히트맵
매트릭스 데이터 파일은 매트릭스 데이터를 필터링, 정규화 및 클러스터링할 수 있는 히트맵 그리기에 사용됩니다.주로 서로 다른 샘플 간의 유전자 발현 수준을 클러스터 분석하는 데 사용됩니다.
유전자 주석
유전자 기능 주석은 다양한 데이터베이스에 대해 FASTA 파일의 시퀀스를 매핑하여 수행됩니다.
유전자 주석
기본 지역 선형 검색 도구
CDS_UTR_예측
이 도구는 알려진 단백질 데이터베이스에 대한 폭발 및 ORF 예측을 기반으로 주어진 전사체 서열에서 코딩 영역(CDS) 및 비코딩 영역(UTR)을 예측하도록 설계되었습니다.
맨해튼 플롯
맨해튼 플롯을 사용하면 많은 수의 데이터 포인트가 포함된 데이터를 표시할 수 있습니다.이는 게놈 전체 연관 연구(GWAS)에 일반적으로 사용됩니다.
시르코스
CIRCOS 다이어그램을 사용하면 게놈의 SNP, InDeL, SV, CNV 분포를 직접 표시할 수 있습니다.
GO_강화
TopGO는 기능 강화를 위해 설계된 도구입니다.TopGO-Bioconductor 패키지는 차등 발현 분석, GO 농축 분석 및 결과 시각화로 구성됩니다.topGO_BP, topGO_CC 및 topGO_MF에 대한 결과가 포함된 "Graph"라는 출력이 있는 폴더를 생성합니다.
WGCNA
WGCNA는 유전자 공동 발현 모듈을 발견하기 위해 널리 사용되는 데이터 마이닝 방법입니다.차세대 시퀀싱을 통해 유래된 마이크로어레이 데이터, 유전자 발현 데이터 등 다양한 발현 데이터세트에 적용 가능합니다.
인터프로스캔
InterPro 단백질 서열 분석 및 분류
GO_KEGG_강화
이 도구는 제공된 유전자 세트 및 해당 주석을 기반으로 GO 농축 히스토그램, KEGG 농축 히스토그램 및 KEGG 농축 경로를 생성하도록 설계되었습니다.