-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದ 16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS) ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಬಿಯಲ್ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ;ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ.ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲಭೂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು.ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ (ಉಲ್ಲೇಖ-ಅಲ್ಲದ)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್‌ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ, ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (ಜೋಡಣೆ ಇಲ್ಲದೆ) ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ.ಉಲ್ಲೇಖದ ಜಿನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನ್‌ಗಳು, ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಆಪ್ಟಿಮೈಸ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ mRNA ರಚನೆಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು.NGS ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಪರಿಮಾಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡೌನ್‌ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
ಟೂಲ್ಕಿಟ್ಗಳು
BMKCloud ಜೀನೋಮಿಕ್ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿದೆ, ಇದು ವೈದ್ಯಕೀಯ, ಕೃಷಿ, ಪರಿಸರ, ಇತ್ಯಾದಿ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ರಂಗದಲ್ಲಿ ಸಂಶೋಧಕರಿಂದ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ನಂಬಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. , ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳು, ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಬಯೋಇನ್‌ಫಾರ್ಟಿಕ್ ಆನ್‌ಲೈನ್ ಕೋರ್ಸ್‌ಗಳು, ಇತ್ಯಾದಿ. BMKCloud ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ, ವಿಕಸನೀಯ ಆನುವಂಶಿಕ ಉಪಕರಣಗಳು, ncRNA, ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ, ಜೋಡಣೆ, ಜೋಡಣೆ, ಡೇಟಾ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ, ರೂಪಾಂತರಗಳು, ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು, ಫಿಗರ್ ಜನರೇಟರ್, ಅನುಕ್ರಮ ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ಬಾರಿ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಇತ್ಯಾದಿ.
-
ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎ
ಸಣ್ಣ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು ಮೈಆರ್‌ಎನ್‌ಎ, ಸಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಮತ್ತು ಪಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಸೇರಿದಂತೆ ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ 18-30 ಎನ್‌ಟಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಣ್ಣ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರಕಾರಗಳಾಗಿವೆ.ಈ ಸಣ್ಣ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು ಎಮ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅವನತಿ, ಭಾಷಾಂತರ ಪ್ರತಿಬಂಧ, ಹೆಟೆರೊಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯಂತಹ ವಿವಿಧ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ವರದಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವೇದಿಕೆಯು ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಸುಧಾರಿತ ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.RNA-seq ಡೇಟಾದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು miRNA ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಭವಿಷ್ಯ, miRNA ಗುರಿ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ, ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು.ಸುಧಾರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ miRNA ಹುಡುಕಾಟ ಮತ್ತು ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ, ವೆನ್ ರೇಖಾಚಿತ್ರ ಉತ್ಪಾದನೆ, miRNA ಮತ್ತು ಗುರಿ ಜೀನ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಕಟ್ಟಡವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
NGS-WGS (ಇಲ್ಯುಮಿನಾ/BGI)
NGS-WGS ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದೆ, ಇದು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್‌ನಲ್ಲಿನ ಶ್ರೀಮಂತ ಅನುಭವದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಮತ್ತು ಬಿಜಿಐ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಎರಡರಿಂದಲೂ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಡಿಎನ್‌ಎ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾಕ್ಕೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಕೆಲವು ಮೂಲಭೂತ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಈ ಸುಲಭ-ಬಳಕೆಯ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ತ್ವರಿತ ಸಲ್ಲಿಕೆಗೆ ಏಕೀಕೃತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಸರ್ವರ್‌ನಲ್ಲಿ ನಿಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಅತ್ಯಂತ ಸೀಮಿತ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ರೂಪಾಂತರಿತ ಜೀನ್ ಪ್ರಶ್ನೆ, PCR ಪ್ರೈಮರ್ ವಿನ್ಯಾಸ, ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ಡೇಟಾ ಮೈನಿಂಗ್ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
-
mRNA(ಉಲ್ಲೇಖ)
ಪ್ರತಿಲೇಖನವು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾಹಿತಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಕ್ರಿಯೆಯ ಪ್ರೋಟೀಮ್ ನಡುವಿನ ಕೊಂಡಿಯಾಗಿದೆ.ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣವು ಜೀವಿಗಳ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಮುಖ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾದ ನಿಯಂತ್ರಣ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ.ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮವು ಯಾವುದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಸ್ಥಿತಿಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ, ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗೆ ನಿಖರವಾದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಇದು ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ, ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಅಪರೂಪದ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಮಾದರಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿಗಳು.
ಪ್ರಸ್ತುತ, ಪ್ರಾಣಿ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ನಿಯಂತ್ರಣ, ಪರಿಸರ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ, ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ, ಜೀನ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣ, ಜಾತಿಯ ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಗೆಡ್ಡೆ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕ ರೋಗ ಪತ್ತೆ ಸೇರಿದಂತೆ ಕೃಷಿ ವಿಜ್ಞಾನ, ಔಷಧ ಮತ್ತು ಇತರ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ (NGS)
ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಶಾಟ್‌ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.ಇದು ದತ್ತಾಂಶ ಸಂಸ್ಕರಣೆ, ಜಾತಿ-ಮಟ್ಟದ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಜೀನ್ ಕಾರ್ಯ-ಮಟ್ಟದ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಬಿನ್ನಿಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ವಿವಿಧ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಂಯೋಜಿತ ಕೆಲಸದ ಹರಿವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಜೊತೆಗೆ, ಜೀನ್ ಮತ್ತು ಜಾತಿಯ ಪ್ರಶ್ನೆ ಸೇರಿದಂತೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋನಲ್ಲಿ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ಡೇಟಾ ಮೈನಿಂಗ್ ಉಪಕರಣಗಳು ಲಭ್ಯವಿದೆ. , ಪ್ಯಾರಾಮೀಟರ್ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್, ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ಫಿಗರ್ ಜನರೇಟ್, ಇತ್ಯಾದಿ.
