16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ಮತ್ತು ತ್ವರಿತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ
● ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಘಟಕಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್
● ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಹರಿವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ.
● ಹೆಚ್ಚಿನ ಥ್ರೋಪುಟ್, ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ
● ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ
● BMK ವರ್ಷಕ್ಕೆ 100,000 ಮಾದರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಮಣ್ಣು, ನೀರು, ಅನಿಲ, ಕೆಸರು, ಮಲ, ಕರುಳು, ಚರ್ಮ, ಹುದುಗುವಿಕೆಯ ಸಾರು, ಕೀಟಗಳು, ಸಸ್ಯಗಳು, ಇತ್ಯಾದಿ.
● BMKCloud 45 ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಡೇಟಾ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸಿದೆ
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮವೇದಿಕೆ | ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ ಇಳುವರಿ | ಅಂದಾಜು ತಿರುಗುವ ಸಮಯ |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ | PE250 | 50K/100K/300K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು | 30 ದಿನಗಳು |
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು
● ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್/ಡಿ-ಶಬ್ದ(ASV)
● OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
● ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ
● ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ
● ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಅಂಶಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಫಂಕ್ಷನ್ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ಫಾರ್ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಮೊತ್ತ | ಏಕಾಗ್ರತೆ | ಶುದ್ಧತೆ |
| ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು | ＞ 30 ng | ＞ 1 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಗಾಗಿ:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿಧಾನ |
| ಮಣ್ಣು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಉಳಿದಿರುವ ಕಳೆಗುಂದಿದ ವಸ್ತುವನ್ನು ಮೇಲ್ಮೈಯಿಂದ ತೆಗೆದುಹಾಕಬೇಕಾಗಿದೆ;ದೊಡ್ಡ ತುಂಡುಗಳನ್ನು ಪುಡಿಮಾಡಿ ಮತ್ತು 2 ಮಿಮೀ ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಸೈರೋಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಅಲಿಕ್ವಾಟ್ ಮಾದರಿಗಳು. |
| ಮಲ | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕರುಳಿನ ವಿಷಯಗಳು | ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಬೇಕಾಗಿದೆ.ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ಅಂಗಾಂಶವನ್ನು PBS ನೊಂದಿಗೆ ತೊಳೆಯಿರಿ;PBS ಅನ್ನು ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು EP-ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅವಕ್ಷೇಪಕವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕೆಸರು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಕೆಸರು ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ |
| ಜಲಮೂಲ | ಟ್ಯಾಪ್ ನೀರು, ಬಾವಿ ನೀರು, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಸೀಮಿತ ಪ್ರಮಾಣದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಮಾದರಿಗಾಗಿ, ಕನಿಷ್ಠ 1 ಲೀ ನೀರನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಪೊರೆಯ ಮೇಲೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಸಮೃದ್ಧಗೊಳಿಸಲು 0.22 μm ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ.ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಪೊರೆಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಚರ್ಮ | ಕ್ರಿಮಿನಾಶಕ ಹತ್ತಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್ ಅಥವಾ ಸರ್ಜಿಕಲ್ ಬ್ಲೇಡ್‌ನಿಂದ ಚರ್ಮದ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಕೆರೆದು ಅದನ್ನು ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿ. |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
3-4 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಫ್ರೀಜ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕ ಅಥವಾ -80 ಡಿಗ್ರಿಯಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘಕಾಲ ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ.ಡ್ರೈ-ಐಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಶಿಪ್ಪಿಂಗ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
1.ಜಾತಿಗಳ ವಿತರಣೆ
2.ಹೀಟ್ ಮ್ಯಾಪ್: ಜಾತಿಯ ಶ್ರೀಮಂತಿಕೆ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್
3.ಅಪರೂಪದ ಬಣ ಕರ್ವ್
4.NMDS ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
5.ಲೆಫ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಬಿಎಂಕೆ ಪ್ರಕರಣ
ಟೈಪ್ 2 ಡಯಾಬಿಟಿಸ್ ಹೊಂದಿರುವ ಮತ್ತು ಇಲ್ಲದ ಬೊಜ್ಜು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತಾರೆ
ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ:ಸೆಲ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಬ್, 2019
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ:
ನೇರವಲ್ಲದ ಮಧುಮೇಹ (n=633);ಬೊಜ್ಜು ಅಲ್ಲದ ಮಧುಮೇಹ (n=494);ಬೊಜ್ಜು-ಟೈಪ್ 2 ಮಧುಮೇಹ (n=153);
ಗುರಿ ಪ್ರದೇಶ: 16S rDNA V1-V2
ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಮಿಸೆಕ್ (NGS-ಆಧಾರಿತ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ)
ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳ ಉಪವಿಭಾಗವನ್ನು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಹಿಸೆಕ್‌ನಲ್ಲಿ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಒಳಪಡಿಸಲಾಯಿತು
ಪ್ರಮುಖ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು
ಈ ಮೆಟಬಾಲಿಕ್ ಕಾಯಿಲೆಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ.
16S ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸಿ, ಸ್ಥೂಲಕಾಯತೆಯು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ವೈಯಕ್ತಿಕ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಅಕ್ಕರ್‌ಮ್ಯಾನ್ಸಿಯಾ, ಫೇಕಲಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ, ಆಸಿಲ್ಲಿಬ್ಯಾಕ್ಟರ್, ಅಲಿಸ್ಟೈಪ್ಸ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹ ಇಳಿಕೆ. ಜೊತೆಗೆ, T2D ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ/ಶಿಗೆಲ್ಲ ಹೆಚ್ಚಳದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. .
ಉಲ್ಲೇಖ
ಥಿಂಗ್ಹೋಮ್, ಎಲ್ಬಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು."ಟೈಪ್ 2 ಡಯಾಬಿಟಿಸ್ ಹೊಂದಿರುವ ಮತ್ತು ಇಲ್ಲದ ಬೊಜ್ಜು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತಾರೆ."ಸೆಲ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಬ್26.2(2019)
