លំដាប់ RNA តូច-Illumina
លក្ខណៈពិសេស
● ការជ្រើសរើសទំហំ RNA មុនពេលរៀបចំបណ្ណាល័យ
● ការវិភាគជីវព័ត៌មានផ្តោតលើការព្យាករណ៍ miRNA និងគោលដៅរបស់ពួកគេ។
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
●ការវិភាគជីវព័ត៌មានវិទ្យាដ៏ទូលំទូលាយ៖អនុញ្ញាតឱ្យកំណត់អត្តសញ្ញាណទាំង miRNAs ដែលគេស្គាល់ និងប្រលោមលោក ការកំណត់គោលដៅ miRNAs និងចំណារពន្យល់មុខងារដែលត្រូវគ្នា និងការពង្រឹងជាមួយនឹងមូលដ្ឋានទិន្នន័យច្រើន (KEGG, GO)
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់៖ យើងអនុវត្តចំណុចត្រួតពិនិត្យស្នូលនៅគ្រប់ដំណាក់កាលទាំងអស់ ចាប់ពីការរៀបចំគំរូ និងបណ្ណាល័យ រហូតដល់ការចាត់ថ្នាក់ និងជីវព័ត៌មានវិទ្យា។ការត្រួតពិនិត្យយ៉ាងម៉ត់ចត់នេះធានាបាននូវលទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់។
●ការគាំទ្រក្រោយការលក់៖ ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយការលក់រយៈពេល 3 ខែ។ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គ Q&A ដើម្បីដោះស្រាយរាល់សំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ជាមួយនឹងកំណត់ត្រានៃការបិទដោយជោគជ័យលើគម្រោង sRNA ជាច្រើនដែលគ្របដណ្តប់ជាង 100 ប្រភេទនៅក្នុងដែនស្រាវជ្រាវផ្សេងៗ ក្រុមរបស់យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គ្រប់គម្រោង។
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
| បណ្ណាល័យ | វេទិកា | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ទិន្នន័យ QC |
| ទំហំត្រូវបានជ្រើសរើស | Illumina SE50 | 10M-20M អាន | Q30≥85% |
តម្រូវការគំរូ៖
នុយក្លេអូទីត៖
| Conc.(ng/μl) | បរិមាណ (μg) | ភាពបរិសុទ្ធ | សុចរិតភាព |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 មានកំណត់ ឬគ្មានការចម្លងរោគ DNA បង្ហាញនៅលើជែល។ | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; កម្រិតមូលដ្ឋាន ឬគ្មានការលើកឡើង |
● រុក្ខជាតិ៖
ឫស ដើម ឬផ្កាៈ ៤៥០ មីលីក្រាម
ស្លឹកឬគ្រាប់៖ ៣០០ មីលីក្រាម
ផ្លែឈើ៖ ១,២ ក្រាម។
●សត្វ៖
បេះដូង ឬពោះវៀន៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
Viscera ឬ Brain: 240 mg
សាច់ដុំ៖ ៦០០ មីលីក្រាម
ឆ្អឹង សក់ ឬស្បែក៖ ១,៥ ក្រាម។
● Arthropods៖
សត្វល្អិត៖ ៩ ក្រាម។
Crustacea: 450 មីលីក្រាម
●ឈាមទាំងមូល: 2 បំពង់
● ក្រឡា៖ 106 កោសិកា
● សេរ៉ូម និងប្លាស្មា៖6 មីលីលីត្រ
ការចែកចាយគំរូដែលបានណែនាំ
កុងតឺន័រ៖
បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ (ក្រដាសសំណប៉ាហាំងមិនត្រូវបានណែនាំទេ)
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ ក្រុម + ចម្លងឧទាហរណ៍ A1, A2, A3;B1, B2, B3 ......
ការដឹកជញ្ជូន៖
1.Dry-ice: គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
2.RNAstable tubes: សំណាក RNA អាចត្រូវបានសម្ងួតនៅក្នុងបំពង់ស្ថេរភាព RNA (ឧទាហរណ៍ RNAstable®) និងដឹកជញ្ជូនក្នុងសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការចែកចាយគំរូ
ការទាញយក RNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
ការកំណត់អត្តសញ្ញាណ miRNA: រចនាសម្ព័ន្ធនិងជម្រៅ
កន្សោមឌីផេរ៉ង់ស្យែលនៃ miRNA - ចង្កោមតាមលំដាប់លំដោយ
ចំណារពន្យល់មុខងារនៃគោលដៅនៃ miRNAs ដែលបង្ហាញដោយឌីផេរ៉ង់ស្យែល
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពនៃការស្រាវជ្រាវដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មលំដាប់លំដោយ sRNA របស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយ។
Chen, H. et al ។(2023) 'ការឆ្លងមេរោគរារាំងជីវគីមី saponin និងរស្មីសំយោគនៅក្នុង Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al ។(2023) ' រុក្ខជាតិ FYVE domain-containing protein FREE1 ភ្ជាប់ជាមួយសមាសធាតុ microprocessor ដើម្បីបង្ក្រាប miRNA biogenesis', EMBO reports, 24(1)។doi៖ 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF។
Yu, J. et al ។(2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p គ្រប់គ្រងការលូតលាស់របស់ Larval Pupal ដោយកំណត់កត្តាលូតលាស់នៃកោសិការអេពីឌែរម៉ាល់ច្រើនប្រភេទដូចដែន 8 Gene (megf8) នៅក្នុង Honeybee, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
លោក Zhang, M. et al ។(2018) 'ការវិភាគរួមបញ្ចូលគ្នានៃ MiRNA និងហ្សែនដែលទាក់ទងនឹងគុណភាពសាច់បង្ហាញថា Gga-MiR-140-5p ប៉ះពាល់ដល់ការបន្ទោរបង់ជាតិខ្លាញ់ក្នុងសាច់ដុំនៅក្នុងសត្វមាន់', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), ទំព័រ 2421–2433។doi: 10.1159/000489649 ។
