게놈
바이오매스 작물 Miscanthus lutarioriparius 게놈의 염색체 규모 조립 및 분석
나노기공 시퀀싱 |일루미나 |하이씨 |RNA 시퀀싱 |계통발생
본 연구에서 Biomarker Technologies는 Nanopore 시퀀싱, de novo 게놈 어셈블리, Hi-C 지원 어셈블리 등에 대한 기술 지원을 제공했습니다.
추상적인
미스칸투스뿌리줄기 다년생 식물인 는 높은 바이오매스와 스트레스 내성으로 인해 바이오에너지 생산에 큰 잠재력을 가지고 있습니다.우리는 염색체 규모의 조립을 보고합니다.억새류 루타리오파리우스Oxford Nanopore 시퀀싱과 Hi-C 기술을 결합하여 게놈을 분석합니다.2.07-Gb 어셈블리는 게놈의 96.64%를 차지하며 contig N50은 1.71Mb입니다.동원체와 텔로미어 서열은 각각 19개 염색체와 10번 염색체 모두에 대해 조립됩니다.M. lutarioriparius의 Allotetraploid 기원은 동원체 위성 반복을 사용하여 확인됩니다.4배체 게놈 구조와 수수와 관련된 여러 염색체 재배열이 명확하게 입증되었습니다.탠덤 중복 유전자M. 루타리오파리우스스트레스 반응뿐만 아니라 세포벽 생합성과 관련된 측면에서도 기능이 풍부합니다.질병 저항성, 세포벽 생합성 및 금속 이온 수송과 관련된 유전자군이 크게 확장되고 진화되었습니다.이들 과의 확장은 동물의 놀라운 특성을 향상시키는 데 중요한 게놈 기반이 될 수 있습니다.M. 루타리오파리우스.
게놈 조립의 주요 통계
수치.M. lutarioriparius 게놈 어셈블리 개요
뉴스 및 하이라이트 Biomarker Technologies와의 최신 성공 사례를 공유하고 연구 중에 적용된 뛰어난 기술뿐만 아니라 새로운 과학적 성과를 포착하는 것을 목표로 합니다.
게시 시간: 2022년 1월 5일