ವೇದಿಕೆ | ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ಗಾತ್ರ | ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಡೇಟಾ ಇಳುವರಿ (ಪ್ರತಿ ಕೋಶಕ್ಕೆ) | ಏಕ-ಮೂಲ ನಿಖರತೆ | ಅರ್ಜಿಗಳನ್ನು |
ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ | 8Kb, 10kb, 20kb, ಅಲ್ಟ್ರಾಲಾಂಗ್, cDNA-PCR | 70-90Gb/ಸೆಲ್ | 85-92% | SV ಕರೆ, ಡಿ ನೋವೊ, ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮ, Iso-Seq, ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ, DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಪತ್ತೆ |
● ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಾವಿರಾರು ಮುಚ್ಚಿದ ಯೋಜನೆಗಳೊಂದಿಗೆ PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ನಲ್ಲಿ 5 ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವ.
● BMKGENE ಡ್ಯುಯಲ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಆರ್ಎನ್ಎ/ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣದೊಂದಿಗೆ ಆಕ್ಸ್ಫರ್ಡ್ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ನ ಅಧಿಕೃತ ಪಾಲುದಾರ.
● ಸಂಪೂರ್ಣ ಉಪಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಕಷ್ಟು ಅನುಕ್ರಮ ಥ್ರೋಪುಟ್ನೊಂದಿಗೆ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸರ್ಗಳ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ಮಾದರಿಗಳಿವೆ.
● ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, 10 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಾಣಿ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯ ಡೆನೊವೊ ಸಂಶೋಧನೆಗಳು ಅಂತರಾಷ್ಟ್ರೀಯವಾಗಿ ಪ್ರಸಿದ್ಧ ಜರ್ನಲ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾಗಿವೆ.
ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಮೊತ್ತ | ಏಕಾಗ್ರತೆ(ಕ್ವಿಟ್ ®) | ಸಂಪುಟ | ಶುದ್ಧತೆ | ಇತರರು |
ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ | ಡೇಟಾ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm ನಲ್ಲಿ ಗರಿಷ್ಠವನ್ನು ತೆರವುಗೊಳಿಸಿ, ಯಾವುದೇ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ | ಕ್ವಿಟ್ ಮತ್ತು ಕ್ವಿಟ್/ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ≤ 2 ಮೂಲಕ ಏಕಾಗ್ರತೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಅಗತ್ಯವಿದೆ |
ಒಟ್ಟು RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5; ಮಾಲಿನ್ಯಗಳಿಲ್ಲ | RIN ಮೌಲ್ಯ ≥7.5 |
DNA ಮಾದರಿಯ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
ಕೋಷ್ಟಕ 1. ಕ್ಲೀನ್ ಡೇಟಾದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | ಕ್ಲೀನ್ಸಮ್ಬೇಸ್ | cleanN50Len | cleanN90Len | ಕ್ಲೀನ್ ಮೀನ್ ಲೆನ್ | ಕ್ಲೀನ್ಮ್ಯಾಕ್ಸ್ಲೆನ್ | ಕ್ಲೀನ್ ಮೀನ್ ಕ್ವಾಲ್ |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಯ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
ಕೋಷ್ಟಕ 1. ಕ್ಲೀನ್ ಡೇಟಾದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು.
ಕಡತದ ಹೆಸರು | ClientID | ಓದಿನ ಸಂಖ್ಯೆ | ಮೂಲ ಸಂಖ್ಯೆ | N50 | ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ | ಗರಿಷ್ಟ ಉದ್ದ | ಸರಾಸರಿ ಸ್ಕೋರ್ |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
ಚಿತ್ರ 1. ಓದಿದ ಉದ್ದದ ವಿತರಣೆ
ಚಿತ್ರ 2. ಕ್ಲೀನ್ ಡೇಟಾದ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸ್ಕೋರ್ ವಿತರಣೆ
ಚಿತ್ರ 3. ಕ್ಲೀನ್ ಡೇಟಾದ ಉದ್ದ ಮತ್ತು ಗುಣಮಟ್ಟದ ಸ್ಕೋರ್ ವಿತರಣೆ