ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ರೈ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕೃಷಿಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಪ್ರಮುಖ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಎತ್ತಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ

ಜಿನೋಮ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್

ಪ್ರಕೃತಿ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ

ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ರೈ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕೃಷಿಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಪ್ರಮುಖ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಎತ್ತಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ

ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್ ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಿಯೋ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್, ಹೈ-ಸಿ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ತಾಂತ್ರಿಕ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ಒದಗಿಸಿದೆ.

ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು

1.ಮೊದಲ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮಲ್-ಮಟ್ಟದ ಉನ್ನತ ಗುಣಮಟ್ಟದ ರೈ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ, ಇದು 1 Gb ಗಿಂತ ದೊಡ್ಡದಾದ ಒಂದೇ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.

2. Tu, Aet ಮತ್ತು Hv ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ರೈ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಇತ್ತೀಚಿನ LTR-RT ಘಟನೆಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ರೈ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ ವಿಸ್ತರಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ.

3.ರೈ ಮತ್ತು ಡಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಗೋಧಿಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ಗೋಧಿಯಿಂದ ಬಾರ್ಲಿಯನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಿದ ನಂತರ ನಡೆಯಿತು, ಎರಡು ಘಟನೆಗಳ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಸಮಯವು ಸರಿಸುಮಾರು 9.6 ಮತ್ತು 15 MYA ಆಗಿರುತ್ತದೆ.
ಎಫ್‌ಟಿ ಜೀನ್‌ಗಳ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ರೈಯಲ್ಲಿನ ಆರಂಭಿಕ ಶಿರೋನಾಮೆ ಲಕ್ಷಣವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಬಹುದು.

4.ಸೆಲೆಕ್ಟಿವ್ ಸ್ವೀಪ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಶಿರೋನಾಮೆ ದಿನಾಂಕದ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ScID1 ನ ಸಂಭವನೀಯ ಒಳಗೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರೈನಲ್ಲಿ ಪಳಗಿಸುವಿಕೆಯಿಂದ ಅದರ ಸಂಭವನೀಯ ಆಯ್ಕೆ
ಹಿನ್ನೆಲೆ

ಹಿನ್ನೆಲೆ

ರೈ ಒಂದು ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಆಹಾರ ಮತ್ತು ಮೇವಿನ ಬೆಳೆಯಾಗಿದೆ, ಗೋಧಿ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಟಿಕೇಲ್ ಸುಧಾರಣೆಗೆ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಪನ್ಮೂಲವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹುಲ್ಲುಗಳಲ್ಲಿ ಸಮರ್ಥ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಅನಿವಾರ್ಯ ವಸ್ತುವಾಗಿದೆ.ವೀನಿಂಗ್ ರೈ, ಚೀನಾದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಸಲಾಗುವ ಆರಂಭಿಕ ಹೂಬಿಡುವ ವಿಧ, ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮತ್ತು ಪಟ್ಟೆ ತುಕ್ಕು ಎರಡಕ್ಕೂ ಅದರ ವಿಶಾಲ-ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಮ್ ಪ್ರತಿರೋಧದಿಂದಾಗಿ ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿದೆ.ರೈ ಎಲೈಟ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಆನುವಂಶಿಕ ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಆಧಾರವನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಮತ್ತು ರೈ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಬೆಳೆಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಮತ್ತು ಬ್ರೀಡಿಂಗ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸಲು, ನಾವು ಇಲ್ಲಿ ವೈನಿಂಗ್ ರೈ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ್ದೇವೆ.

ಸಾಧನೆಗಳು

ರೈ ಜಿನೋಮ್

ರೈ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು PacBio SMRT ರೀಡ್‌ಗಳು, ಶಾರ್ಟ್-ರೀಡ್ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್, ಜೊತೆಗೆ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಕಾನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ ಕ್ಯಾಪ್ಚರ್ (ಹೈ-ಸಿ), ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಬಯೋನಾನೊ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ.ಜೋಡಿಸಲಾದ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳು (7.74 ಜಿಬಿ) ಅಂದಾಜು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ (7.86 ಜಿಬಿ) 98.47% ರಷ್ಟಿದೆ, ಜೊತೆಗೆ 93.67% ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳು (7.25 ಜಿಬಿ) ಏಳು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ನಿಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ.ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅಂಶಗಳು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿದ ಜೀನೋಮ್‌ನ 90.31% ರಷ್ಟಿದೆ.

ರೈ ಜಿನೋಮ್

ಜೆನೆಟಿಕ್ ಲಿಂಕೇಜ್ ಮ್ಯಾಪ್ (WJ) ಎರಡು ರೈ ಲ್ಯಾಂಡ್‌ರೇಸ್‌ಗಳ ದಾಟುವಿಕೆಯಿಂದ ಪಡೆದ 295 F2 ಸಸ್ಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ (ವೈನಿಂಗ್ × ಜಿಂಗ್‌ಝೌ)

ಏಳು ಜೋಡಿಸಲಾದ ವೀನಿಂಗ್ ರೈ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಹೈ-ಸಿ ಸಂಪರ್ಕ ನಕ್ಷೆ (1R - 7R)

Lo7 x Lo255 RIL ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾದ ವೀನಿಂಗ್ ರೈ ಮತ್ತು ಏಳು ರೈ ಲಿಂಕೇಜ್ ಗುಂಪುಗಳ ಏಳು ಜೋಡಿಸಲಾದ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ನಡುವಿನ ಜೋಡಣೆ

ರೈ ಜೀನೋಮ್‌ನ LTR ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಸೂಚ್ಯಂಕ (LAI) ಮೌಲ್ಯವು 18.42 ಮತ್ತು 1,440 BUSCO ಜೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ 1,393 (96.74%) ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಜೆನಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು.45,596 ಅಧಿಕ-ವಿಶ್ವಾಸ (HC) ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು 41,395 ಕಡಿಮೆ-ವಿಶ್ವಾಸದ ಜೀನ್‌ಗಳು (LC) ಜೀನ್‌ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಒಟ್ಟು 86,991 ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ.

2. ಟಿಇಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

TE ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ.537 ಕುಟುಂಬಗಳಿಗೆ ಸೇರಿದ 2,671,941 ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಒಟ್ಟು 6.99 Gb, 90.31% ವೈನಿಂಗ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, TE ಗಳಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.ಈ TE ವಿಷಯವು ಈ ಹಿಂದೆ Ta (84.70%), Tu (81.42%), Aet (84.40%), WEW (82.20%), ಅಥವಾ Hv (80.80%) ಗಿಂತ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿದೆ.ಜಿಪ್ಸಿ, ಕಾಪಿಯಾ ಮತ್ತು ವರ್ಗೀಕರಿಸದ RT ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ದೀರ್ಘ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳು (LTR-RTs) ಪ್ರಬಲ TE ಗಳು, ಮತ್ತು 1 84.49% ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಿದ TE ವಿಷಯ ಮತ್ತು 76.29 % ಜೋಡಿಸಲಾದ ವೀನಿಂಗ್ ಜಿನೋಮ್;ಕ್ಯಾಕ್ಟಾ ಡಿಎನ್‌ಎ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಪೋಸನ್‌ಗಳು ಎರಡನೇ ಅತಿ ಹೆಚ್ಚು TE ಗಳಾಗಿದ್ದು, 11.68% ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ TE ವಿಷಯ ಮತ್ತು 10.55 % ಜೋಡಣೆಗೊಂಡ ವೀನಿಂಗ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ.

ರೈಯ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಅಂಶಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ವೀನಿಂಗ್ ರೈಯು LTR-RT ಗಳ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಳವಡಿಕೆಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ವರ್ಧನೆಯ ಉತ್ತುಂಗವು ಸುಮಾರು 0.5 ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿತು (MYA), ಇದು ನಾಲ್ಕು ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನದು;ಇನ್ನೊಂದು ಶಿಖರವು ಸರಿಸುಮಾರು 1.7 MYA ಯಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸಿತು, ಇದು ಹಳೆಯದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಬಾರ್ಲಿಯಲ್ಲಿಯೂ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ.ಸೂಪರ್‌ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ, 0.3 MYA ನಲ್ಲಿ ವೈನಿಂಗ್ ರೈನಲ್ಲಿನ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸ್ಫೋಟಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಆದರೆ ಜಿಪ್ಸಿ RT ಗಳ ವರ್ಧನೆಗಳು LTR-RT ಬರ್ಸ್ಟ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್‌ನ ಬೈಮೋಡಲ್ ವಿತರಣಾ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಪ್ರಬಲವಾಗಿ ರೂಪಿಸಿದವು.

3. ರೈ ಜೀನೋಮ್ ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಸಿಂಟೆನಿಗಳ ತನಿಖೆ

ರೈ ಮತ್ತು ಡಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಗೋಧಿಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ಗೋಧಿಯಿಂದ ಬಾರ್ಲಿಯನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಿದ ನಂತರ ನಡೆಯಿತು, ಎರಡು ಘಟನೆಗಳ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಸಮಯಗಳು ಕ್ರಮವಾಗಿ 9.6 ಮತ್ತು 15 MYA ಆಗಿವೆ.1R, 2R, 3R ಗೋಧಿಯ 1, 2 ಮತ್ತು 3 ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಕೊಲಿನಿಯರ್ ಆಗಿದ್ದವು.4R, 5R, 6R, 7R ಕಂಡುಬಂದಿವೆ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳು ಮತ್ತು ವಿಭಾಗಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ.

