● Ji bo armancên lêkolînê yên cihêreng stratejiyên rêzgirtinê hene
● Di kombûna genomê ya fungî de bi zêdeyî 10,000 genomên pene-temam hatine civandin.
● Tîma piştevaniya teknîkî ya piştî firotanê ya profesyonel ku hewcedariyên lêkolînê yên taybetî pêk tîne.
Xizmetkar | Stratejiya Sequencing | Quality garantîkirin | Dema zivirîna texmînkirî |
Nexşeya baş a fungal | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 rojên xebatê |
PacBio HiFi 30X | |||
Nexşeya pênûsa fungal-temam | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Rêjeya girêdana kromozomê > 90% | 45 rojên xebatê |
● Kontrolkirina kalîteya daneya xav
● Meclîsa Genome
● Analîzkirina pêkhateya Genome
● Şîrovekirina fonksiyona genê
● Analîzên genomîkî yên berawirdî
BoDerxistina DNA:
Tîpa Nimûne | Biha | Lisersekinî | Paqijiyê |
Derxistina DNA | > 1,2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Ji bo nimûneyên tevnê:
Tîpa nimûne | Tedawiya nimûneya pêşniyar kirin | Sample hilanînê û şandin |
Fungus Unicellular | Di bin mîkroskopê de hevîrtirşkê bişopînin û di qonaxa xwe ya berbiçav de berhev bikin Çandiniyê (ku bi qasî 3-4,5e9 şan tê de hene) veguherînin nav 1,5 an 2 ml eppendorf.(Li ser berfê bimîne) Li boriyê 1 hûrdeman di 14000 g de santrîfuj bikin da ku bakteriyan berhev bikin û bi baldarî supernatant jê bikin. Lûlikê bixin û bakteriyan di nîtrojena şil de herî kêm 1-3 saetan bicemidin.Tûyê di sarincokê de -80 ℃ hilînin. | Nimûneyan di nîtrojena şil de 3-4 demjimêran bicemidînin û di nîtrojena şil de an -80 derece ji bo veqetandina demdirêj hilînin.Veguheztina nimûneyê bi qeşa hişk hewce ye. |
Macro Fungus | Tîrêj di qonaxa mezinbûna çalak de tê pêşniyar kirin. Tevlihê bi ava bê endotoksîn bişon, dûv re 70% etonal. Nimûneyê di cryo-tubeyan de hilînin. |
1.Diagrama Circos li ser pêkhateyên genomî yên fungal
2.Analîzasyona genomîk a berawirdî: Dara Fîlojenetîkî