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BSA
대량 분리 분석 플랫폼은 1단계 표준 분석과 맞춤형 매개변수 설정을 통한 고급 분석으로 구성됩니다.BSA는 표현형 관련 유전자 마커를 신속하게 식별하는 데 사용되는 기술입니다.BSA의 주요 작업 흐름에는 다음이 포함됩니다. 1. 극도로 반대되는 표현형을 가진 두 개인 그룹을 선택합니다.2. 모든 개체의 DNA, RNA 또는 SLAF-seq(Biomarker 개발)을 모아 두 개의 DNA 덩어리를 형성하는 단계;3. 참조 게놈과 또는 그 사이의 차등 서열을 식별합니다. 4. ED 및 SNP-인덱스 알고리즘을 통해 후보 연결 영역을 예측합니다.5. 후보 지역 유전자의 기능 분석 및 농축 등 유전자 마커 스크리닝, 프라이머 디자인 등 데이터에 대한 보다 고도화된 마이닝도 가능합니다.
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앰플리콘(16S/18S/ITS)
Amplicon(16S/18S/ITS) 플랫폼은 표준화된 기본 분석과 개인화된 분석을 포함하는 미생물 다양성 프로젝트 분석 분야에서 다년간의 경험을 바탕으로 개발되었습니다. 기본 분석은 현재 미생물 연구의 주류 분석 내용을 다루고 분석 내용은 풍부하고 포괄적입니다. 분석 결과는 프로젝트 보고서 형식으로 제공됩니다.개인화 분석의 내용은 다양합니다.기본 분석 보고서 및 연구 목적에 따라 샘플을 선택하고 매개변수를 유연하게 설정하여 개인화된 요구 사항을 실현할 수 있습니다.간단하고 빠른 Windows 운영 체제.
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진화유전학
진화유전학은 SNP, InDels, SV 및 CNV를 포함한 유전적 변이를 기반으로 특정 물질의 진화 정보에 대한 포괄적인 해석을 제공하기 위해 고안된 패키지형 시퀀싱 서비스입니다.이는 인구 구조, 유전적 다양성, 계통 발생 관계 등과 같은 인구의 진화적 변화와 유전적 특징을 설명하는 데 필요한 모든 기본 분석을 제공합니다. 또한 유전자 흐름에 대한 연구도 포함되어 있어 유효 인구 규모, 분기 시간을 추정할 수 있습니다.
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비교유전체학
비교유전체학은 문자 그대로 서로 다른 종의 전체 게놈 서열과 구조를 비교하는 것을 의미합니다.이 학문의 목표는 다양한 종에 걸쳐 보존되거나 차별화되는 서열 구조와 요소를 식별함으로써 게놈 수준에서 종의 진화, 유전자 기능, 유전자 조절 메커니즘을 밝히는 것입니다.대표적인 비교유전체학 연구에는 유전자군 분석, 진화발달, 전체유전체 복제, 선택압 분석 등이 포함됩니다.
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진화유전학
인구 및 진화유전자 분석 플랫폼은 BMK R&D팀이 다년간 축적한 풍부한 경험을 바탕으로 구축되었습니다.특히 생물정보학을 전공하지 않은 연구자에게 사용자 친화적인 도구입니다.계통수 구축, 연관불평형 분석, 유전적 다양성 평가, 선택적 스윕 분석, 혈연관계 분석, PCA, 인구구조 분석 등 기본적인 진화유전학 관련 기초 분석이 가능한 플랫폼입니다.
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Hi-C 기반 게놈 조립
Hi-C는 프로빙 근접 기반 상호 작용과 높은 처리량 시퀀싱을 결합하여 염색체 구성을 캡처하도록 설계된 방법입니다.이러한 상호작용의 강도는 염색체의 물리적 거리와 음의 상관관계가 있는 것으로 여겨집니다.따라서 Hi-C 데이터는 초안 게놈에서 조립된 서열의 클러스터링, 순서 및 방향 지정을 안내하고 이를 특정 수의 염색체에 고정할 수 있습니다.이 기술은 인구 기반 유전자 지도가 없는 경우 염색체 수준 게놈 어셈블리를 강화합니다.모든 단일 게놈에는 Hi-C가 필요합니다.
플랫폼:Illumina NovaSeq 플랫폼/DNBSEQ
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식물/동물 De Novo 게놈 시퀀싱
드 노보시퀀싱은 참조 게놈 없이 PacBio, Nanopore, NGS 등과 같은 시퀀싱 기술을 사용하여 종의 전체 게놈을 구축하는 것을 의미합니다.3세대 시퀀싱 기술의 읽기 길이가 눈에 띄게 향상되면서 이형접합성이 높고 반복 영역 비율이 높으며 배수체 등과 같은 복잡한 게놈을 조립하는 데 새로운 기회가 생겼습니다. 읽기 길이가 수십 킬로베이스 수준인 경우 이러한 시퀀싱 읽기를 통해 반복적인 요소, 비정상적인 GC 함량이 있는 영역 및 기타 매우 복잡한 영역을 해결합니다.
플랫폼: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq 플랫폼
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인간 전체 엑솜 시퀀싱
전체 엑솜 시퀀싱(WES)은 질병을 유발하는 돌연변이를 식별하기 위한 비용 효율적인 시퀀싱 전략으로 간주됩니다.엑손은 전체 게놈의 약 1.7%만을 차지하지만 전체 단백질 기능의 프로파일을 직접적으로 나타냅니다.인간 게놈에서 질병과 관련된 돌연변이의 85% 이상이 단백질 코딩 영역에서 발생하는 것으로 보고되었습니다.
BMKGENE은 다양한 연구 목표를 달성하는 데 사용할 수 있는 다양한 엑손 캡처 전략을 통해 포괄적이고 유연한 인간 전체 엑솜 시퀀싱 서비스를 제공합니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼
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특정 유전자좌 증폭 단편 시퀀싱(SLAF-Seq)
특히 대규모 집단에 대한 높은 처리량의 유전형 분석은 기능적 유전자 발견, 진화 분석 등을 위한 유전적 기초를 제공하는 유전자 연관 연구의 기본 단계입니다. 심층적인 전체 게놈 재시퀀싱 대신 감소된 표현 게놈 시퀀싱(RRGS) )은 샘플당 시퀀싱 비용을 최소화하는 동시에 유전자 마커 발견에 대한 합리적인 효율성을 유지하기 위해 도입되었습니다.이는 일반적으로 주어진 크기 범위 내에서 RRL(Reduced Representation Library)이라는 제한 조각을 추출하여 달성됩니다.SLAF-Seq(특정 유전자좌 증폭 단편 시퀀싱)은 참조 게놈 유무에 관계없이 SNP 유전형 분석을 위해 자체 개발한 전략입니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼 -
일루미나와 BGI
SBS(Sequencing by Synthesis)를 기반으로 하는 Illumina 시퀀싱 기술은 전 세계적으로 수용되는 NGS 혁신으로, 전 세계 시퀀싱 데이터의 90% 이상을 생성합니다.SBS의 원리는 각 dNTP가 추가될 때 형광 표지된 가역적 터미네이터를 이미지화하고 이어서 절단하여 다음 염기를 통합할 수 있도록 하는 것과 관련됩니다.각 시퀀싱 주기에 4개의 가역적 터미네이터 결합 dNTP가 모두 존재하므로 자연스러운 경쟁이 통합 편향을 최소화합니다.이 다재다능한 기술은 단일 읽기 및 페어드 엔드 라이브러리를 모두 지원하여 다양한 게놈 응용 분야에 적합합니다.Illumina 시퀀싱의 높은 처리량 기능과 정밀도는 이를 게놈학 연구의 초석으로 자리매김하여 과학자들이 비교할 수 없는 세부사항과 효율성으로 게놈의 복잡성을 풀 수 있도록 지원합니다.
BGI가 개발한 DNBSEQ는 시퀀싱 비용을 더욱 낮추고 처리량을 높이는 또 다른 혁신적인 NGS 기술입니다.DNBSEQ 라이브러리의 준비에는 DNA 단편화, ssDNA 준비 및 롤링 서클 증폭이 포함되어 DNA 나노볼(DNB)을 얻습니다.그런 다음 이들은 단단한 표면에 로드되고 이후 cPAS(조합 프로브-앵커 합성)에 의해 순서가 결정됩니다.
당사의 사전 제작된 라이브러리 시퀀싱 서비스를 통해 고객은 다양한 소스(mRNA, 전체 게놈, 앰플리콘 등)로부터 시퀀싱 라이브러리를 쉽게 준비할 수 있습니다.이후에 이러한 라이브러리는 Illumina 또는 BGI 플랫폼에서의 품질 관리 및 시퀀싱을 위해 시퀀싱 센터로 배송될 수 있습니다.
