BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ផលិតផល

លំដាប់លំដោយជាក់លាក់-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

ការវាយបញ្ចូលហ្សែនតាមរយៈកម្រិតខ្ពស់ ជាពិសេសលើចំនួនប្រជាជនទ្រង់ទ្រាយធំ គឺជាជំហានជាមូលដ្ឋានក្នុងការសិក្សាអំពីទំនាក់ទំនងហ្សែន ដែលផ្តល់មូលដ្ឋានហ្សែនសម្រាប់ការរកឃើញហ្សែនមុខងារ ការវិភាគការវិវត្តន៍។ល។ ) ត្រូវបានណែនាំដើម្បីកាត់បន្ថយការចំណាយតាមលំដាប់លំដោយក្នុងមួយគំរូ ខណៈពេលដែលរក្សាបាននូវប្រសិទ្ធភាពសមហេតុផលលើការរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែន។នេះត្រូវបានសម្រេចជាទូទៅដោយការស្រង់ចេញបំណែកដាក់កម្រិតនៅក្នុងជួរទំហំដែលបានផ្តល់ឱ្យ ដែលត្រូវបានគេហៅថាបណ្ណាល័យតំណាងកាត់បន្ថយ (RRL) ។លំដាប់លំដោយជាក់លាក់-locus amplified fragment (SLAF-Seq) គឺជាយុទ្ធសាស្រ្តដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯងសម្រាប់ SNP genotyping ដោយមានឬគ្មាន genome យោង។
វេទិកា៖ Illumina NovaSeq Platform


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

ការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេស

ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

គ្រោងការណ៍បច្ចេកទេស

១១១

លំហូរការងារ

流程图

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

ប្រសិទ្ធភាពនៃការរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ខ្ពស់។- បច្ចេកវិជ្ជាតម្រៀបតាមលំដាប់លំដោយខ្ពស់ជួយ SLAF-Seq ក្នុងការស្វែងរកស្លាករាប់រយរាប់ពាន់នៅក្នុងហ្សែនទាំងមូល។

ការពឹងផ្អែកទាបលើហ្សែន- វា​អាច​ត្រូវ​បាន​អនុវត្ត​ចំពោះ​ប្រភេទ​សត្វ​ទាំង​មាន​ឬ​គ្មាន​ហ្សែន​យោង។

ការរចនាគ្រោងការណ៍ដែលអាចបត់បែនបាន។- អង់ស៊ីមតែមួយ អង់ស៊ីមពីរ ការរំលាយអាហារច្រើនអង់ស៊ីម និងប្រភេទអង់ស៊ីមផ្សេងៗ ទាំងអស់អាចត្រូវបានជ្រើសរើសដើម្បីបំពេញគោលដៅស្រាវជ្រាវ ឬប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។ការវាយតម្លៃជាមុននៅក្នុងស៊ីលីកូត្រូវបានប្រើដើម្បីធានាការរចនាអង់ស៊ីមដ៏ល្អប្រសើរ។

ការរំលាយអាហារអង់ស៊ីមប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព- ការពិសោធន៍មុនត្រូវបានអនុវត្តដើម្បីបង្កើនប្រសិទ្ធភាពលក្ខខណ្ឌ ដែលធ្វើឱ្យការពិសោធន៍ផ្លូវការមានស្ថេរភាព និងអាចទុកចិត្តបាន។ប្រសិទ្ធភាពនៃការប្រមូលបំណែកអាចសម្រេចបានលើសពី 95% ។

ស្លាក SLAF ចែកចាយស្មើៗគ្នា។- ស្លាក SLAF ត្រូវបានចែកចាយស្មើៗគ្នានៅក្នុងក្រូម៉ូសូមទាំងអស់ក្នុងកម្រិតដ៏អស្ចារ្យបំផុត ដោយសម្រេចបានជាមធ្យម 1 SLAF ក្នុង 4 គីឡូបៃ។

ការជៀសវាងការកើតឡើងដដែលៗប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព- លំដាប់ដដែលៗនៅក្នុងទិន្នន័យ SLAF-Seq ត្រូវបានកាត់បន្ថយមកទាបជាង 5% ជាពិសេសនៅក្នុងប្រភេទសត្វដែលមានកម្រិតខ្ពស់នៃការធ្វើម្តងទៀត ដូចជាស្រូវសាលី ពោតជាដើម។

បទពិសោធន៍​យ៉ាង​ទូលំទូលាយ- ជាង 2000 បានបិទគម្រោង SLAF-Seq លើរាប់រយប្រភេទដែលគ្របដណ្ដប់លើរុក្ខជាតិ ថនិកសត្វ បក្សី សត្វល្អិត ពពួកសត្វក្នុងទឹក ។ល។

ដំណើរការការងារជីវព័ត៌មានដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯង។- ដំណើរការការងារ bioinformatic រួមបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ SLAF-Seq ត្រូវបានបង្កើតឡើងដោយ BMKGENE ដើម្បីធានាបាននូវភាពជឿជាក់ និងភាពត្រឹមត្រូវនៃលទ្ធផលចុងក្រោយ។

 

លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម

 

វេទិកា

Conc.(ng/gl)

សរុប (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

> ៣5

>១.៦(ភាគ> ១៥μl)

1.6-2.5

ចំណាំ៖ គំរូចំនួនបី ដែលនីមួយៗមានគ្រោងការណ៍អង់ស៊ីមចំនួនបីនឹងត្រូវបានអនុវត្តសម្រាប់ការពិសោធន៍ជាមុន។

