome, genomek xweş û genoma pene-tevahî ya fungal peyda dike.Rêzkirina genomê, kombûn û annotasyona fonksiyonel dikare bi berhevkirina rêzikên nifşê pêşde + Rêzkirina nifşa sêyem were bidestxistin da ku bigihîje kombûna genomê ya asta bilind.Teknolojiya Hi-C jî dikare were bikar anîn da ku kombûna genomê di asta kromozomê de hêsantir bike.
Rawesta axaftevan:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakterî Genoma Temamî
Biomarker Technologies li ser avakirina genoma bêkêmasî ya bakteriyan bi valahiya sifir karûbarê rêzgirtinê peyda dike.Xebata sereke ya avakirina genom a bêkêmasî ya bakteriyan rêzgirtina nifşa sêyemîn, kombûn, annotasyona fonksiyonel û analîza biyoinformatîk a pêşkeftî ya ku armancên lêkolînê yên taybetî pêk tîne vedihewîne.Profîlkirinek berfirehtir a genoma bakteriyan hêz dide eşkerekirina mekanîzmayên bingehîn ên di binê pêvajoyên wan ên biyolojîk de, ku di heman demê de dikare referansek hêja ji bo lêkolînên genomîk ên di celebên eukaryotî yên bilind de peyda bike.
Rawesta axaftevan:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
