ಸುದ್ದಿ

ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸಬಲ್ ಎಲಿಮೆಂಟ್ (TE) ವರ್ಧನೆಯು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ವಿಕಸನದ ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಚಾಲನಾ ಶಕ್ತಿ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಆದರೆ 3D ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಪರಿಣಾಮಗಳು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ತಿಳಿದಿಲ್ಲ.ಇಲ್ಲಿ, ನಾವು ಮೂರು ಜಾತಿಯ ಹತ್ತಿಗೆ ರೆಫರೆನ್ಸ್-ಗ್ರೇಡ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಳನ್ನು ವರದಿ ಮಾಡುತ್ತೇವೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಮೂರು ಪಟ್ಟುಗಾಸಿಪಿಯಮ್ ರೋಟುಂಡಿಫೋಲಿಯಮ್(ಕೆ2),ಜಿ. ಅರ್ಬೋರಿಯಮ್(A2), ಮತ್ತುಜಿ. ರೈಮಂಡಿ(D5), ಆಕ್ಸ್‌ಫರ್ಡ್ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್ ಬಳಸಿ.ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ದೊಡ್ಡ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಗೆ (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುವ ವಂಶವಾಹಿ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ TE ವರ್ಧನೆಯ ವಿವರಗಳನ್ನು ದಾಖಲಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ನಡುವೆ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಜೀನ್ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಸರಿಸುಮಾರು 17% ಸಿಂಟೆನಿಕ್ ಜೀನ್‌ಗಳು ಸಕ್ರಿಯ (“A”) ಮತ್ತು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ (“B”) ವಿಭಾಗಗಳ ನಡುವೆ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಯ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ನಾವು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು TE ವರ್ಧನೆಯು ಜೀನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ (~ 7,000 ಜೀನ್‌ಗಳು) A ವಿಭಾಗದ ಅನುಪಾತದ ಹೆಚ್ಚಳದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ) D5 ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ K2 ಮತ್ತು A2 ನಲ್ಲಿ.ಮೂರು ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಕೇವಲ 42% ಟೊಪೋಲಾಜಿಕಲ್ ಅಸೋಸಿಯೇಟಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ (TAD) ಗಡಿಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ.ವಂಶವಾಹಿ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ TAD ಗಡಿಗಳ ರಚನೆಯ ನಂತರ TE ಗಳ ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಧನೆಯನ್ನು ನಮ್ಮ ಡೇಟಾ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಅಧ್ಯಯನವು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ಉನ್ನತ-ಕ್ರಮದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಪೋಸನ್-ಮಧ್ಯಸ್ಥ ಜೀನೋಮ್ ವಿಸ್ತರಣೆಯ ಪಾತ್ರದ ಮೇಲೆ ಬೆಳಕು ಚೆಲ್ಲುತ್ತದೆ.