-
ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ChIP-seq)
ChIP-Seq ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡು, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ DNA-ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಿಗಾಗಿ DNA ಗುರಿಗಳ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೊಟೀನ್-ಡಿಎನ್‌ಎ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಚೇತರಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಇಮ್ಯುನೊ-ಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ (ಚಿಪ್) ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ, ಮರುಪಡೆಯಲಾದ ಡಿಎನ್‌ಎಯ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಮುಂದಿನ ಪೀಳಿಗೆಯ ಅನುಕ್ರಮದ (ಎನ್‌ಜಿಎಸ್) ಶಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ.ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್-ಡಿಎನ್‌ಎ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಜೀವಂತ ಕೋಶಗಳಿಂದ ಮರುಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ವಿಭಿನ್ನ ಕೋಶ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಮತ್ತು ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ವಿಭಿನ್ನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೋಲಿಸಬಹುದು.ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್‌ಗಳು ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ನಿಯಂತ್ರಣದಿಂದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಮಾರ್ಗಗಳವರೆಗೆ ರೋಗದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೂ ಮೀರಿದವರೆಗೆ ಇರುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ -NGS
ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರದ ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್, ಮಾನವ ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಒಟ್ಟು ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಕೃಷಿ ಮಾಡಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಕೃಷಿ ಮಾಡಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಮಿಶ್ರ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಬಳಸುವ ಒಂದು ಆಣ್ವಿಕ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜಾತಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಸಮೃದ್ಧಿ, ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆ, ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧ, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧದ ಜಾಲದ ವಿವರವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ:ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ನ್ಯಾನೊಪೋರ್
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಎಂಬುದು ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಮಿಶ್ರ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುವ ಒಂದು ಆಣ್ವಿಕ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜಾತಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಸಮೃದ್ಧತೆ, ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆ, ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧ, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ನೆಟ್‌ವರ್ಕ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿವರವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಗಳನ್ನು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಪರಿಚಯಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ.ರೀಡ್ ಲೆಂತ್‌ನಲ್ಲಿ ಅದರ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ವರ್ಧಿಸಿತು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ.ಓದು-ಉದ್ದದ ಪ್ರಯೋಜನಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನವು ಶಾಟ್-ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಹೆಚ್ಚು ನಿರಂತರ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ.ನ್ಯಾನೊಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಉತ್ಪಾದಿಸಿದೆ ಎಂದು ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ (ಮಾಸ್, ಇಎಲ್, ಮತ್ತು ಇತರರು,ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್, 2020)
ವೇದಿಕೆ:ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ P48
-
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮ
ಸೈಟೋಸಿನ್ (5-mC) ನಲ್ಲಿ ಐದನೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣವು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಮೂಲಭೂತ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ಅಸಹಜ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಮಾದರಿಗಳು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್‌ನಂತಹ ಹಲವಾರು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ.ಒಂದೇ ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು WGBS ಚಿನ್ನದ ಮಾನದಂಡವಾಗಿದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
ಹೈ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ATAC-seq) ಜೊತೆಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸೇಸ್-ಆಕ್ಸೆಸ್ಬಲ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್‌ಗಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ATAC-seq ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರವೇಶದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಜಾಗತಿಕ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕೆ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ.ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ Tn5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸೇಸ್ ಮೂಲಕ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅಡಾಪ್ಟರುಗಳನ್ನು ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಪಿಸಿಆರ್ ವರ್ಧನೆಯ ನಂತರ, ಅನುಕ್ರಮ ಗ್ರಂಥಾಲಯವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ.ಎಲ್ಲಾ ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳ-ಸಮಯದ ಸ್ಥಿತಿಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಪಡೆಯಬಹುದು, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳಿಗೆ ಅಥವಾ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಪ್ರದೇಶಕ್ಕೆ ಮಾತ್ರ ಸೀಮಿತವಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ.
