ប្រសិទ្ធភាពនៃការរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ខ្ពស់។- បច្ចេកវិជ្ជាតម្រៀបតាមលំដាប់លំដោយខ្ពស់ជួយ SLAF-Seq ក្នុងការស្វែងរកស្លាករាប់រយរាប់ពាន់នៅក្នុងហ្សែនទាំងមូល។
ការពឹងផ្អែកទាបលើហ្សែន- វាអាចត្រូវបានអនុវត្តចំពោះប្រភេទសត្វទាំងមានឬគ្មានហ្សែនយោង។
ការរចនាគ្រោងការណ៍ដែលអាចបត់បែនបាន។- អង់ស៊ីមតែមួយ អង់ស៊ីមពីរ ការរំលាយអាហារច្រើនអង់ស៊ីម និងប្រភេទអង់ស៊ីមផ្សេងៗ ទាំងអស់អាចត្រូវបានជ្រើសរើសដើម្បីបំពេញគោលដៅស្រាវជ្រាវ ឬប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។ការវាយតម្លៃជាមុននៅក្នុងស៊ីលីកូត្រូវបានប្រើដើម្បីធានាការរចនាអង់ស៊ីមដ៏ល្អប្រសើរ។
ការរំលាយអាហារអង់ស៊ីមប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព- ការពិសោធន៍មុនត្រូវបានអនុវត្តដើម្បីបង្កើនប្រសិទ្ធភាពលក្ខខណ្ឌ ដែលធ្វើឱ្យការពិសោធន៍ផ្លូវការមានស្ថេរភាព និងអាចទុកចិត្តបាន។ប្រសិទ្ធភាពនៃការប្រមូលបំណែកអាចសម្រេចបានលើសពី 95% ។
ស្លាក SLAF ចែកចាយស្មើៗគ្នា។- ស្លាក SLAF ត្រូវបានចែកចាយស្មើៗគ្នានៅក្នុងក្រូម៉ូសូមទាំងអស់ក្នុងកម្រិតដ៏អស្ចារ្យបំផុត ដោយសម្រេចបានជាមធ្យម 1 SLAF ក្នុង 4 គីឡូបៃ។
ការជៀសវាងការកើតឡើងដដែលៗប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព- លំដាប់ដដែលៗនៅក្នុងទិន្នន័យ SLAF-Seq ត្រូវបានកាត់បន្ថយមកទាបជាង 5% ជាពិសេសនៅក្នុងប្រភេទសត្វដែលមានកម្រិតខ្ពស់នៃការធ្វើម្តងទៀត ដូចជាស្រូវសាលី ពោតជាដើម។
បទពិសោធន៍យ៉ាងទូលំទូលាយ- ជាង 2000 បានបិទគម្រោង SLAF-Seq លើរាប់រយប្រភេទដែលគ្របដណ្ដប់លើរុក្ខជាតិ ថនិកសត្វ បក្សី សត្វល្អិត ពពួកសត្វក្នុងទឹក ។ល។
ដំណើរការការងារជីវព័ត៌មានដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯង។- ដំណើរការការងារ bioinformatic រួមបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ SLAF-Seq ត្រូវបានបង្កើតឡើងដោយ BMKGENE ដើម្បីធានាបាននូវភាពជឿជាក់ និងភាពត្រឹមត្រូវនៃលទ្ធផលចុងក្រោយ។
វេទិកា | Conc.(ng/gl) | សរុប (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | > ៣5 | >១.៦(ភាគ> ១៥μl) | 1.6-2.5 |
ជម្រៅនៃការបន្ត៖ 10X/Tag
ទំហំហ្សែន | ស្លាក SLAF ដែលបានណែនាំ |
< 500 Mb | 100K ឬ WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 K |
1 Gb -2 Gb | 200 K |
ហ្សែនយក្ស ឬស្មុគស្មាញ | 300 - 400K |
កម្មវិធី
| បានណែនាំ មាត្រដ្ឋានប្រជាជន
| តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងស៊ីជម្រៅ
| |
ជម្រៅ
| លេខស្លាក
| ||
GWAS
| លេខគំរូ ≥ 200
| 10X
|
យោងទៅតាម ទំហំហ្សែន
|
