ភាពឯកោនៃស្នូលត្រូវបានសម្រេចដោយ 10 × Genomics ChromiumTM ដែលមានប្រព័ន្ធមីក្រូហ្វ្លុយឌីកចំនួនប្រាំបីឆានែលជាមួយនឹងការឆ្លងកាត់ទ្វេ។នៅក្នុងប្រព័ន្ធនេះ អង្កាំជែលដែលមានបាកូដ និងសារធាតុ primer អង់ស៊ីម និងស្នូលតែមួយត្រូវបានរុំព័ទ្ធក្នុងដំណក់ប្រេងទំហំ nanoliter បង្កើត Gel Bead-in-Emulsion (GEM)។នៅពេលដែល GEM ត្រូវបានបង្កើតឡើង កោសិកា និងការបញ្ចេញបាកូដត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុង GEM នីមួយៗ។mRNA ត្រូវបានចម្លងបញ្ច្រាសទៅជាម៉ូលេគុល cDNA ជាមួយនឹង 10× barcodes និង UMI ដែលជាកម្មវត្ថុនៃការសាងសង់បណ្ណាល័យតាមលំដាប់លំដោយ។
កោសិកា / ជាលិកា | ហេតុផល |
ជាលិកាដែលកកមិនស្រស់ | មិនអាចទទួលបានអង្គការស្រស់ ឬរក្សាទុកយូរ |
កោសិកាសាច់ដុំ Megakaryocyte ខ្លាញ់… | អង្កត់ផ្ចិតកោសិកាធំពេកក្នុងការបញ្ចូលឧបករណ៍ |
ថ្លើម… | ផុយស្រួយពេកក្នុងការបំបែក មិនអាចបែងចែកកោសិកាតែមួយបានទេ។ |
កោសិកាណឺរ៉ូន ខួរក្បាល… | កាន់តែមានភាពរសើប ងាយស្រួលក្នុងការតានតឹង នឹងផ្លាស់ប្តូរលទ្ធផលតាមលំដាប់លំដោយ |
លំពែង ក្រពេញទីរ៉ូអ៊ីត… | សំបូរទៅដោយអង់ស៊ីម endogenous ដែលប៉ះពាល់ដល់ការផលិតកោសិកាតែមួយ |
ស្នូលតែមួយ | កោសិកាតែមួយ |
អង្កត់ផ្ចិតកោសិកាគ្មានដែនកំណត់ | អង្កត់ផ្ចិតកោសិកា: 10-40 μm |
សម្ភារៈអាចជាជាលិកាកក | សម្ភារៈត្រូវតែជាជាលិកាស្រស់ |
ភាពតានតឹងទាបនៃកោសិកាទឹកកក | ការព្យាបាលដោយអង់ស៊ីមអាចបណ្តាលឱ្យមានប្រតិកម្មស្ត្រេសកោសិកា |
មិនចាំបាច់យកកោសិកាឈាមក្រហមចេញទេ។ | កោសិកាឈាមក្រហមត្រូវតែយកចេញ |
នុយក្លេអ៊ែរបង្ហាញព័ត៌មានជីវសាស្ត្រ | កោសិកាទាំងមូលបង្ហាញពីព័ត៌មានជីវសាស្រ្ត |
បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប | បរិមាណទិន្នន័យ | តម្រូវការគំរូ | ជាលិកា |
បណ្ណាល័យ 10 × ហ្សែនហ្សែនតែមួយ | 10x ហ្សែន -Illumina PE150 | 100,000 អាន/ក្រឡា ប្រហាក់ប្រហែល។100-200 Gb | លេខក្រឡា៖ > 2 × 105 កោសិកានៅ 700-1,200 កោសិកា / μL | ≥ 200 មីលីក្រាម |
សម្រាប់ព័ត៌មានលម្អិតបន្ថែមអំពីការណែនាំអំពីការរៀបចំគំរូ និងដំណើរការការងារសេវាកម្ម សូមនិយាយដោយសេរីទៅកាន់ កអ្នកជំនាញ BMKGENE
1. Spot clustering
2.Marker expressions abundance clustering heatmap
3. ការចែកចាយហ្សែនអ្នកបង្កើតនៅក្នុងចង្កោមផ្សេងៗគ្នា
4. ការវិភាគគន្លងកោសិកា / pseudotime