យុទ្ធសាស្រ្តលំដាប់ដែលបានណែនាំ

ជម្រៅនៃការបន្ត៖ 10X/Tag

ទំហំហ្សែន

ស្លាក SLAF ដែលបានណែនាំ

< 500 Mb

100K ឬ WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 Gb -2 Gb

200 K

ហ្សែនយក្ស ឬស្មុគស្មាញ

300 - 400K

 

កម្មវិធី

 

បានណែនាំ

មាត្រដ្ឋានប្រជាជន

 

តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងស៊ីជម្រៅ

 

ជម្រៅ

 

លេខស្លាក

 

GWAS

 

លេខគំរូ ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

យោង​ទៅ​តាម

ទំហំហ្សែន

 

ការវិវត្តន៍ហ្សែន

 

បុគ្គលម្នាក់ៗ

ក្រុមរង ≥ 10;

គំរូសរុប ≥ 30

 

10X

 

ការចែកចាយគំរូដែលបានណែនាំ

កុងតឺន័រ: បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ

សម្រាប់គំរូភាគច្រើន យើងណែនាំកុំឱ្យរក្សាទុកក្នុងអេតាណុល។

ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ គំរូត្រូវដាក់ស្លាកយ៉ាងច្បាស់ និងដូចគ្នាបេះបិទទៅនឹងទម្រង់ព័ត៌មានគំរូដែលបានបញ្ជូន។

ការដឹកជញ្ជូន៖ ទឹកកកស្ងួត៖ គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ជាមុន ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។

លំហូរការងារសេវាកម្ម

គំរូ QC
ការពិសោធន៍សាកល្បង
ការពិសោធន៍ SLAF
ការរៀបចំបណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគ​ទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់

គំរូ QC

ការពិសោធន៍សាកល្បង

ការពិសោធន៍ SLAF

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

លំដាប់

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

សេវាកម្មក្រោយពេលលក់


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 1. ស្ថិតិនៃលទ្ធផលផែនទី

    រូបភាព1

    ក១

    2. ការអភិវឌ្ឍន៍សញ្ញាសម្គាល់ SLAF

    ក២

    3. បំរែបំរួលចំណារពន្យល់

    ក៣

    ឆ្នាំ

    ទិនានុប្បវត្តិ

    IF

    ចំណងជើង

    កម្មវិធី

    ២០២២

    ទំនាក់ទំនងធម្មជាតិ

    ១៧.៦៩៤

    មូលដ្ឋានហ្សែននៃ giga-chromosomes និង giga-genome នៃដើមឈើ peony

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    ឆ្នាំ 2015

    អ្នកជំនាញរូបវិទ្យាថ្មី។

    ៧.៤៣៣

    ស្នាមជើងក្នុងស្រុកបោះយុថ្កាតំបន់ហ្សែននៃសារៈសំខាន់ agronomic នៅក្នុង

    សណ្តែកសៀង

    SLAF-GWAS

    ២០២២

    ទិនានុប្បវត្តិនៃការស្រាវជ្រាវកម្រិតខ្ពស់

    ១២.៨២២

    ការឈ្លានពានសិប្បនិម្មិតនៃហ្សែន Gossypium barbadense ចូលទៅក្នុង G. hirsutum

    បង្ហាញទីតាំងល្អបំផុតសម្រាប់ការកែលម្អក្នុងពេលដំណាលគ្នានៃគុណភាព និងទិន្នផលសរសៃកប្បាស

    លក្ខណៈ

    SLAF - ហ្សែនវិវត្តន៍

    ឆ្នាំ 2019

    រុក្ខជាតិម៉ូលេគុល

    ១០.៨១

    ការវិភាគហ្សែនប្រជាជន និងសភា De Novo បង្ហាញពីប្រភពដើមនៃ Weedy

    អង្ករជាល្បែងវិវត្តន៍

    SLAF - ហ្សែនវិវត្តន៍

    ឆ្នាំ 2019

    ហ្សែនធម្មជាតិ

    ៣១.៦១៦

    លំដាប់ហ្សែន និងភាពចម្រុះហ្សែននៃត្រីគល់រាំងទូទៅ Cyprinus carpio

    ផែនទីតំណភ្ជាប់ SLAF

    ឆ្នាំ ២០១៤

    ហ្សែនធម្មជាតិ

    ២៥.៤៥៥

    ហ្សែននៃសណ្តែកដីដាំដុះផ្តល់នូវការយល់ដឹងអំពីប្រភេទ karyotypes legume, polyploid

    ការវិវត្តន៍ និងការដាំដុះដំណាំក្នុងស្រុក។

    ផែនទីតំណភ្ជាប់ SLAF

    ២០២២

    ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ

    ៩.៨០៣

    ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ ST1 បង្ហាញពីការជ្រើសរើសដែលពាក់ព័ន្ធនឹងការជិះកង់នៃ morphology គ្រាប់ពូជ

    និងបរិមាណប្រេងក្នុងអំឡុងពេលផលិតសណ្តែកសៀង

    ការអភិវឌ្ឍន៍ SLAF-Marker

    ២០២២

    ទិនានុប្បវត្តិអន្តរជាតិនៃវិទ្យាសាស្ត្រម៉ូលេគុល

    ៦.២០៨

    ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ និងការអភិវឌ្ឍន៍សញ្ញាសម្គាល់ DNA សម្រាប់ស្រូវសាលី-Leymus mollis 2Ns (2D)

    ការជំនួសក្រូម៉ូសូម Disomic

    ការអភិវឌ្ឍន៍ SLAF-Marker

    ទទួលបានសម្រង់

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