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-PacBio
16S ಮತ್ತು 18S rRNA ಯ ಉಪಘಟಕವು ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮತ್ತು ಹೈಪರ್-ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪರಿಪೂರ್ಣವಾದ ಆಣ್ವಿಕ ಫಿಂಗರ್‌ಪ್ರಿಂಟ್ ಆಗಿದೆ.ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಪಡೆದು, ಸಂರಕ್ಷಿತ ಭಾಗಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಈ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ, ಫೈಲೋಜೆನಿ ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಹೈಪರ್-ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಬಹುದು. ಏಕ-ಅಣು ನೈಜ-ಸಮಯ ) PacBio ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನ ಅನುಕ್ರಮವು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್‌ಗಳನ್ನು (ಅಂದಾಜು. 1.5 Kb) ಆವರಿಸುತ್ತದೆ.ಆನುವಂಶಿಕ ಕ್ಷೇತ್ರದ ವಿಶಾಲ ನೋಟವು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಥವಾ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಮುದಾಯದಲ್ಲಿನ ಜಾತಿಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿಯಲ್ಲಿನ ನಿರ್ಣಯವನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ವರ್ಧಿಸಿತು.
ವೇದಿಕೆ:PacBio ಸೀಕ್ವೆಲ್ II
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯದಲ್ಲಿ ಫೈಲೋಜೆನಿ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ ಮತ್ತು ಜಾತಿಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಸಂಭಾಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಮತ್ತು ಹೈಪರ್ವೇರಿಯಬಲ್ ಭಾಗಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಹೌಸ್‌ಕೀಪಿಂಗ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳ PCR ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.Woeses et al,(1977) ಈ ಪರಿಪೂರ್ಣ ಆಣ್ವಿಕ ಫಿಂಗರ್‌ಪ್ರಿಂಟ್‌ನ ಪರಿಚಯವು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.16S (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ), 18S (ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಮತ್ತು ಆಂತರಿಕ ಲಿಪ್ಯಂತರ ಸ್ಪೇಸರ್ (ITS, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಅನುಕ್ರಮವು ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಅಪರೂಪದ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸಲಾಗದ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.ಈ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಮಾನವನ ಬಾಯಿ, ಕರುಳು, ಮಲ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ವಿವಿಧ ಪರಿಸರಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುವಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸುವ ಮತ್ತು ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ.
ವೇದಿಕೆ:ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಫಂಗಲ್ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು ಅನುಕ್ರಮ
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು ಅನುಕ್ರಮವು ತಿಳಿದಿರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು, ಹಾಗೆಯೇ ಬಹು ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸಲು ಅಥವಾ ಹೊಸ ಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಲು ನಿರ್ಣಾಯಕ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ.ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಇತರ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಮಾಡಲು ನಿಖರವಾದ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದು ಬಹಳ ಮಹತ್ವದ್ದಾಗಿದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದ 16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS) ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಬಿಯಲ್ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ;ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ.ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲಭೂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು.ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ (ಉಲ್ಲೇಖ-ಅಲ್ಲದ)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್‌ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ, ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (ಜೋಡಣೆ ಇಲ್ಲದೆ) ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ.ಉಲ್ಲೇಖದ ಜಿನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನ್‌ಗಳು, ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಆಪ್ಟಿಮೈಸ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ mRNA ರಚನೆಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು.NGS ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಪರಿಮಾಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡೌನ್‌ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
ಕಡಿಮೆಯಾದ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (RRBS)
ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಯಾವಾಗಲೂ ರೋಗದ ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ ಬಿಸಿ ವಿಷಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಫಿನೋ-ಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ.ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಆರ್‌ಆರ್‌ಬಿಎಸ್ ನಿಖರ, ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಮತ್ತು ಆರ್ಥಿಕ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ.ಬಿಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಜೊತೆಗೆ ಎಂಜೈಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಕ್ಲೀವೇಜ್ (Msp I) ಮೂಲಕ ಪ್ರವರ್ತಕ ಮತ್ತು CpG ದ್ವೀಪ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣವು ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪತ್ತೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ mRNA ಅನುಕ್ರಮ
mRNA ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳೊಳಗಿನ ಎಲ್ಲಾ mRNA ನಕಲುಗಳ ಸಮಗ್ರ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಅತ್ಯಾಧುನಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಪ್ರಬಲವಾದ ಸಾಧನವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳು, ಜೀನ್ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಮೂಲಭೂತ ಸಂಶೋಧನೆ, ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಡಯಾಗ್ನೋಸ್ಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಡ್ರಗ್ ಡೆವಲಪ್‌ಮೆಂಟ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ, mRNA ಅನುಕ್ರಮವು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಜಟಿಲತೆಗಳ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.ನಮ್ಮ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಎಮ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮಾದರಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆಯು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಡಿಪ್ಲೀಶನ್ ಮತ್ತು ಡೈರೆಕ್ಷನಲ್ ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಎಕ್ಸ್
