Nanopore 기반 전장 전사체 시퀀싱
Nanopore 시퀀싱은 DNA 합성 없이 뉴클레오티드를 직접 읽고 수십 킬로베이스에서 긴 판독을 생성한다는 점에서 다른 시퀀싱 플랫폼과 구별됩니다.이를 통해 전체 길이의 성적표를 직접 읽고 전사체 연구의 과제를 해결할 수 있습니다.
√ 낮은 서열 특정 편향
√ 유전자 구조 연구를 위한 cDNA 전체 길이 판독
√ 동일한 수의 성적표를 처리하는 데 필요한 데이터가 적습니다.
√ 유전자당 여러 isoform 식별
√ isoform 수준의 발현 정량화
일반적인 생물정보학 파이프라인
바이오마커 기술의 최신 성공 사례
1. 전체 길이 전사체의 비교 분석을 통해 Gnetum luofuense 줄기 발달 역학이 밝혀졌습니다.
저널: 유전학의 개척지
게시일: 2021년 3월
키워드: 미니언 |대체 접합 |아파 |lncRNA |차등적으로 표현된 성적표
전문 읽기
2. 종간 이종이식편의 싹에서 뿌리까지 작은 RNA의 단방향 이동
저널: 자연 식물
게시일: 2021년 1월
키워드: 나노포어 |일루미나 |전장 모바일 mRNA 검출
3. 아스파라거스 뿌리의 전체 길이 전사체 분석을 통해 수지상 균근 곰팡이에 의해 유발된 염 내성의 분자 메커니즘이 밝혀졌습니다.
저널: 환경 및 실험 식물학
게시일: 2021년 1월
키워드: 미니언 |차별적으로 표현된 성적표 |전사인자 |대체 접합
4. 가뭄 스트레스에 따른 장미(Rosa chinensis) 뿌리와 잎의 생리학적 특성 변화와 전체 길이의 전사체
저널: 식물 및 세포 생리학
게시일: 2020년 10월
키워드: PromethION |차별적으로 표현된 성적표 |기능적 예측 |접합된 이성체 |TF와 lncRNA
5. Arabidopsis 전사체의 PacBio 및 nanopore 기반 RNA 시퀀싱 분석 및 종합 비교
저널: 플랜트 메소드
게시일: 2020년 4월
키워드: 그리드리온 |프로메션 |PacBio 속편 |일루미나 NovaSeq |게놈 정렬 |성적표 식별 |대체 접합 |SSR |LncRNA |이소형 정량화
뉴스 및 하이라이트 Biomarker Technologies와의 최신 성공 사례를 공유하고 연구 중에 적용된 뛰어난 기술뿐만 아니라 새로운 과학적 성과를 포착하는 것을 목표로 합니다.
게시 시간: 2022년 1월 8일