4. ಜೀನ್ ನಕಲುಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪಿಷ್ಟ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಜೀನ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಅವುಗಳ ಪ್ರಭಾವ

ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ, ವೀನಿಂಗ್ ರೈಯ ಟಂಡೆಮ್ಲಿ ಡುಪ್ಲಿಕೇಟೆಡ್ ಜೀನ್‌ಗಳು (ಟಿಡಿಜಿಗಳು) ಮತ್ತು ಪ್ರಾಕ್ಸಿಮಲಿ ಡ್ಯೂಪ್ಲಿಕೇಟೆಡ್ ಜೀನ್‌ಗಳು (ಪಿಡಿಜಿಗಳು) Tu, Aet, Hv, Bd ಮತ್ತು Os ಗಾಗಿ ಕಂಡುಬಂದವುಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿವೆ.ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸ್ಡ್ ಡುಪ್ಲಿಕೇಟೆಡ್ ಜೀನ್ಗಳು (TrDG ಗಳು) ವಿಶೇಷವಾಗಿ Tu ಮತ್ತು Aet ಗಾಗಿ ಕಂಡುಬಂದವುಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿವೆ.ರೈ ಜೀನೋಮ್ ವಿಸ್ತರಣೆಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಜೀನ್ ನಕಲುಗಳೊಂದಿಗೆ ಇರುತ್ತದೆ.ರೈಯಲ್ಲಿನ ಹೆಚ್ಚಿದ TE ಸ್ಫೋಟಗಳು TrDG ಗಳ ಎತ್ತರದ ಸಂಖ್ಯೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.

ರೈ ಜೀನೋಮ್‌ನ ವಿಕಸನೀಯ ಮತ್ತು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಸಿಂಟೆನಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು

ರೈ ಜೀನ್ ನಕಲುಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪಿಷ್ಟ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್‌ಗಳ (SBRGs) ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೇಲೆ ಅವುಗಳ ಪ್ರಭಾವ

5. ರೈ ಸೀಡ್ ಸ್ಟೋರೇಜ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ (SSP) ಜೀನ್ ಲೊಕಿಯ ವಿಭಜನೆ

1R ಅಥವಾ 2R ನಲ್ಲಿ ರೈ SSP ಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುವ ನಾಲ್ಕು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮಲ್ ಲೊಕಿಗಳನ್ನು (Sec-1 ರಿಂದ Sec-4) ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ.α-ಗ್ಲಿಯಾಡಿನ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಗೋಧಿ ಮತ್ತು ರೈಯಿಂದ ಗೋಧಿಯ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ನಂತರ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡವು.

6. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶ (TF) ಮತ್ತು ರೋಗ ನಿರೋಧಕ ಜೀನ್‌ಗಳ ಪರೀಕ್ಷೆ

ರೈ ಸೆಕಾಲಿನ್ ಲೊಕಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ವೀನಿಂಗ್ ರೈಯು Tu (1,621), Aet (1,758), Hv (1,508), Bd (1,178), Os (1,575), ಮತ್ತು A (1,836) ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ರೋಗ ನಿರೋಧಕ ಸಂಬಂಧಿತ (DRA) ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು (1,989, ಪೂರಕ ಡೇಟಾ 3) ಹೊಂದಿತ್ತು. ), ಬಿ (1,728) ಮತ್ತು D (1,888) ಸಾಮಾನ್ಯ ಗೋಧಿಯ ಉಪಕುಲಗಳು.

7. ಆರಂಭಿಕ ಶಿರೋನಾಮೆ ಲಕ್ಷಣದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ತನಿಖೆ

ದೀರ್ಘ ದಿನದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡು FT ಜೀನ್‌ಗಳು, ScFT1 ಮತ್ತು ScFT2, ವೈನಿಂಗ್ ಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯಲ್ಲಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.ScFT2 (S76 ಮತ್ತು T132) ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್‌ನ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಸಮಯ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು

ವೈನಿಂಗ್ ರೈನ ಆರಂಭಿಕ ಶಿರೋನಾಮೆ ಲಕ್ಷಣದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು

8. ರೈ ಪಳಗಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ವರ್ಣತಂತು ಪ್ರದೇಶಗಳು ಮತ್ತು ಲೊಕಿಗಳ ಗಣಿಗಾರಿಕೆ

ಕೃಷಿ ಮಾಡಿದ ರೈ ಮತ್ತು S. vavilovii ನಡುವೆ ಸೆಲೆಟಿವ್ ಸ್ವೀಪ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ನಡೆಸಲು ಒಟ್ಟು 123,647 SNP ಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ.ಕಡಿತ ಸೂಚ್ಯಂಕ (DRI), ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಸೂಚ್ಯಂಕ (FST) ಮತ್ತು XP-CLR ವಿಧಾನದಿಂದ ಗುರುತಿಸಲಾದ 11 ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಸಂಕೇತಗಳು.ಶಿರೋನಾಮೆ ದಿನಾಂಕದ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ScID1 ಸಂಭವನೀಯ ಒಳಗೊಳ್ಳುವಿಕೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ.

ಕ್ರೋಮೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ರೈ ಪಳಗಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಸ್ಥಳಗಳು

ಉಲ್ಲೇಖ

ಲಿ ಜಿಡಬ್ಲ್ಯೂ ಮತ್ತು ಇತರರು.ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ರೈ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕೃಷಿಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಪ್ರಮುಖ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಎತ್ತಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ (2021)

ಸುದ್ದಿ ಮತ್ತು ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು ಇತ್ತೀಚಿನ ಯಶಸ್ವಿ ಪ್ರಕರಣಗಳನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಕಾದಂಬರಿ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಧನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಧ್ಯಯನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅನ್ವಯಿಸಲಾದ ಪ್ರಮುಖ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದು.

ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜನವರಿ-05-2022