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PacBio-전체 길이 16S/18S/ITS 앰플리콘 시퀀싱
Amplicon(16S/18S/ITS) 플랫폼은 표준화된 기본 분석과 개인화된 분석을 포함하는 미생물 다양성 프로젝트 분석 분야에서 다년간의 경험을 바탕으로 개발되었습니다. 기본 분석은 현재 미생물 연구의 주류 분석 내용을 다루고 분석 내용은 풍부하고 포괄적입니다. 분석 결과는 프로젝트 보고서 형식으로 제공됩니다.개인화 분석의 내용은 다양합니다.기본 분석 보고서 및 연구 목적에 따라 샘플을 선택하고 매개변수를 유연하게 설정하여 개인화된 요구 사항을 실현할 수 있습니다.간단하고 빠른 Windows 운영 체제.
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PacBio-전장 전사체(비참조)
Pacific Biosciences(PacBio) Isoform 서열 분석 데이터를 입력으로 사용하여 이 앱은 전체 길이의 전사 서열을 식별할 수 있습니다(어셈블리 없음).참조 게놈에 대한 전체 길이 서열을 매핑함으로써 알려진 유전자, 전사체, 코딩 영역 등에 의해 전사물을 최적화할 수 있습니다. 이 경우 대체 스플라이싱 등과 같은 mRNA 구조를 보다 정확하게 식별할 수 있습니다.NGS 전사체 시퀀싱 데이터와의 공동 분석을 통해 전사체 수준에서 발현에 대한 보다 포괄적인 주석과 보다 정확한 정량화가 가능하며, 이는 다운스트림 차등 발현 및 기능 분석에 큰 이점을 제공합니다.
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툴킷
BMKCloud는 의료, 농업, 환경 등 다양한 분야의 연구자로부터 폭넓은 신뢰를 받고 있는 게놈 프로그램에 대한 원스톱 솔루션을 제공하는 선도적인 생물정보학 플랫폼입니다. BMKCloud는 생물정보학 분석 플랫폼 및 도구를 포함하여 통합적이고 안정적이며 효율적인 서비스를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. , 컴퓨팅 리소스, 공공 데이터베이스, 생물정보학 온라인 강좌 등. BMKCloud에는 유전자 주석, 진화 유전 도구, ncRNA, 데이터 품질 관리, 조립, 정렬, 데이터 추출, 돌연변이, 통계, 그림 생성기, 서열 등 자주 사용되는 다양한 생물정보학 도구가 있습니다. 분석 등
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작은 RNA
소형 RNA는 miRNA, siRNA 및 piRNA를 포함하여 평균 길이가 18-30nt인 짧은 비암호화 RNA 유형입니다.이러한 작은 RNA는 mRNA 분해, 번역 억제, 이종염색질 형성 등과 같은 다양한 생물학적 과정에 관여하는 것으로 대량 보고되어 왔습니다. SmallRNA 염기서열 분석은 동식물 발달, 질병, 바이러스 등에 대한 연구에 널리 적용되었습니다. 작은 RNA 시퀀싱 분석 플랫폼은 표준 분석과 고급 데이터 마이닝으로 구성됩니다.RNA-seq 데이터를 기반으로 표준 분석을 통해 miRNA 식별 및 예측, miRNA 표적 유전자 예측, 주석 및 발현 분석을 수행할 수 있습니다.고급 분석을 통해 맞춤형 miRNA 검색 및 추출, Venn 다이어그램 생성, miRNA 및 표적 유전자 네트워크 구축이 가능합니다.
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NGS-WGS(일루미나/BGI)
NGS-WGS는 Biomarker Technologies의 풍부한 경험을 바탕으로 개발된 Whole Genome Re-Sequencing 분석 플랫폼입니다.사용하기 쉬운 이 플랫폼을 사용하면 Illumina 플랫폼과 BGI 시퀀싱 플랫폼 모두에서 생성된 DNA 시퀀싱 데이터에 적합한 몇 가지 기본 매개변수를 간단히 설정하여 통합 분석 작업 흐름을 빠르게 제출할 수 있습니다.이 플랫폼은 고성능 컴퓨팅 서버에 배포되어 매우 제한된 시간 내에 매우 효율적인 데이터 분석을 지원합니다.돌연변이 유전자 쿼리, PCR 프라이머 디자인 등 표준 분석을 기반으로 개인화된 데이터 마이닝이 가능합니다.
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mRNA(참고)
전사체는 게놈 유전 정보와 생물학적 기능의 프로테옴 사이의 연결 고리입니다.전사 수준 조절은 유기체의 조절 방식 중 가장 중요하고 가장 널리 연구된 조절 방식입니다.전사체 시퀀싱은 단일 뉴클레오티드에 대한 정확한 분해능으로 특정 시점이나 조건 하에서 전사체의 서열을 분석할 수 있습니다. 이는 유전자 전사 수준을 동적으로 반영하고 희귀 및 정상 전사체를 동시에 식별 및 정량화하며 구조적 정보를 제공할 수 있습니다. 샘플 특정 성적표.
현재, 전사체 시퀀싱 기술은 동물 및 식물 발달 규제, 환경 적응, 면역 상호 작용, 유전자 위치 파악, 종의 유전적 진화, 종양 및 유전병 검출을 포함하여 농학, 의학 및 기타 연구 분야에서 널리 사용되고 있습니다.
