Rawesta axaftevan | Rêzkirin Mode | Applications |
Sîstema Illumina Nova | SE50 PE50 PE150 PE250 | 1. Bi lez û bez rêza genomên tevayî 2. Zêde bikin da ku herêmên armanc bi kûrahî rêz bikin 3. Rêzkirina RNA-yê (RNA-Seq) bikar bînin da ku guhertoyên nû yên RNA-yê û cîhên lihevkirinê kifş bikin, an jî mRNA-yan ji bo analîza vegotina genê bihejmêrin. 4. Faktorên epigenetîk ên wekî metilasyona DNA-ya genomê û danûstendinên DNA-proteîn analîz bikin 5. Nimûneyên penceşêrê rêz bikin da ku guhertoyên somatîk ên nadir, binklonên tumor, û bêtir lêkolîna cihêrengiya mîkrobîkî li mirovan an jîngehê bikin. |
● Tecrûbeya berfireh li ser platforma rêzkirina Illumina bi hezaran projeyên girtî yên bi celebên cihêreng.
● Pêvajoya rêzgirtina gihîştî bi dema zivirîna kurt.
● Karûbarên analîza biyoinformatîk ên jêrîn temam bikin.
● Pergala kontrolkirina kalîteyê ya hişk: standarda hişk a QC ya daneyên rêzkirinê.
Platforma rêzgirtinê & Stratejiya rêzgirtinê | Mîqdara daneyê |
Lisersekinî
| Bend | Biha | Encama QC |
Sîstema Novaseq, cot-end 150bp | X≤30Gb | ≥1ng/μl | ≥20 μl | ≥20ng | Xwende |
30Gb <X≤100Gb | ≥1ng/μl | ≥25 μl | ≥30ng | ||
X> 100 Gb | ≥2ng/μl | ≥25 μl | ≥50ng |
Ji bilî konsantre û mîqdara giştî, nexşeyek lûtkeya maqûl jî hewce ye.
Rawesta axaftevan
|
Lisersekinî
| Bend | Encama QC |
HiseqXten | ≥2.5nM | ≥20 μL | Xwende |
NovaSeq 6000 S4 | ≥2nM | ≥30 μL | |
NovaSeg 6000 SP | ≥2nM | ≥30 μL |
Nirxandina Kalîteya Daneyên Nimûneya RNA
Tablo 1. Statîstîkên li ser daneya rêzgirtinê.
Nasnameya Nimûne | BMKID | Raw dixwîne | Daneyên xav (bp) | Xwendinên paqij (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
Wêne 1. Dabeşkirina kalîteyê bi xwendinên di her nimûneyê de
Wêne 2. Dabeşkirina naveroka bingehîn
Wêne 3. Dabeşkirina naveroka xwendinê di daneheva rêzgirtinê de