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제품

BMKMANU S1000 공간 전사체

세포의 공간 구성은 면역 침투, 배아 발달 등과 같은 다양한 생물학적 과정에서 중요한 역할을 합니다. 공간 위치 정보를 유지하면서 유전자 발현 프로파일링을 나타내는 공간 전사체 시퀀싱은 전사체 수준 조직 구조에 대한 훌륭한 통찰력을 제공합니다.기술의 발전에 따라 매우 선명한 조직 형태와 공간 분자 발현의 실제 구조적 차이를 더 높은 해상도로 연구해야 합니다.BMKGENE은 샘플부터 생물학적 통찰력까지 포괄적인 원스톱 공간 전사체 시퀀싱 서비스를 제공합니다.

공간 전사체학 기술은 이질적인 샘플의 공간 콘텐츠로 유전자 발현 프로파일을 해결함으로써 다양한 연구 분야에서 새로운 관점을 제시합니다.

공간 전사체 칩: BMKMANU S1000

플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼


서비스 내용

생물정보학

데모 결과

BMKMANU S1000 공간 전사체 기술 체계

S1000。

BMKMANU S1000의 장점

1) 하위 세포 해상도: 각 캡처 영역에는 직경 2.5μm, 스팟 중심 간 간격이 5μm인 200만 개가 넘는 공간 바코드 스팟이 포함되어 있어 하위 세포 해상도(5μm)로 공간 전사체 분석이 가능합니다.

s1000 (1)

2) 다단계 해상도 분석: 100μm에서 5μm까지 유연한 다단계 분석을 통해 다양한 조직 특징을 최적의 해상도로 분석합니다.

s1000 (2)

3) 포괄적인 전사체 프로파일링: 전체 조직 슬라이드에서 캡처한 전사체를 대상 유전자 수 및 대상 영역에 제한 없이 분석할 수 있습니다.

s1000 (3)

서비스 사양

도서관

시퀀싱 전략

데이터 출력 권장

S1000 cDNA 라이브러리

BMKMANU S1000-일루미나 PE150

60Gb/샘플

샘플 요구사항

견본

숫자

크기

RNA 품질

OCT 내장 조직 블록

2-3 블록/샘플

대략.6.8x6.8x6.8mm3

RIN≥7

샘플 준비 지침 및 서비스 워크플로에 대한 자세한 내용은 언제든지 담당자에게 문의하세요.

서비스 작업 흐름

샘플 QC

실험 설계

샘플 배송

샘플 배송

파일럿 실험

사전 실험

공간 바코드

공간 바코드

도서관 준비

도서관 건립

시퀀싱

시퀀싱

데이터 분석

데이터 분석

판매 서비스 후

판매 후 서비스


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    BMKMANU S1000에서 생성된 데이터는 BMKGENE이 독립적으로 설계한 소프트웨어 "BSTMatrix"를 사용하여 분석됩니다.

    1) 유전자 발현 매트릭스 생성
    2) HE 이미지 처리
    3) 분석을 위해 다운스트림 타사 소프트웨어와 호환 가능
    4) 온라인 "BSTViewer"는 다양한 해상도에서 시각화 결과를 얻는 데 도움이 됩니다.

    1.스팟 클러스터링

    s1000 (4)

    2.공간분포

    s1000 (5)s1000 (6)

    N메모: 해결레벨=13 (100 μm, 왼쪽); 7 (50 μm, 오른쪽)

    3.마커 발현 풍부도 클러스터링 히트맵

    s1000 (7)

    4.샘플 간 데이터 분석

    s1000 (8)

     

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