유기체의 원래 위치에서 유전자 발현 패턴을 탐색하는 것은 세포의 유형과 기능을 이해하는 데 중요합니다.그러나 현재의 공간 전사체 분석 방법은 처리량이 낮거나 분해능이 부족한 등의 한계가 있습니다.BMKMANU가 개발한 BMKMANU S1000 Spatial Chip은 전체 조직 절편에서 세포하 해상도로 현장 유전자 발현 정보를 감지할 수 있어 조직 구조의 미묘한 해석이 가능합니다.
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제품 구성요소
BMKMANU S1000 공간 칩 및 매칭 시약 키트에는 다음이 포함됩니다.
1) 조직 최적화를 위한 시약이 포함된 조직 최적화 키트(조직 투과성을 위한 최적의 시간 탐색).
2) 후속 라이브러리 준비 및 시퀀싱을 위해 조직 조각에서 mRNA를 캡처하기 위한 시약이 포함된 유전자 발현 키트.
3) 시동 키트: 온도 조절 어댑터와 전사체 자기 분리기가 포함되어 있습니다.
기술원리
칩은 마이크로포어(Micropore)와 마이크로비드(Microbead)를 기반으로 하며, 마이크로비드에 있는 Oligo를 통해 mRNA가 현장에서 캡처될 수 있습니다.Oligo는 Read1, Spatial Barcode, UMI 및 Poly(dT)VN의 네 부분으로 구성됩니다.조직이 칩에 부착된 후 투과화 효소에 의해 mRNA가 조직에서 방출됩니다.대부분의 mRNA 3' 말단에는 Poly-A 꼬리가 있으므로 Poly(dT)VN을 사용하여 Oligo에 의해 캡처됩니다.RT-PCR 및 cDNA 증폭, 라이브러리 준비 및 시퀀싱 후 Spatial Barcode를 통해 공간 위치 추적이 이루어집니다.이는 공간적 위치와 조직 이질성에서 유전자 발현 분석을 허용합니다.
제품 장점
응용
종양, 질병, 면역학, 발달 생물학을 포함한 대부분의 생물학 및 의학 연구 분야에 적용할 수 있으며, 세포 이하 해상도에서 공간 표현 분석을 통해 이러한 분야에서 새로운 돌파구를 찾는 데 도움이 됩니다.
●종양 및 질병:
종양과 질병의 공간적 이질성과 미세환경
종양 및 질병의 발병 및 발달
종양 및 질병의 치료 반응
●발생생물학
기관의 시공간 아틀라스
발달 중 유전자 조절 메커니즘
●스트레스 반응
생물학적 스트레스 반응
비생물적 스트레스 반응
●면역학
장기 이식의 면역 반응
종양 및 질병의 면역 메커니즘
자가면역질환의 발병기전
●약물내성 분석
약물 저항성의 메커니즘
신약 연구 및 개발
사례 및 데모 데이터
BMKMANU S1000은 다양한 조직 유형에 걸쳐 수백 건의 사례에서 성능이 검증되었습니다.
