ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ
ಬಯೋಚಾರ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮತ್ತು ನಿಶ್ಚಲತೆಯು ಸುಧಾರಿತ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಅವನತಿ, ಮಣ್ಣಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಣೆ
ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ 16S ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ |PacBio ಹೈಫೈ |ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ |ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ
ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, PacBio ನಿಂದ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ 16S ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್ ಒದಗಿಸಿದೆ.
ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು
ಬಯೋಚಾರ್ ನಿಶ್ಚಲವಾಗಿರುವ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್-ಡಿಗ್ರೇಡಿಂಗ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಲ್ಕಾಲಿಜೆನ್ಸ್ ಫೇಕಾಲಿಸ್ WZ-2 ಅನ್ನು ಜೈವಿಕ ವಿಘಟನೆಯ ದಕ್ಷತೆಯ ಮೇಲೆ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಉಚಿತ ವಿಘಟನೆಯ ಸ್ಟ್ರೈನ್ WZ-2 ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಕಲುಷಿತ ಮಣ್ಣಿನ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ.
1. ಬಯೋಚಾರ್-ನಿಶ್ಚಲವಾದ WZ-2 18.7 ದಿನಗಳಿಂದ 13.3 ದಿನಗಳವರೆಗೆ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಅರ್ಧ-ಜೀವಿತಾವಧಿಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಉಚಿತ WZ-2 ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾದ ಅವನತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ.
2. ಬಯೋಚಾರ್-ನಿಶ್ಚಲವಾದ WZ-2 ಯೂರೇಸ್, ಡಿಹೈಡ್ರೋಜಿನೇಸ್ ಮತ್ತು ಇನ್ವರ್ಟೇಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಸ್ಥಳೀಯ ಮಣ್ಣಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಕಿಣ್ವ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳನ್ನು ಪುನಃಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು.
3. ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ 16S ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಬಯೋಚಾರ್-ನಿಶ್ಚಲವಾದ WZ-2 ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿರುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಮಾಲಿನ್ಯದ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಮುದಾಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮಣ್ಣಿನ ಆರೋಗ್ಯವನ್ನು ಪುನಃಸ್ಥಾಪಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಬಲವಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ರಯೋಗ (ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ)
ಗುಂಪುಗಾರಿಕೆ: ಸಿಕೆ: ನೈಸರ್ಗಿಕ ಮಣ್ಣು;ಟಿ: ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ನೊಂದಿಗೆ ಮೊನಚಾದ ಮಣ್ಣು;ಎಸ್: ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಉಚಿತ ಸ್ಟ್ರೈನ್ WZ-2 ನೊಂದಿಗೆ ಮಣ್ಣನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ;ಕ್ರಿ.ಪೂ: ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಬಯೋಚಾರ್ ಜೊತೆಗೆ ಮಣ್ಣನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ;BCS: ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಬಯೋಚಾರ್ ನಿಶ್ಚಲವಾದ WZ-2 ನೊಂದಿಗೆ ಮಣ್ಣನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
ಮಾದರಿ: 16S rDNA ಪ್ರೈಮರ್‌ಗಳಿಂದ ವರ್ಧಿಸಿದ ಒಟ್ಟು ಮಣ್ಣಿನ DNA ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) ಮತ್ತು 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ 16S rDNA ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ
ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ: PacBio RS II
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ: CCS HIFI ಓದುತ್ತದೆ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:BMKCloudಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮಿಂಗ್ ಗೋಲ್ಡ್ ಫಿಷ್ ಅನ್ನು ಮೀನಿನ ಶರೀರಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ವಿಕಸನಕ್ಕೆ ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾದ ಆನುವಂಶಿಕ ಮಾದರಿಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ಫಲಿತಾಂಶ
ಮಣ್ಣಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯ ರಚನೆಯನ್ನು 16S rDNA ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು.OTU ಶ್ರೀಮಂತಿಕೆ ಮತ್ತು ಆಲ್ಫಾ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಇಂಡೆಕ್ಸ್, Chao1, Ace, Shannon ಮತ್ತು Simpson ಸೂಚ್ಯಂಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರತಿ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿನ ಜಾತಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲಾಯಿತು.60 ದಿನಗಳ ಕಾವು ನಂತರ, ಎಲ್ಲಾ ಸೂಚ್ಯಂಕಗಳು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಪ್ರವೃತ್ತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ, ಅಂದರೆ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಜಾತಿಯ ಶ್ರೀಮಂತಿಕೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಸ್ಟ್ರೈನ್ WZ-2 ಅನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಮಣ್ಣಿನ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಸಮುದಾಯವನ್ನು ಶ್ರೀಮಂತತೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಭಾಗಶಃ ಮರುಪಡೆಯಲಾಯಿತು.BC, BCS ಮತ್ತು CK ನಡುವೆ ಸೀಮಿತ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಯಿತು, ಇದು ಬಯೋಚಾರ್ ಮತ್ತು ಬಯೋಚಾರ್-ನಿಶ್ಚಲವಾದ WZ-2 ಮಣ್ಣಿನ ಜೈವಿಕ ಆರೋಗ್ಯವನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಪುನಃಸ್ಥಾಪಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಗುಂಪುಗಳ ನಡುವೆ ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಲು ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಅಂಕಗಣಿತದ ವಿಧಾನಗಳೊಂದಿಗೆ (UPGMA) ತೂಕವಿಲ್ಲದ ಜೋಡಿ-ಗುಂಪು ವಿಧಾನವನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗಿದೆ.ಕೆಳಗಿನ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ, BC, BSC ಮತ್ತು CK ಗುಂಪು T ಮತ್ತು S ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್-ಕಲುಷಿತ ಮಣ್ಣಿನ ಬಯೋರೆಮಿಡಿಯೇಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಬಯೋಚಾರ್‌ನ ಪರಿಚಯವು ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯದ ಚೇತರಿಕೆಗೆ ಬಹುಮಟ್ಟಿಗೆ ಅನುಕೂಲವಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಚಿತ್ರ.ವಿಭಿನ್ನ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಫೈಲಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಸಮುದಾಯದ UPGMA ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್
ಉಲ್ಲೇಖ
ಸನ್, ಟಾಂಗ್, ಮತ್ತು ಇತರರು."ಬಯೋಚಾರ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮತ್ತು ನಿಶ್ಚಲತೆ ಸುಧಾರಿತ ಟೆಬುಕೊನಜೋಲ್ ಅವನತಿ, ಮಣ್ಣಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಣೆ."ಅಪಾಯಕಾರಿ ವಸ್ತುಗಳ ಜರ್ನಲ್398 (2020): 122941.
ಸುದ್ದಿ ಮತ್ತು ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು ಇತ್ತೀಚಿನ ಯಶಸ್ವಿ ಪ್ರಕರಣಗಳನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಕಾದಂಬರಿ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಧನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಧ್ಯಯನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅನ್ವಯಿಸಲಾದ ಪ್ರಮುಖ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದು.
ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜನವರಿ-08-2022