Products

*Encamên demo ku li vir têne xuyang kirin hemî ji genomên ku bi Biomarker Technologies re hatine weşandin ne

1.LTR Texmîna wextê têxe: Reqemê di demên têketina LTR-RT de di genoma nîsk a Weining de, li gorî celebên din, dabeşek bimodal ya bêhempa nîşan dide.Lûtkeya herî dawî li dora 0,5 mîlyon sal berê xuya bû.

Li Guang et al.,Genetics Nature, 2021

2.Fylogeny û analîza malbata genê ya li ser kayote (Sechium edule): Bi analîzkirina chayote û 13 cureyên din ên girêdayî di malbata genê de, hate dîtin ku Chayote herî nêzik bi gûza maran (Trichosanthes anguina) ve girêdayî ye.Chayote ku li dora 27-45 Mya ji goştê marê hatî çêkirin û tevahî dubendiya genomê (WGD) li chayote di 25±4 Mya de hate dîtin, ku ev bûyera sêyemîn a WGD ye di cucuibitaceae de.

Fu A et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

3.Analîzasyona Synteny: Hin genên girêdayî phytohormones di pêşveçûna fêkiyan de di chayote, snake gurê û squash de hatin dîtin.Têkiliya di navbera chayote û squash de ji ya di navbera chayote û gurê mar de hinekî zêdetir e.

Fu A et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

4.Analîzkirina malbata genê: zengînkirina KEGG li ser berfirehbûn û girêbesta malbata genê di genomên G.thurberi û G.davidsonii de destnîşan kir ku biosenteza steroîdan û genên girêdayî biosenteza brassinosteroid berfireh bûne.

Yang Z et al.,BMC Biology, 2021

5.Analîzasyona dubarekirina genomê ya tevahî: Analîzkirina belavkirina 4DTV û Ks tevahî bûyera dubarekirina genomê nîşan dide.Lûtkeyên hundurîn bûyerên dubarebûnê nîşan didin.Lûtkeya navçewan bûyerên curebûnê nîşan didin.Analîzê destnîşan kir ku li gorî sê celebên din ên ku ji nêz ve girêdayî ne, O. europaea di van demên dawî de di nav dubendiyek genî ya mezin re derbas bû.

Rao G et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

BMK Case

Gula bê kulm: nihêrînên genomîk ên bi adaptasyona şilbûnê ve girêdayî ne

Weşandin: Review Science Neteweyî, 2021

Stratejiya rêzgirtinê:

'Basye'sThornless' (R.Wichurainan) genom:
Approx.93 X PacBio + nêzîkî.90 X Nanopore + 267 X Illumina

Encamên sereke

1.High quality R.wichuraiana genome bi karanîna teknîkên rêzgirtinê yên dirêj-xwende hate çêkirin, ku kombûnek 530.07 Mb derdixe (Qebala genomê ya texmînkirî ji hêla sîtometrîya herikînê ve bi qasî 525.9 Mb û ji hêla lêkolîna genomê ve 525.5 bû. Heterozygosity dora 1.03% bû.Pûana texmînkirî ya BUSCO% 93,9 bû.Bi berhevdana bi "Old blush" (haploOB), kalîte û temamiya vê genomê ji hêla rastbûna bingehek yek-bingeh û indexa kombûna LTR (LAI=20.03) ve hate pejirandin.Genoma R.wichuraiana 32,674 genên kodkirina proteînan dihewîne.

2.Analîzasyona hevpar a pir-omîk, ku ji genomîka berawirdî, transkriptomîk, analîza QTL ya nifûsa genetîkî pêk tê, cûrbecûr girîng di navbera R. wichuraiana û Rosa chinensis de eşkere kir.Di heman demê de, guhertoya vegotina genên têkildar di QTL de dibe ku bi şêwaza stûnê ya stûnê re têkildar be.

Analîzên genomîk ên berawirdî di navbera Basye;s Thornless û Rosa chinensis de, tevî analîza synteny, koma malbata genê, analîza berfirehbûn û berhevkirinê, hejmareke mezin ji guhertoyên ku bi taybetmendiyên girîng ên gulan re têkildar in eşkere kirin.Berfirehbûna bêhempa ya di malbata genê NAC û FAR1/FRS de pir gengaz bû ku bi berxwedana li dijî deqê reş re têkildar be.

Zhong, M., et al."Gulê bê çîçek: nihêrînên genomîkî bi adaptasyona şilbûnê ve girêdayî ne"Review Science Neteweyî, 2021;, nwab092.