ការវិវត្តន៍ហ្សែន
| បុគ្គលម្នាក់ៗ ក្រុមរង ≥ 10; គំរូសរុប ≥ 30
| 10X
|
កុងតឺន័រ: បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ
សម្រាប់គំរូភាគច្រើន យើងណែនាំកុំឱ្យរក្សាទុកក្នុងអេតាណុល។
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ គំរូត្រូវដាក់ស្លាកយ៉ាងច្បាស់ និងដូចគ្នាបេះបិទទៅនឹងទម្រង់ព័ត៌មានគំរូដែលបានបញ្ជូន។
ការដឹកជញ្ជូន៖ ទឹកកកស្ងួត៖ គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ជាមុន ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
1. ស្ថិតិនៃលទ្ធផលផែនទី
2. ការអភិវឌ្ឍន៍សញ្ញាសម្គាល់ SLAF
3. បំរែបំរួលចំណារពន្យល់
ឆ្នាំ | ទិនានុប្បវត្តិ | IF | ចំណងជើង | កម្មវិធី |
២០២២ | ទំនាក់ទំនងធម្មជាតិ | ១៧.៦៩៤ | មូលដ្ឋានហ្សែននៃ giga-chromosomes និង giga-genome នៃដើមឈើ peony Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
ឆ្នាំ 2015 | អ្នកជំនាញរូបវិទ្យាថ្មី។ | ៧.៤៣៣ | ស្នាមជើងក្នុងស្រុកបោះយុថ្កាតំបន់ហ្សែននៃសារៈសំខាន់ agronomic នៅក្នុង សណ្តែកសៀង | SLAF-GWAS |
២០២២ | ទិនានុប្បវត្តិនៃការស្រាវជ្រាវកម្រិតខ្ពស់ | ១២.៨២២ | ការឈ្លានពានសិប្បនិម្មិតនៃហ្សែន Gossypium barbadense ចូលទៅក្នុង G. hirsutum បង្ហាញទីតាំងល្អបំផុតសម្រាប់ការកែលម្អក្នុងពេលដំណាលគ្នានៃគុណភាព និងទិន្នផលសរសៃកប្បាស លក្ខណៈ | SLAF - ហ្សែនវិវត្តន៍ |
ឆ្នាំ 2019 | រុក្ខជាតិម៉ូលេគុល | ១០.៨១ | ការវិភាគហ្សែនប្រជាជន និងសភា De Novo បង្ហាញពីប្រភពដើមនៃ Weedy អង្ករជាល្បែងវិវត្តន៍ | SLAF - ហ្សែនវិវត្តន៍ |
ឆ្នាំ 2019 | ហ្សែនធម្មជាតិ | ៣១.៦១៦ | លំដាប់ហ្សែន និងភាពចម្រុះហ្សែននៃត្រីគល់រាំងទូទៅ Cyprinus carpio | ផែនទីតំណភ្ជាប់ SLAF |
ឆ្នាំ ២០១៤ | ហ្សែនធម្មជាតិ | ២៥.៤៥៥ | ហ្សែននៃសណ្តែកដីដាំដុះផ្តល់នូវការយល់ដឹងអំពីប្រភេទ karyotypes legume, polyploid ការវិវត្តន៍ និងការដាំដុះដំណាំក្នុងស្រុក។ | ផែនទីតំណភ្ជាប់ SLAF |
២០២២ | ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ | ៩.៨០៣ | ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ ST1 បង្ហាញពីការជ្រើសរើសដែលពាក់ព័ន្ធនឹងការជិះកង់នៃ morphology គ្រាប់ពូជ និងបរិមាណប្រេងក្នុងអំឡុងពេលផលិតសណ្តែកសៀង | ការអភិវឌ្ឍន៍ SLAF-Marker |
២០២២ | ទិនានុប្បវត្តិអន្តរជាតិនៃវិទ្យាសាស្ត្រម៉ូលេគុល | ៦.២០៨ | ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ និងការអភិវឌ្ឍន៍សញ្ញាសម្គាល់ DNA សម្រាប់ស្រូវសាលី-Leymus mollis 2Ns (2D) ការជំនួសក្រូម៉ូសូម Disomic | ការអភិវឌ្ឍន៍ SLAF-Marker |