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전장 mRNA 시퀀싱-나노포어
RNA 시퀀싱은 포괄적인 전사체 분석을 위한 귀중한 도구였습니다.의심할 여지 없이, 전통적인 짧은 읽기 시퀀싱은 여기에서 수많은 중요한 발전을 이루었습니다.그럼에도 불구하고 전장 동형 식별, 정량화, PCR 편향에 한계가 있는 경우가 많습니다.
Nanopore 시퀀싱은 뉴클레오티드가 DNA 합성 없이 직접 판독되고 수십 킬로베이스에서 긴 판독을 생성한다는 점에서 다른 시퀀싱 플랫폼과 구별됩니다.이를 통해 전체 길이의 성적표를 가로질러 직접 판독할 수 있고 isoform 수준 연구의 문제를 해결할 수 있습니다.
플랫폼:나노포어 프로메션
도서관:cDNA-PCR
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De novo 전장 전사체 시퀀싱 -PacBio
드 노보전장 전사체 시퀀싱, 라고도 함드 노보Iso-Seq는 읽기 길이에서 PacBio 시퀀서의 장점을 활용하여 중단 없이 전체 길이의 cDNA 분자를 시퀀싱할 수 있습니다.이것은 전사 어셈블리 단계에서 생성된 오류를 완전히 방지하고 isoform 수준 해상도로 unigene 세트를 구성합니다.이 unigene 세트는 transcriptome 수준에서 "참조 게놈"으로 강력한 유전 정보를 제공합니다.또한 이 서비스는 차세대 시퀀싱 데이터와 결합하여 이소폼 수준 발현의 정확한 정량화를 지원합니다.
플랫폼: PacBio Sequel II라이브러리: SMRT 벨 라이브러리 -
진핵생물 mRNA 시퀀싱-Illumina
mRNA 시퀀싱은 특정 조건에서 세포에서 전사된 모든 mRNA의 프로파일링을 가능하게 합니다.특정 생물학적 과정의 유전자 발현 프로필, 유전자 구조 및 분자 메커니즘을 밝히는 강력한 기술입니다.현재까지 mRNA 시퀀싱은 기초 연구, 임상 진단, 약물 개발 등에 널리 사용되었습니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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비참조 기반 mRNA 시퀀싱-Illumina
mRNA 염기서열분석은 NGS(Next Generation Sequencing Technique)를 채택하여 일부 특수 기능이 활성화되는 특정 기간에 전령 RNA(mRNA) 형태의 진핵생물을 포획합니다.가장 긴 스플라이싱된 전사체를 'Unigene'이라고 하며 후속 분석을 위한 참조 서열로 사용되었으며, 이는 참조 없이 종의 분자 메커니즘 및 조절 네트워크를 연구하는 효과적인 수단입니다.
전사체 데이터 조립 및 단일유전자 기능 주석 후
(1)SNP 분석, SSR 분석, CDS 예측 및 유전자 구조가 수행됩니다.
(2) 각 샘플에서 unigene 발현의 정량화를 수행합니다.
(3) unigene 발현을 기반으로 샘플(또는 그룹) 간에 다르게 발현되는 unigene을 발견합니다.
(4) 차등적으로 발현된 unigenes의 클러스터링, 기능 주석 및 농축 분석이 수행됩니다.
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긴 비 코딩 시퀀싱-Illumina
긴 비암호화 RNA(lncRNA)는 길이가 200nt를 초과하는 RNA 분자 유형으로, 암호화 가능성이 극히 낮은 것이 특징입니다.비암호화 RNA의 핵심 구성원인 LncRNA는 주로 핵과 혈장에서 발견됩니다.시퀀싱 기술 및 생물정보학의 발전으로 수많은 새로운 lncRNA를 식별하고 이를 생물학적 기능과 연관시킬 수 있습니다.축적된 증거는 lncRNA가 후성 유전적 조절, 전사 조절 및 전사 후 조절에 광범위하게 관여한다는 것을 시사합니다.
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Small RNA 시퀀싱-Illumina
소형 RNA는 마이크로 RNA(miRNA), 소형 간섭 RNA(siRNA) 및 파이위 상호작용 RNA(piRNA)를 포함하여 일반적으로 길이가 200nt 미만인 비암호화 RNA 분자의 부류를 의미합니다.
MicroRNA(miRNA)는 길이가 약 20-24nt인 내인성 small RNA의 한 부류로, 세포에서 다양한 중요한 조절 역할을 합니다.miRNA는 다양한 종에서 특정 발현 및 고도로 보존된 조직을 나타내는 많은 생명 과정에 관여합니다.
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circRNA 시퀀싱-Illumina
전체 전사체 시퀀싱은 특정 시간에 특정 세포에 의해 전사되는 코딩(mRNA) 및 비코딩 RNA(lncRNA, circRNA 및 miRNA 포함)를 포함한 모든 유형의 RNA 분자를 프로파일링하도록 설계되었습니다."총 RNA 시퀀싱"이라고도 하는 전체 전사체 시퀀싱은 전사체 수준에서 포괄적인 조절 네트워크를 밝히는 것을 목표로 합니다.NGS 기술을 활용하여 전체 전사체 제품의 서열을 ceRNA 분석 및 공동 RNA 분석에 사용할 수 있으며, 이는 기능적 특성화를 향한 첫 번째 단계를 제공합니다.circRNA-miRNA-mRNA 기반 ceRNA의 조절 네트워크 공개
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전체 전사체 시퀀싱 - Illumina
전체 전사체 시퀀싱은 특정 시간에 특정 세포에 의해 전사되는 코딩(mRNA) 및 비코딩 RNA(lncRNA, circRNA 및 miRNA 포함)를 포함한 모든 유형의 RNA 분자를 프로파일링하도록 설계되었습니다."총 RNA 시퀀싱"이라고도 하는 전체 전사체 시퀀싱은 전사체 수준에서 포괄적인 조절 네트워크를 밝히는 것을 목표로 합니다.NGS 기술을 활용하여 전체 전사체 제품의 서열을 ceRNA 분석 및 공동 RNA 분석에 사용할 수 있으며, 이는 기능적 특성화를 향한 첫 번째 단계를 제공합니다.circRNA-miRNA-mRNA 기반 ceRNA의 조절 네트워크 공개
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원핵생물 RNA 시퀀싱
원핵생물 RNA 시퀀싱은 NGS(Next Generation sequencing)를 사용하여 변화하는 세포 전사체를 분석하여 주어진 순간에 RNA의 존재와 양을 밝혀냅니다.당사의 원핵 RNA 시퀀싱은 특히 참조 게놈이 있는 원핵생물을 대상으로 하여 전사체 프로파일링, 유전자 구조 분석 등을 제공합니다. 기초 과학 연구, 약물 연구 및 개발 등에 널리 적용되었습니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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메타전사체 시퀀싱
메타전사체 시퀀싱은 자연 환경(예: 토양, 물, 바다, 대변 및 장) 내에서 미생물(진핵생물 및 원핵생물 모두)의 유전자 발현을 식별합니다. 구체적으로, 이 서비스를 통해 복잡한 미생물 군집의 전체 유전자 발현 프로파일링, 분류학적 분석을 얻을 수 있습니다. 종의 다양성, 다르게 발현되는 유전자의 기능적 농축 분석 등.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
