BMKGENE은 생명정보학 브리핑(Bringings in Bioinformatics)에 발표된 "STEEL을 사용하면 시공간 전사체 데이터의 고해상도 묘사가 가능합니다"라는 연구를 위해 공간 전사체 시퀀싱 서비스를 제공했습니다.
이 연구는 비지도 및 다양한 학습 기반 알고리즘인 Spatial Transcriptome cEll typE Clustering(STEEL)을 제안했습니다. 이 알고리즘은 매우 유사한 유전자 발현 프로필과 가까운 공간 거리를 그래프 방식으로 나타내는 비드를 클러스터링하여 공간 전사체에서 도메인을 식별합니다.
10X Visium 플랫폼의 공간 전사체 데이터 세트에 대한 STEEL의 포괄적인 평가는 마우스 뇌의 미세 구조를 특성화하기 위한 고해상도를 달성할 뿐만 아니라 개별적으로 분석된 여러 조직 슬라이드를 더 큰 조직 슬라이드로 통합할 수 있음을 보여줍니다.
공간 전사체 기술의 발전으로 우리의 방법은 도메인 식별 및 유전자 발현 아틀라스 재구성에 큰 적용 가능성을 갖게 될 것입니다.
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게시 시간: 2023년 10월 20일