ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ನ್ಯಾನೊಪೋರ್
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೋಡಣೆ-ಜಾತಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವುದು
● ಮುಚ್ಚಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ
● ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಶಕ್ತಿಯುತ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್, ಉದಾ ರೋಗಕಾರಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಪತ್ತೆ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಜೀವಕ ನಿರೋಧಕ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್‌ಗಳು
● ತುಲನಾತ್ಮಕ ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ವೇದಿಕೆ | ಅನುಕ್ರಮ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ತಿರುವು ಸಮಯ |
| ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ | ONT | 6 ಜಿ/10 ಜಿ | 65 ಕೆಲಸದ ದಿನಗಳು |
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು
● ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
● ಅನಗತ್ಯ ಜೀನ್ ಸೆಟ್ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ
● ಜಾತಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಆನುವಂಶಿಕ ಕ್ರಿಯೆಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಅಂಶಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ಫಾರ್ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಮೊತ್ತ | ಏಕಾಗ್ರತೆ | ಶುದ್ಧತೆ |
| ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು | 1-1.5 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಗಾಗಿ:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿಧಾನ |
| ಮಣ್ಣು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಉಳಿದಿರುವ ಕಳೆಗುಂದಿದ ವಸ್ತುವನ್ನು ಮೇಲ್ಮೈಯಿಂದ ತೆಗೆದುಹಾಕಬೇಕಾಗಿದೆ;ದೊಡ್ಡ ತುಂಡುಗಳನ್ನು ಪುಡಿಮಾಡಿ ಮತ್ತು 2 ಮಿಮೀ ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಸೈರೋಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಅಲಿಕ್ವಾಟ್ ಮಾದರಿಗಳು. |
| ಮಲ | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕರುಳಿನ ವಿಷಯಗಳು | ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಬೇಕಾಗಿದೆ.ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ಅಂಗಾಂಶವನ್ನು PBS ನೊಂದಿಗೆ ತೊಳೆಯಿರಿ;PBS ಅನ್ನು ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು EP-ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅವಕ್ಷೇಪಕವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕೆಸರು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಕೆಸರು ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ |
| ಜಲಮೂಲ | ಟ್ಯಾಪ್ ನೀರು, ಬಾವಿ ನೀರು, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಸೀಮಿತ ಪ್ರಮಾಣದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಮಾದರಿಗಾಗಿ, ಕನಿಷ್ಠ 1 ಲೀ ನೀರನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಪೊರೆಯ ಮೇಲೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಸಮೃದ್ಧಗೊಳಿಸಲು 0.22 μm ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ.ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಪೊರೆಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಚರ್ಮ | ಕ್ರಿಮಿನಾಶಕ ಹತ್ತಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್ ಅಥವಾ ಸರ್ಜಿಕಲ್ ಬ್ಲೇಡ್‌ನಿಂದ ಚರ್ಮದ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಕೆರೆದು ಅದನ್ನು ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿ. |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
3-4 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಫ್ರೀಜ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕ ಅಥವಾ -80 ಡಿಗ್ರಿಯಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘಕಾಲ ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ.ಡ್ರೈ-ಐಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಶಿಪ್ಪಿಂಗ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
1.ಹೀಟ್‌ಮ್ಯಾಪ್: ಜಾತಿಯ ಶ್ರೀಮಂತಿಕೆ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್
2.ಕೆಇಜಿಜಿ ಮೆಟಬಾಲಿಕ್ ಪಾಥ್‌ವೇಸ್‌ಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್‌ಗಳು
3.ಜಾತಿಗಳ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಜಾಲ
4. CARD ಪ್ರತಿಜೀವಕ ನಿರೋಧಕ ಜೀನ್‌ಗಳ ಸರ್ಕೋಸ್
ಬಿಎಂಕೆ ಪ್ರಕರಣ
ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕೆಳ ಉಸಿರಾಟದ ಸೋಂಕಿನ ತ್ವರಿತ ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ರೋಗನಿರ್ಣಯವನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ
ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ:ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ, 2019
ತಾಂತ್ರಿಕ ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು
ಅನುಕ್ರಮ: ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮಿನಿಯಾನ್
ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್: ಹೋಸ್ಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಡಿಪ್ಲೀಶನ್, WIMP ಮತ್ತು ARMA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ತ್ವರಿತ ಪತ್ತೆ: 6 ಗಂಟೆಗಳು
ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂವೇದನೆ: 96.6%
ಪ್ರಮುಖ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು
2006 ರಲ್ಲಿ, ಕಡಿಮೆ ಉಸಿರಾಟದ ಸೋಂಕು (LR) ಜಾಗತಿಕವಾಗಿ 3 ಮಿಲಿಯನ್ ಮಾನವ ಸಾವಿಗೆ ಕಾರಣವಾಯಿತು.LR1 ರೋಗಕಾರಕ ಪತ್ತೆಗೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ವಿಧಾನವೆಂದರೆ ಕೃಷಿ, ಇದು ಕಳಪೆ ಸಂವೇದನೆ, ದೀರ್ಘಾವಧಿಯ ಸಮಯ ಮತ್ತು ಆರಂಭಿಕ ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯಲ್ಲಿ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನದ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ತ್ವರಿತ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ರೋಗನಿರ್ಣಯವು ಬಹಳ ಹಿಂದಿನಿಂದಲೂ ತುರ್ತು ಅಗತ್ಯವಾಗಿದೆ.ಈಸ್ಟ್ ಆಂಗ್ಲಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಡಾ. ಜಸ್ಟಿನ್ ಮತ್ತು ಅವರ ಪಾಲುದಾರರು ರೋಗಕಾರಕ ಪತ್ತೆಗಾಗಿ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದರು.ಅವರ ಕೆಲಸದ ಹರಿವಿನ ಪ್ರಕಾರ, 99.99% ಹೋಸ್ಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಖಾಲಿಯಾಗಬಹುದು.ರೋಗಕಾರಕಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಜೀವಕ ನಿರೋಧಕ ಜೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಪತ್ತೆಯನ್ನು 6 ಗಂಟೆಗಳಲ್ಲಿ ಮುಗಿಸಬಹುದು.
ಉಲ್ಲೇಖ
ಚರಲಾಂಪಸ್, ಟಿ., ಕೇ, ಜಿಎಲ್, ರಿಚರ್ಡ್‌ಸನ್, ಎಚ್., ಐಡಿನ್, ಎ., & ಒ'ಗ್ರಾಡಿ, ಜೆ.(2019)ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕೆಳ ಉಸಿರಾಟದ ಸೋಂಕಿನ ತ್ವರಿತ ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ರೋಗನಿರ್ಣಯವನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ, 37(7), 1.
