-
Plant / Animal De novo Genome Rêzkirin
De novorêzkirin bi nebûna genomeke referansê ve avakirina tevaya genomê cureyekî bi bikaranîna teknolojiyên rêzgirtinê, mînak PacBio, Nanopore, NGS, hwd.Pêşkeftina berbiçav di dirêjahiya xwendinê ya teknolojiyên rêzgirtinê yên nifşa sêyem de di berhevkirina genomên tevlihev de firsendên nû bi xwe re aniye, wekî yên bi heterozîgosîteya bilind, rêjeya zêde ya herêmên dubarekirî, polîploîd, hwd. Çareserkirina hêmanên dubare, herêmên bi naverokên GC yên nenormal û deverên din ên pir tevlihev.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Meclîsa Genome ya bingehîn a Hi-C
Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina veavakirina kromozomê hatî çêkirin bi berhevkirina danûstendinên li ser bingeha nêzikbûnê û rêzgirtina berbi-bilind ve hatî çêkirin.Tê bawer kirin ku tundiya van têkiliyan bi dûrbûna laşî ya li ser kromozoman re bi neyînî ve girêdayî ye.Ji ber vê yekê, daneyên Hi-C dikare kombûn, rêzkirin û rêgezkirina rêzikên berhevkirî yên di pêşnumayek genom de rêve bike û wan li ser hejmareke diyar kromozoman girêbide.Di nebûna nexşeya genetîkî ya li ser nifûsê de, ev teknolojiyê kombûnek genom a asta kromozomê hêz dike.Her genomek yekane pêdivî bi Hi-C heye.
Platform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetics Evolutionary
Genetîka Pêşveçûyî karûbarek rêzgirtinê ya pakkirî ye ku ji bo peydakirina şiroveyek berfereh li ser agahdariya pêşveçûnê ya materyalên diyarkirî yên li ser bingeha guheztinên genetîkî, di nav de SNP, InDels, SVs û CNV, hatî çêkirin.Ew hemî analîzên bingehîn ên ku ji bo danasîna guheztinên evolusyonê û taybetmendiyên genetîkî yên nifûsê hewce dike peyda dike, wek strukturên nifûsê, cihêrengiya genetîkî, têkiliyên fîlogenyiyê, hwd. Di heman demê de lêkolînên li ser herikîna genê jî vedihewîne, ku texmîna mezinahiya nifûsa bi bandor, dema cihêbûnê hêz dike.
-
Genomîka Berawirdî
Genomîka berawirdî bi rastî tê wateya berawirdkirina rêzikên genom û strukturên celebên cihêreng.Armanca vê dîsîplînê eşkerekirina pêşkeftina celebê, fonksiyona genê, mekanîzmaya rêziknameya genê di asta genomê de ye bi destnîşankirina strukturên rêzikan û hêmanên ku di nav cûreyên cûda de parastin an cihêreng kirin.Lêkolîna genomîk a berawirdî ya tîpîk analîzên di malbata genê de, pêşkeftina pêşkeftinê, dubarekirina tevahî genom, zexta bijartî, hwd.
-
Analîza Segregant a mezin
Analîza veqetandî ya girseyî (BSA) teknolojiyek e ku tê bikar anîn da ku bi lez nîşankerên genetîkî yên têkildar bi fenotîpê nas bike.Xebata sereke ya BSA di nav xwe de hilbijartina du komên kesan bi fenotîpên zehf dijber vedihewîne, DNAya hemî kesan berhev dike da ku du beşên DNA çêbike, rêzikên cûda yên di navbera du hewzan de nas bike.Ev teknîk bi berfirehî ji bo destnîşankirina nîşankerên genetîkî yên ku bi genên armanckirî yên di genomên nebatî/heywanan de bi hêz ve girêdayî ne, hatî bikar anîn.