-
LncRNA
ಲಾಂಗ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು (ಎಲ್‌ಎನ್‌ಸಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎ) 200 ಎನ್‌ಟಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉದ್ದವಿರುವ ಒಂದು ರೀತಿಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳಾಗಿವೆ, ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಲ್‌ಎನ್‌ಸಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಎಂದು ಸಂಚಿತ ಪುರಾವೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.ಹೈ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳು lncRNA ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಸ್ಥಾನಿಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ನಮಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ಣಾಯಕ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ lncRNA ಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಲು ನಮಗೆ ದಾರಿ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ.ವೇಗವಾದ, ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ lncRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ನಮ್ಮ ಗ್ರಾಹಕರಿಗೆ lncRNA ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು BMKCloud ಹೆಮ್ಮೆಪಡುತ್ತದೆ.
-
GWAS
ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಸ್ಟಡಿ (GWAS) ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ (ಫಿನೋಟೈಪ್) ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು (ಜೀನೋಟೈಪ್) ಗುರುತಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.GWA ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಆನುವಂಶಿಕ ಗುರುತುಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮೂಲಕ ಜಿನೋಟೈಪ್-ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್‌ಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ.ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಎಲ್ಲಾ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಬಹುದು.ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜೋಡಿಸುವುದು, ಫಿನೋಟೈಪ್ ಸಂಬಂಧಿತ SNP ಗಳು, QTL ಗಳು ಮತ್ತು ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು GWAS ಅನ್ನು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗೊಳಿಸಬಹುದು, ಇದು ಆಧುನಿಕ ಪ್ರಾಣಿ/ಸಸ್ಯ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಯನ್ನು ಬಲವಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ.SLAF ಸ್ವಯಂ-ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಸರಳೀಕೃತ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಡಿಸ್ಟ್ರಿಬ್ಯೂಟ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುತ್ತದೆ, SNP.ಈ SNP ಗಳು, ಆಣ್ವಿಕ ಆನುವಂಶಿಕ ಗುರುತುಗಳಾಗಿ, ಉದ್ದೇಶಿತ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗಾಗಿ ಸಂಸ್ಕರಿಸಬಹುದು.ಸಂಕೀರ್ಣ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವಲ್ಲಿ ಇದು ವೆಚ್ಚ-ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ.
-
ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ
ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಮತ್ತು ವೇರಿಯಬಲ್ ಪರ್ಯಾಯ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್‌ಗಳು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳಾಗಿವೆ.ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರಚನೆಗಳ ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮಾದರಿಗಳ ಆಳವಾದ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಆಧಾರವಾಗಿದೆ.ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಐಸೊಫಾರ್ಮ್-ಲೆವೆಲ್‌ಗೆ ತಂದಿದೆ.ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನಲ್ಲಿ ರಚಿಸಲಾದ RNA-Seq ಡೇಟಾವನ್ನು ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಜಿನೋಮ್ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಜೀನ್ ಮಟ್ಟ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಗುಣಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಸರ್ಕ್-ಆರ್ಎನ್ಎ
ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎ (ಸರ್ಕ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ) ಒಂದು ವಿಧದ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್ಎನ್ಎ, ಇದು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಶೀಲ, ಪರಿಸರ ಪ್ರತಿರೋಧ, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಸಿಕೊಂಡಿರುವ ನಿಯಂತ್ರಕ ಜಾಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುವುದು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ರೇಖೀಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ, ಉದಾ mRNA, lncRNA, 3′ ಮತ್ತು 5′ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸರ್ಕ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ತುದಿಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಎಕ್ಸೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್‌ನ ಜೀರ್ಣಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ಅವುಗಳನ್ನು ಉಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ರೇಖೀಯ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ.ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ CircRNA ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ.CircRNAಯು ceRNA ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಲ್ಲದು, ಇದು miRNAಯನ್ನು ಸ್ಪರ್ಧಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, miRNA ಸ್ಪಾಂಜ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ.ಸರ್ಕ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯು ಸರ್ಕ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಗುರಿ ಭವಿಷ್ಯ ಮತ್ತು ಇತರ ವಿಧದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ
-
ಬಿಎಸ್ಎ
ಬಲ್ಕ್ಡ್ ಸೆಗ್ರೆಗಂಟ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಒಂದು-ಹಂತದ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ಪ್ಯಾರಾಮೀಟರ್ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸುಧಾರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.BSA ಎನ್ನುವುದು ಫಿನೋಟೈಪ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸುವ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ.BSA ಯ ಮುಖ್ಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: 1. ಅತ್ಯಂತ ವಿರುದ್ಧವಾದ ಫಿನೋಟೈಪ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುವುದು;2. ಎಲ್ಲಾ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಡಿಎನ್‌ಎ, ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಎಸ್‌ಎಲ್‌ಎಎಫ್-ಸೆಕ್ (ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್‌ನಿಂದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ) ಅನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸಿ ಡಿಎನ್‌ಎಯ ಎರಡು ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುವುದು;3. ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಅಥವಾ ನಡುವೆ ವಿಭಿನ್ನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು, 4. ED ಮತ್ತು SNP-ಸೂಚ್ಯಂಕ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಮೂಲಕ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಿದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುವುದು;5. ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪುಷ್ಟೀಕರಣ, ಇತ್ಯಾದಿ. ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೈಮರ್ ವಿನ್ಯಾಸ ಸೇರಿದಂತೆ ಡೇಟಾದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸುಧಾರಿತ ಗಣಿಗಾರಿಕೆ ಸಹ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
