ಉತ್ಪನ್ನಗಳು

ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್

ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಎಂದರೆ ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವುದು.ಈ ಶಿಸ್ತು ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅಥವಾ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಅನುಕ್ರಮ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಂಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಮೂಲಕ ಜೀನೋಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಜಾತಿಗಳ ವಿಕಸನ, ಜೀನ್ ಕಾರ್ಯ, ಜೀನ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಅಧ್ಯಯನವು ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬ, ವಿಕಸನೀಯ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು, ಆಯ್ದ ಒತ್ತಡ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.

ನಮ್ಮನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ

ಸೇವೆಯ ವಿವರಗಳು

ಡೆಮೊ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು

ಉದಾಹರಣಾ ಪರಿಶೀಲನೆ

ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು

● ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಎಂಟು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಮಗ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ಪ್ಯಾಕೇಜ್

● ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಮೇಲೆ ವಿವರವಾದ ಮತ್ತು ಸುಲಭವಾಗಿ ಅರ್ಥವಾಗುವ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನದೊಂದಿಗೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆ

● ಚೆನ್ನಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಿದ ಅಂಕಿ-ಅಂಶಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಿಸಲು ಸಿದ್ಧವಾಗಿದೆ

● ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ತಂಡವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಬೇಡಿಕೆಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತದೆ

● ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆಯೊಂದಿಗೆ ಕಡಿಮೆ ಟರ್ನ್-ಅರೌಂಡ್ ಸಮಯ

● 900 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಚಿತ ಪ್ರಕಟಿತ ಪ್ರಭಾವದ ಅಂಶದೊಂದಿಗೆ 90 ಯಶಸ್ವಿ ಪ್ರಕರಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೇರಳವಾದ ಅನುಭವ

ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು

ಅಂದಾಜು ತಿರುಗುವ ಸಮಯ

ಜಾತಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ

ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ

30 ಕೆಲಸದ ದಿನಗಳು

6 - 12

ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್

ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬದ ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೋಚನ

ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರದ ನಿರ್ಮಾಣ

ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯದ ಅಂದಾಜು (ಪಳೆಯುಳಿಕೆ ಮಾಪನಾಂಕ ನಿರ್ಣಯದ ಅಗತ್ಯವಿದೆ)

LTR ಅಳವಡಿಕೆ ಸಮಯ (ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ)

ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು (ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ)

ಆಯ್ದ ಒತ್ತಡ

ಸಿಂಟೆನಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು

● ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬ

● ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್

● ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ

● ಆಯ್ದ ಒತ್ತಡ

● ಸಿಂಟೆನಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ

ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:

ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಜೋಡಣೆಗಾಗಿ ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ DNA

ಅಂಗಾಂಶಕ್ಕಾಗಿ

ಜಾತಿಗಳು	ಅಂಗಾಂಶ	ಸರ್ವೇ	PacBio CCS
ಪ್ರಾಣಿ	ಒಳಾಂಗಗಳ ಅಂಗಾಂಶ	0.5 ~ 1 ಗ್ರಾಂ	≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
	ಸ್ನಾಯು ಅಂಗಾಂಶ		≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
			≥ 5.0 ಗ್ರಾಂ
			≥ 5.0mL
	ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ		≥ 5.0mL
	ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ		≥ 0.5mL
	ಕೋಳಿ/ಮೀನಿನ ರಕ್ತ		≥ 0.5mL
ಸಸ್ಯ	ತಾಜಾ ಎಲೆ	1 ~ 2 ಗ್ರಾಂ	≥ 5.0 ಗ್ರಾಂ
	ದಳ/ಕಾಂಡ	1 ~ 2 ಗ್ರಾಂ	≥ 10.0 ಗ್ರಾಂ
	ಬೇರು/ಬೀಜ	1 ~ 2 ಗ್ರಾಂ	≥ 20.0 ಗ್ರಾಂ
ಜೀವಕೋಶಗಳು	ಸುಸಂಸ್ಕೃತ ಕೋಶ	-	≥ 1 x 10⁸

ಡೇಟಾ

ಜೀನೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್‌ಗಳು(.ಫಾಸ್ಟಾ) ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಫೈಲ್‌ಗಳು (.gff3) ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳ

ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು

ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ

ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ

ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ

ಅನುಕ್ರಮ

ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು

ಹಿಂದಿನ: ವಿಕಸನೀಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್

ಮುಂದೆ: ಬಲ್ಕ್ಡ್ ಸೆಗ್ರೆಗಂಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

*ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಡೆಮೊ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜೀಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಕಟವಾದ ಜಿನೋಮ್‌ಗಳಿಂದ ಬಂದವುಗಳಾಗಿವೆ

1.LTR ಇನ್ಸರ್ಟ್ ಸಮಯ ಅಂದಾಜು: ಇತರ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ವೀನಿಂಗ್ ರೈ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ LTR-RT ಗಳ ಅಳವಡಿಕೆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಬೈಮೋಡಲ್ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಅಂಕಿ ತೋರಿಸಿದೆ.ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನ ಶಿಖರವು ಸುಮಾರು 0.5 ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿತು.

3LTR-ಅಳವಡಿಕೆ-ಸಮಯ-ಅಂದಾಜು-ಇನ್-ವೈನಿಂಗ್-ರೈ

ಲಿ ಗುವಾಂಗ್ ಮತ್ತು ಇತರರು.,ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್, 2021

2.ಚಯೋಟ್ (ಸೆಚಿಯಮ್ ಎಡ್ಯೂಲ್) ಮೇಲೆ ಫೈಲೋಜೆನಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ : ಚಯೋಟ್ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿನ ಇತರ 13 ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಚಾಯೋಟೆ ಹಾವಿನ ಸೋರೆಕಾಯಿಯೊಂದಿಗೆ (ಟ್ರೈಕೋಸಾಂಥೆಸ್ ಆಂಗ್ಯುನಾ) ಹೆಚ್ಚು ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ.ಸುಮಾರು 27-45 ಮೈಯಲ್ಲಿ ಹಾವಿನ ಸೋರೆಕಾಯಿಯಿಂದ ಪಡೆದ ಚಯೋಟೆ ಮತ್ತು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು (WGD) ಅನ್ನು 25±4 Mya ನಲ್ಲಿ ಚಯೋಟ್‌ನಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸಲಾಯಿತು, ಇದು ಕ್ಯುಕ್ಯುಬಿಟೇಸಿಯಲ್ಲಿ ಮೂರನೇ WGD ಘಟನೆಯಾಗಿದೆ.

4 ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್-ಟ್ರೀ-ಆಫ್-ಚಾಯೋಟೆ

ಫೂ ಎ ಮತ್ತು ಇತರರು.,ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 2021

3.ಸಿಂಟೆನಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಫೈಟೊಹಾರ್ಮೋನ್‌ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕೆಲವು ಜೀನ್‌ಗಳು ಚಾಯೋಟ್, ಹಾವಿನ ಸೋರೆಕಾಯಿ ಮತ್ತು ಕುಂಬಳಕಾಯಿಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ.ಚಾಯೋಟೆ ಮತ್ತು ಸ್ಕ್ವ್ಯಾಷ್ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧವು ಚಾಯೋಟೆ ಮತ್ತು ಹಾವಿನ ಸೋರೆಕಾಯಿಯ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧಕ್ಕಿಂತ ಸ್ವಲ್ಪ ಹೆಚ್ಚಾಗಿರುತ್ತದೆ.

4 ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್-ಟ್ರೀ-ಆಫ್-ಚಾಯೋಟೆ

ಫೂ ಎ ಮತ್ತು ಇತರರು.,ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 2021

4.ಜೀನ್ ಕೌಟುಂಬಿಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: G.thurberi ಮತ್ತು G.davidsonii ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬದ ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೋಚನದ ಮೇಲೆ KEGG ಪುಷ್ಟೀಕರಣವು ಸ್ಟೀರಾಯ್ಡ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಬ್ರಾಸಿನೊಸ್ಟೆರಾಯ್ಡ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ.