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메타게노믹스(NGS)
이 분석 플랫폼은 수년간의 경험을 바탕으로 Shotgun Metagenomic 데이터 분석을 위해 설계되었습니다.데이터 처리, 종 수준 연구, 유전자 기능 수준 연구, 메타지놈 비닝 등 일반적으로 필요한 다양한 메타게놈 분석을 포함하는 통합 워크플로우로 구성됩니다. 또한, 유전자 및 종 쿼리를 포함한 표준 분석 워크플로우에서 맞춤형 데이터 마이닝 도구를 사용할 수 있습니다. , 매개변수 설정, 개인화된 수치 생성 등
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LncRNA
긴 비코딩 RNA(lncRNA)는 길이가 200nt보다 긴 전사체 유형으로, 단백질을 코딩할 수 없습니다.누적된 증거에 따르면 대부분의 lncRNA는 기능적일 가능성이 매우 높습니다.처리량이 높은 시퀀싱 기술과 생물정보학 분석 도구를 사용하면 lncRNA 서열과 위치 정보를 보다 효율적으로 공개하고 중요한 조절 기능을 갖춘 lncRNA를 발견할 수 있습니다.BMKCloud는 고객에게 빠르고 안정적이며 유연한 lncRNA 분석을 달성할 수 있는 lncRNA 시퀀싱 분석 플랫폼을 제공하게 된 것을 자랑스럽게 생각합니다.
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GWAS
GWAS(게놈 연관 연구)는 특정 특성(표현형)과 관련된 유전적 변이(유전자형)를 식별하는 것을 목표로 합니다.GWA 연구는 다수의 개인의 전체 게놈에 걸친 유전적 마커를 조사하고 인구 수준의 통계 분석을 통해 유전자형-표현형 연관성을 예측합니다.전체 게놈 재배열은 잠재적으로 모든 유전적 변이를 발견할 수 있습니다.표현형 데이터와 결합하여 GWAS는 표현형 관련 SNP, QTL 및 후보 유전자를 식별하기 위해 처리될 수 있으며, 이는 현대 동식물 육종을 강력하게 뒷받침합니다.SLAF는 자체 개발한 단순화된 게놈 시퀀싱 전략으로 게놈 전체에 분산된 마커인 SNP를 발견합니다.분자 유전적 마커인 이러한 SNP는 표적 특성과의 연관 연구를 위해 처리될 수 있습니다.이는 유전적 변이와 관련된 복잡한 특성을 식별하는 데 비용 효율적인 전략입니다.
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Nanopore 전장 전사체학
유기체의 복잡하고 가변적인 대체 이소형은 유전자 발현과 단백질 다양성을 조절하는 중요한 유전 메커니즘입니다.전사체 구조의 정확한 식별은 유전자 발현 조절 패턴에 대한 심층적인 연구의 기초입니다.Nanopore 시퀀싱 플랫폼은 전사체 연구를 isoform 수준으로 성공적으로 가져왔습니다.본 분석 플랫폼은 참조 게놈을 기반으로 Nanopore 플랫폼에서 생성된 RNA-Seq 데이터를 분석하도록 설계되어 유전자 수준과 전사체 수준 모두에서 정성적, 정량적 분석이 가능합니다.
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circ-RNA
원형 RNA(circRNA)는 비암호화 RNA의 일종으로 최근 발달, 환경 저항성 등과 관련된 조절 네트워크에서 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀졌습니다. 선형 RNA 분자(예: mRNA, lncRNA, 3' 및 5')와 구별됩니다. circRNA의 끝은 서로 연결되어 원형 구조를 형성하며, 이는 엑소뉴클레아제의 소화를 방지하고 대부분의 선형 RNA보다 더 안정적입니다.CircRNA는 유전자 발현 조절에 다양한 기능을 갖는 것으로 밝혀졌습니다.CircRNA는 miRNA 스폰지로 알려진 miRNA와 경쟁적으로 결합하는 ceRNA로 작동할 수 있습니다.CircRNA 염기서열분석 분석 플랫폼은 circRNA 구조 및 발현 분석, 표적 예측 및 다른 유형의 RNA 분자와의 결합 분석을 지원합니다.
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BSA
대량 분리 분석 플랫폼은 1단계 표준 분석과 맞춤형 매개변수 설정을 통한 고급 분석으로 구성됩니다.BSA는 표현형 관련 유전자 마커를 신속하게 식별하는 데 사용되는 기술입니다.BSA의 주요 작업 흐름에는 다음이 포함됩니다. 1. 극도로 반대되는 표현형을 가진 두 개인 그룹을 선택합니다.2. 모든 개체의 DNA, RNA 또는 SLAF-seq(Biomarker 개발)을 모아 두 개의 DNA 덩어리를 형성하는 단계;3. 참조 게놈과 또는 그 사이의 차등 서열을 식별합니다. 4. ED 및 SNP-인덱스 알고리즘을 통해 후보 연결 영역을 예측합니다.5. 후보 지역 유전자의 기능 분석 및 농축 등 유전자 마커 스크리닝, 프라이머 디자인 등 데이터에 대한 보다 고도화된 마이닝도 가능합니다.
