BMKGENE 고객의 중요한 사례를 통해 다양한 연구 종을 연구할 수 있는 잠재력을 탐구해 보세요.최근 식물 생명공학 저널(Plant Biotechnology Journal)의 올해 호에 게재된 "염색체 수준의 야생 Hevea brasiliensis 게놈: 게놈 보조 번식 및 고무 생산량 증가를 위한 필수 유전자좌 발굴"이라는 제목의 기사가 귀중한 참고 자료가 됩니다.
브라질 고무나무(Hevea brasiliensis)는 중추적인 천연 고무 공급원으로 우뚝 솟아 있습니다.지난 세기 동안 전통적인 육종 방법으로 인해 고무 생산량이 6배나 급증했습니다.그러나 잠재적인 고무 생산량 향상을 담당하는 근본적인 유전적 기반은 여전히 수수께끼로 남아 있습니다.
이 연구는 Nanopore 긴 판독 시퀀싱, Illumina NGS 시퀀싱 및 Hi-C 기술의 시너지 효과를 사용하여 야생 고무나무에 대한 염색체 수준 게놈 구축에 착수했습니다.
동시에, Illumina 플랫폼을 사용하여 포괄적인 전체 게놈 재배열(WGS)을 위해 고수율 변이, 야생 균주 및 관련 종을 포함하는 147개의 생식질 자원이 수집되었습니다.이어지는 시퀀싱 데이터는 엄격한 인구 유전학 분석을 거쳐 인구 구조, 다양성 및 연관 불균형을 해부할 수 있게 되었습니다.이 분석은 인구 집단에 따른 가축화 변화를 밝혀줍니다.
추가 조사에는 Fst, π, Tajima의 D 및 LD를 포함하는 분석이 포함되었으며, 특히 Wickham 클론에 초점을 맞춰 향상된 라텍스 수율로 인해 발생하는 선택 신호를 공개하는 것을 목표로 했습니다.
GWAS(게놈 전체 연관 분석)를 통해 수확량 특성 및 이후 수확량 관련 유전자와 연결된 마커가 정확히 밝혀졌습니다.초기 검증에서는 두 개의 ERF 유전자에 대한 서로 다른 돌연변이에 걸쳐 독특한 전사 활동이 공개되어 기능적 중요성을 미리 엿볼 수 있었습니다.향후 연구에서 추가 확증이 예정되어 있습니다.
BMKGENE은 생물정보학 분석에서 중요한 역할과 함께 이 대규모 인구의 광범위한 전체 게놈 재배열에 기여하는 데 자부심을 갖고 있습니다.우리의 방대한 경험은 1000개 이상의 종에 대한 NGS/TGS 시퀀싱 및 멀티오믹스 생물정보학 분석을 포함합니다.우리는 귀하의 향후 프로젝트에서 귀하와 협력할 수 있기를 기대하고 있습니다.
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게시 시간: 2023년 8월 29일