4 ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್-ಟ್ರೀ-ಆಫ್-ಚಾಯೋಟೆ

ಯಾಂಗ್ Z et al.,BMC ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, 2021

5.ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: 4DTV ಮತ್ತು Ks ವಿತರಣಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು ಘಟನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ.ನಕಲು ಘಟನೆಗಳನ್ನು ತೋರಿಸಿರುವ ಅಂತರ್ಜಾತಿಗಳ ಶಿಖರಗಳು.ಜಾತಿಯ ಘಟನೆಗಳನ್ನು ತೋರಿಸಿರುವ ಅಂತರಜಾತಿಗಳ ಶಿಖರಗಳು.ಇತರ ಮೂರು ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದಾಗ, O. ಯುರೋಪಿಯಾವು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಜೀನ್ ನಕಲು ಮಾಡುವಿಕೆಗೆ ಒಳಗಾಗಿದೆ ಎಂದು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸೂಚಿಸಿತು.

4 ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್-ಟ್ರೀ-ಆಫ್-ಚಾಯೋಟೆ

ರಾವ್ ಜಿ ಮತ್ತು ಇತರರು.ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 2021

ಬಿಎಂಕೆ ಪ್ರಕರಣ

ಮುಳ್ಳುಗಳಿಲ್ಲದ ಗುಲಾಬಿ: ಜೀನೋಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು ತೇವಾಂಶದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ

ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ: ರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ವಿಜ್ಞಾನ ವಿಮರ್ಶೆ, 2021

ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ:

'ಬಸ್ಯೆ ಅವರಮುಳ್ಳಿಲ್ಲದ' (ಆರ್.ವಿಚುರೈನನ್) ಜಿನೋಮ್:
ಅಂದಾಜು93 X PacBio + ಅಂದಾಜು.90 X ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ + 267 X ಇಲ್ಯುಮಿನಾ

ಪ್ರಮುಖ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು

1.ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ R.wichuriana ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು 530.07 Mb ಯ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ (ಅಂದಾಜು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರವು ಫ್ಲೋ ಸೈಟೊಮೆಟ್ರಿಯಿಂದ ಅಂದಾಜು 525.9 Mb ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆಯಿಂದ 525.5% ನಷ್ಟಿತ್ತು).BUSCO ಅಂದಾಜು ಸ್ಕೋರ್ 93.9%."ಓಲ್ಡ್ ಬ್ಲಶ್" (haploOB) ನೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದಾಗ, ಈ ಜೀನೋಮ್‌ನ ಗುಣಮಟ್ಟ ಮತ್ತು ಸಂಪೂರ್ಣತೆಯನ್ನು ಬೇಸ್ ಸಿಂಗಲ್-ಬೇಸ್ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು LTR ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಸೂಚ್ಯಂಕ (LAI=20.03) ಮೂಲಕ ದೃಢೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ.R.wichuriana ಜೀನೋಮ್ 32,674 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.

2.ಮಲ್ಟಿ-ಓಮಿಕ್ಸ್ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್, ಜೆನೆಟಿಕ್ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ QTL ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, R. ವಿಚುರೈಯಾನಾ ಮತ್ತು ರೋಸಾ ಚಿನೆನ್ಸಿಸ್ ನಡುವಿನ ನಿರ್ಣಾಯಕ ವಿಶೇಷತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು.ಅಲ್ಲದೆ, QTL ನಲ್ಲಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್‌ಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ಕಾಂಡದ ಮುಳ್ಳು ಮಾದರಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರಬಹುದು.

7KEGG-ಪುಷ್ಟೀಕರಣ-ಜೀನ್-ಕುಟುಂಬ-ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೋಚನ

ಸಿಂಟೆನಿ ಅನಾಲಿಸಿಸ್, ಜೀನ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್, ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೋಚನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಸೇರಿದಂತೆ Basye;s Thornless ಮತ್ತು Rosa chinensis ನಡುವಿನ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಗುಲಾಬಿಗಳಲ್ಲಿನ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು.NAC ಮತ್ತು FAR1/FRS ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿನ ವಿಶಿಷ್ಟ ವಿಸ್ತರಣೆಯು ಕಪ್ಪು ಚುಕ್ಕೆಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.

81 BT-ಮತ್ತು OB ನಡುವೆ ತುಲನಾತ್ಮಕ-ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್-ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು 82 BT-ಮತ್ತು OB ನಡುವೆ ತುಲನಾತ್ಮಕ-ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್-ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು 83 BT-ಮತ್ತು OB ನಡುವೆ ತುಲನಾತ್ಮಕ-ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್-ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು