ದೀರ್ಘ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮ-ಇಲ್ಯುಮಿನಾ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮತ್ತು ಅಂಗಾಂಶ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ
● ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಂತವು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತದೆ
● ಸಮಯ ಮತ್ತು ಬಾಹ್ಯಾಕಾಶ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ನಿಖರ ಮಾದರಿಗಳು
● mRNA ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ.
● BMKCloud ಆಧಾರಿತ ಫಲಿತಾಂಶ ವಿತರಣೆ: ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ಡೇಟಾ-ಮೈನಿಂಗ್ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
● ಯೋಜನೆ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ನಂತರ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು 3 ತಿಂಗಳವರೆಗೆ ಮಾನ್ಯವಾಗಿರುತ್ತವೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ವೇದಿಕೆ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ಡೇಟಾ QC |
| ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಸವಕಳಿ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 | 10 ಜಿಬಿ | Q30≥85% |
| Conc.(ng/μl) | ಮೊತ್ತ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್‌ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್‌ಎ ಮಾಲಿನ್ಯವನ್ನು ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥6.5; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಬೇಸ್‌ಲೈನ್ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳು:
ಅಂಗಾಂಶ: ತೂಕ(ಶುಷ್ಕ): ≥1 ಗ್ರಾಂ
*5 ಮಿಗ್ರಾಂಗಿಂತ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿರುವ ಅಂಗಾಂಶಗಳಿಗೆ, ಫ್ಲ್ಯಾಶ್ ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟಿದ (ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ) ಅಂಗಾಂಶ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಕಳುಹಿಸಲು ನಾವು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.
ಸೆಲ್ ಅಮಾನತು: ಸೆಲ್ ಎಣಿಕೆ = 3×107
*ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟಿದ ಕೋಶ ಲೈಸೇಟ್ ಅನ್ನು ಸಾಗಿಸಲು ನಾವು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.ಆ ಕೋಶವು 5×10 ಕ್ಕಿಂತ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದ್ದರೆ5, ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಘನೀಕರಿಸಿದ ಫ್ಲಾಶ್ ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.
ರಕ್ತದ ಮಾದರಿಗಳು:
PA×ಜೀನ್ ಬ್ಲಡ್ ಆರ್ಎನ್ಎಟ್ಯೂಬ್;
6mLTRIzol ಮತ್ತು 2mL ರಕ್ತ(TRIzol:Blood=3:1)
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೈನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
ಸಾಗಣೆ:
1.ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಸ್ಯಾಂಪಲ್‌ಗಳನ್ನು ಬ್ಯಾಗ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಬೇಕು ಮತ್ತು ಡ್ರೈ ಐಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2.ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
1.LncRNA ವರ್ಗೀಕರಣ
ಮೇಲಿನ ನಾಲ್ಕು ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್‌ಗಳಿಂದ ಊಹಿಸಲಾದ LncRNA ಯನ್ನು 4 ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ: lincRNA, anti-sense-LncRNA, intronic-LncRNA;ಅರ್ಥ-LncRNA.ಕೆಳಗಿನ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್‌ನಲ್ಲಿ LncRNA ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.
LncRNA ವರ್ಗೀಕರಣ
2.DE-lncRNA ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ Cis-ಉದ್ದೇಶಿತ ಜೀನ್‌ಗಳು
ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಘಟಕಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾದ lncRNA (DE-lncRNA) ಯ ಸಿಸ್-ಉದ್ದೇಶಿತ ಜೀನ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ GO ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್‌ಪ್ರೊಫೈಲರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ.GO ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ DEG-ನಿರ್ದೇಶಿತ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ GO ಪದಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ.ಕೆಳಗೆ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್, ಬಬಲ್ ಚಾರ್ಟ್ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಪದಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.
DE-lncRNA ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ Cis-ಉದ್ದೇಶಿತ ಜೀನ್‌ಗಳು -ಬಬಲ್ ಚಾರ್ಟ್
3. mRNA ಮತ್ತು lncRNA ಯ ಉದ್ದ, ಎಕ್ಸಾನ್ ಸಂಖ್ಯೆ, ORF ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ ಮೂಲಕ, ರಚನೆ, ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ನಾವು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು ಮತ್ತು ನಾವು ಊಹಿಸಿದ ಕಾದಂಬರಿ lncRNA ಸಾಮಾನ್ಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿದೆಯೇ ಎಂದು ಪರಿಶೀಲಿಸಬಹುದು.
ಬಿಎಂಕೆ ಪ್ರಕರಣ
KRAS-G12D ರೂಪಾಂತರ ಮತ್ತು P53 ನಾಕ್‌ಔಟ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಮೌಸ್ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಅಡಿನೊಕಾರ್ಸಿನೋಮಗಳಲ್ಲಿ ಅನಿಯಂತ್ರಿತ lncRNA ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್
ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ:ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮತ್ತು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮೆಡಿಸಿನ್,2019
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ
ಮಾದರಿ ಸಂಗ್ರಹ
NONMMUT015812-ನಾಕ್‌ಡೌನ್ KP (shRNA-2) ಜೀವಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಣ (sh-Scr) ಕೋಶಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವೈರಲ್ ಸೋಂಕಿನ ದಿನ 6 ರಂದು ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ.
ಪ್ರಮುಖ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು
ಈ ಅಧ್ಯಯನವು P53 ನಾಕೌಟ್ ಮತ್ತು KrasG12D ರೂಪಾಂತರದೊಂದಿಗೆ ಮೌಸ್ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಅಡಿನೊಕಾರ್ಸಿನೋಮದಲ್ಲಿ ಅಸಹಜವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ lncRNA ಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
1.6424 lncRNA ಗಳನ್ನು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ (≥ 2-ಪಟ್ಟು ಬದಲಾವಣೆ, P <0.05).
2.ಎಲ್ಲಾ 210 lncRNA ಗಳಲ್ಲಿ (FC≥8), 11 lncRNA ಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಕ್ರಮವಾಗಿ P53, 33 lncRNA ಗಳು KRAS ಮತ್ತು 13 lncRNA ಗಳನ್ನು ಹೈಪೋಕ್ಸಿಯಾದಿಂದ ಪ್ರಾಥಮಿಕ KP ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
3.NONMMUT015812, ಇದು ಮೌಸ್ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಅಡಿನೊಕಾರ್ಸಿನೋಮದಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಮತ್ತು P53 ಮರು-ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಿಂದ ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅದರ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಗಿದೆ.
4. shRNAಗಳಿಂದ NONMMUT015812 ನ ನಾಕ್‌ಡೌನ್ KP ಕೋಶಗಳ ಪ್ರಸರಣ ಮತ್ತು ವಲಸೆ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿತು.NONMMUT015812 ಸಂಭಾವ್ಯ ಆಂಕೊಜೀನ್ ಆಗಿತ್ತು.
 NONMMUT015812-ನಾಕ್‌ಡೌನ್ KP ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳ KEGG ಮಾರ್ಗ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ |  NONMMUT015812-ನಾಕ್‌ಡೌನ್ KP ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ |
ಉಲ್ಲೇಖ
KRAS-G12D ರೂಪಾಂತರ ಮತ್ತು P53 ನಾಕ್‌ಔಟ್[J] ನೊಂದಿಗೆ ಮೌಸ್ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಅಡಿನೊಕಾರ್ಸಿನೋಮಗಳಲ್ಲಿ ಅನಿಯಂತ್ರಿತ lncRNA ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್.ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮತ್ತು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮೆಡಿಸಿನ್, 2019, 23(10).DOI: 10.1111/jcmm.14584
