Analîza Segregant a mezin
Avantajên Service
Takagi et al., Kovara nebatê, 2013
● Cihkirina rast: Bi 30+30 heta 200+200 kesan re tevhevkirina girseyan ji bo kêmkirina dengê paşîn;Pêşbîniya herêma namzedê ne-sînonîm-based mutatantan.
● Analîzek berfereh: Annotasyona fonksiyona genê ya berendamê kûr, di nav de NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, hwd.
● Dema Vegera Zûtir: Di nav 45 rojên xebatê de herêmîkirina genê bilez.
● Tecrûbeya berfereh: BMK di bi hezaran taybetmendiyan de cih girtiye, cûrbecûr cûrbecûr ên wekî çandinî, hilberên avê, daristan, kulîlk, fêkî, hwd.
Specifications Service
Gelî:
Veqetandina dûndana dêûbavan bi fenotîpên dijber.
Mînak nebatên F2, Backcrossing (BC), Rêza xwemalî ya Rekombînant (RIL)
Tevlihevkirina hewzê
Ji bo taybetmendiyên kalîteyê: 30 heta 50 kes (kêmtirîn 20) / pir
Ji bo tratisên mîqdar: 5% heya 10% kesên ku di tevahiya nifûsê de her du fenotîpên tund hene (kêmtirîn 30+30).
Kûrahiya rêzika pêşniyarkirî
Bi kêmanî 20X/ dêûbav û 1X/ferdekî nesla (mînak ji bo hewza tevhevkirina neviyên 30+30 kesan, kûrahiya rêzkirinê dê ji her mezinekê 30X be)
Analîzên Bioinformatics
● Resequencekirina tevaya genomê
● Pêvajoya daneyê
● SNP/Indel bang dike
● Dîtina herêma namzedê
● Şîrovekirina fonksiyona genê namzet
Sample Requirements û Delivery
Pêdiviyên Nimûne:
Nukleotîd:
| Nimûneya gDNA | Tissue nimûne |
| Têkçûn: ≥30 ng/μl | Nebat: 1-2 g |
| Mîqdar: ≥2 μg (Hejd ≥15 μl) | Heywan: 0,5-1 g |
| Paqijî: OD260/280= 1.6-2.5 | Xwîna tevahî: 1,5 ml |
Xizmeta Kar Herikîna
Design Experiment
Sample delivery
Derxistina RNA
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
1.Bingeha analîzkirina komeleyê li ser Dûrahiya Euclidean (ED) ji bo destnîşankirina herêma berendam.Di wêneya jêrîn de
X-ax: Hejmara kromozomê;Her xal nirxek ED ya SNP-ê temsîl dike.Xeta Reş bi nirxa ED ya pêgirtî re têkildar e.Nirxa ED ya bilindtir têkiliyek girîngtir di navbera malper û fenotîpê de destnîşan dike.Xeta xezala sor sînorê têkiliyek girîng nîşan dide.
2.Association analysis li ser bingeha no SNP-index
X-ax: Hejmara kromozomê;Her xal nirxa SNP-indeksê nîşan dide.Xeta reş ji bo nirxa îndeksa SNP-ê ya pêgirtî radiweste.Nirx çi qas mezin be, ew qas girîngtir e.
BMK Case
Taybetmendiya mîqdar-bandora sereke cihê Fnl7.1 proteînek embrîyogeneza dereng a ku bi dirêjahiya stûyê fêkî ve di xiyar de ye kod dike.
Weşandin: Plant Biotechnology Journal, 2020
Stratejiya rêzgirtinê:
Dêûbav (Jin5-508, YN): Ji bo 34× û 20× veguhestina tevahiya genomê.
Hewzên DNA (50 stûyê dirêj û 50 stûyê kurt): Ji bo 61× û 52× dubarekirin
Encamên sereke
Di vê lêkolînê de, veqetandina nifûsa (F2 û F2: 3) bi derbaskirina xeta xiyarê stûyê dirêj Jin5-508 û YN-ya stûyê kurt hate afirandin.Du hewzên DNA ji hêla 50 kesên stûyê dirêj û 50 kesên stûyê kin ve hatine çêkirin.QTL-bandora sereke li ser Chr07 ji hêla analîza BSA û nexşeya kevneşopî ya QTL ve hate nas kirin.Navçeya berendam ji hêla nexşeya xweş, pîvandina derbirrîna genê û ceribandinên transgenîkî ve, ku gena sereke di kontrolkirina dirêjahiya stûyê de, CsFnl7.1, eşkere kir, bêtir hate teng kirin.Wekî din, polîmorfîzma li herêma pêşverû ya CsFnl7.1 hate dîtin ku bi vegotina têkildar re têkildar e.Zêdetir analîzên fîlogenetîkî pêşniyar kir ku cîhê Fnl7.1 pir îhtîmal e ku ji Hindistanê were.
 Nexşeya QTL di analîza BSA de ji bo naskirina herêma berendamê ku bi dirêjahiya stûyê xiyar ve girêdayî ye |  Profîlên LOD-ê yên QTL-ya dirêjahiya stûyê xiyar li ser Chr07 hatine nas kirin |
Xu, X., et al."Taybetmendiya mîqdar-bandora sereke cihê Fnl7.1 proteînek embrîyogeneza dereng a ku bi dirêjahiya stûyê fêkiyê di xiyar de ve girêdayî ye kod dike."Kovara Biyoteknolojiya Nebatê 18.7 (2020).
