-
លំដាប់ Metatranscriptome
លំដាប់លំដោយ Metatranscriptome កំណត់អត្តសញ្ញាណហ្សែននៃអតិសុខុមប្រាណ (ទាំង eukaryotes និង prokaryotes) នៅក្នុងបរិស្ថានធម្មជាតិ (ឧទាហរណ៍ ដី ទឹក សមុទ្រ លាមក និងពោះវៀន។) ជាពិសេស សេវាកម្មនេះអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកទទួលបានទម្រង់នៃការបញ្ចេញហ្សែនទាំងមូលនៃសហគមន៍អតិសុខុមប្រាណដ៏ស្មុគស្មាញ ការវិភាគផ្នែកពន្ធុវិទ្យា។ នៃប្រភេទសត្វ ការវិភាគការបង្កើនមុខងារនៃហ្សែនដែលបង្ហាញខុសៗគ្នា និងច្រើនទៀត។
វេទិកា៖ Illumina NovaSeq Platform
-
ហ្សែនផ្សិត
Biomarker Technologies ផ្តល់នូវការស្ទង់មតិហ្សែន ហ្សែនដ៏ល្អ និងហ្សែនពេញលេញនៃផ្សិត អាស្រ័យលើគោលដៅស្រាវជ្រាវជាក់លាក់។លំដាប់ហ្សែន ការជួបប្រជុំគ្នា និងចំណារពន្យល់មុខងារអាចសម្រេចបានដោយការរួមបញ្ចូលគ្នានូវលំដាប់ជំនាន់បន្ទាប់ + លំដាប់ជំនាន់ទី 3 ដើម្បីសម្រេចបានការប្រមូលផ្តុំហ្សែនកម្រិតខ្ពស់។បច្ចេកវិទ្យា Hi-C ក៏អាចត្រូវបានគេប្រើប្រាស់ផងដែរ ដើម្បីជួយសម្រួលដល់ការប្រមូលផ្តុំហ្សែននៅកម្រិតក្រូម៉ូសូម។
វេទិកា៖PacBio Sequel II
Nanopor PromethION P48
វេទិកា Illumina NovaSeq
-
កញ្ចប់ឧបករណ៍
BMKCloud គឺជាវេទិកាជីវព័ត៌មានឈានមុខគេដែលផ្តល់នូវដំណោះស្រាយតែមួយគត់សម្រាប់កម្មវិធីហ្សែន ដែលត្រូវបានជឿទុកចិត្តយ៉ាងទូលំទូលាយដោយអ្នកស្រាវជ្រាវក្នុងវិស័យផ្សេងៗរួមទាំងផ្នែកវេជ្ជសាស្ត្រ កសិកម្ម បរិស្ថាន។ ធនធានកុំព្យូទ័រ មូលដ្ឋានទិន្នន័យសាធារណៈ វគ្គសិក្សាតាមអ៊ីនធឺណិត bioinformtic ។ ការវិភាគជាដើម។
-
បាក់តេរីពេញលេញហ្សែន
Biomarker Technologies ផ្តល់សេវាកម្មលំដាប់លំដោយលើការបង្កើតហ្សែនបាក់តេរីពេញលេញជាមួយនឹងគម្លាតសូន្យ។លំហូរការងារចម្បងនៃបាក់តេរី ការសាងសង់ហ្សែនពេញលេញ រួមមានការបន្តបន្ទាប់គ្នាជំនាន់ទីបី ការជួបប្រជុំគ្នា ចំណារពន្យល់មុខងារ និងការវិភាគជីវព័ត៌មានកម្រិតខ្ពស់ដែលបំពេញគោលដៅស្រាវជ្រាវជាក់លាក់។ការកំណត់រចនាសម្ព័ន្ធហ្សែនរបស់បាក់តេរីកាន់តែទូលំទូលាយផ្តល់អំណាចឱ្យបង្ហាញពីយន្តការមូលដ្ឋានដែលស្ថិតនៅក្រោមដំណើរការជីវសាស្រ្តរបស់ពួកគេ ដែលអាចផ្តល់ឯកសារយោងដ៏មានតម្លៃសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវហ្សែននៅក្នុងប្រភេទ eukaryotic ខ្ពស់ជាង
វេទិកា៖វេទិកា Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
-
RNA តូច
RNAs តូចគឺជាប្រភេទនៃ RNA ដែលមិនសរសេរកូដខ្លីដែលមានប្រវែងជាមធ្យម 18-30 nt រួមទាំង miRNA, siRNA និង piRNA ។RNAs តូចៗទាំងនេះត្រូវបានរាយការណ៍យ៉ាងច្រើនថាមានជាប់ពាក់ព័ន្ធក្នុងដំណើរការជីវសាស្រ្តផ្សេងៗដូចជាការបំផ្លាញ mRNA ការរារាំងការបកប្រែ ការបង្កើត heterochromatin ជាដើម។ ការវិភាគតាមលំដាប់នៃ SmallRNA ត្រូវបានអនុវត្តយ៉ាងទូលំទូលាយនៅក្នុងការសិក្សាលើការអភិវឌ្ឍន៍សត្វ/រុក្ខជាតិ ជំងឺ មេរោគ។ល។ វេទិកាការវិភាគតាមលំដាប់មានការវិភាគស្តង់ដារ និងការជីកយករ៉ែទិន្នន័យកម្រិតខ្ពស់។ផ្អែកលើទិន្នន័យ RNA-seq ការវិភាគស្តង់ដារអាចសម្រេចបាននូវការកំណត់អត្តសញ្ញាណ និងការព្យាករណ៍ miRNA ការព្យាករណ៍ហ្សែនគោលដៅ miRNA ចំណារពន្យល់ និងការវិភាគការបញ្ចេញមតិ។ការវិភាគកម្រិតខ្ពស់អាចឱ្យការស្វែងរក និងការទាញយក miRNA ផ្ទាល់ខ្លួន ការបង្កើតដ្យាក្រាម Venn, miRNA និងការកសាងបណ្តាញហ្សែនគោលដៅ។
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS គឺជាវេទិកាវិភាគលំដាប់ហ្សែនទាំងមូល ដែលត្រូវបានបង្កើតឡើងដោយផ្អែកលើបទពិសោធន៍ដ៏សម្បូរបែបនៅក្នុង Biomarker Technologies។វេទិកាងាយស្រួលប្រើនេះអនុញ្ញាតឱ្យដាក់បញ្ជូនរហ័សនៃលំហូរការងារវិភាគរួមបញ្ចូលគ្នាដោយគ្រាន់តែកំណត់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រមូលដ្ឋានមួយចំនួនដែលសមសម្រាប់ទិន្នន័យលំដាប់ DNA ដែលបង្កើតចេញពីវេទិកា Illumina និងវេទិកាលំដាប់ BGI ។វេទិកានេះត្រូវបានដាក់ពង្រាយនៅលើម៉ាស៊ីនមេកុំព្យូទ័រដែលមានដំណើរការខ្ពស់ ដែលផ្តល់អំណាចដល់ការវិភាគទិន្នន័យប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាពខ្ពស់ក្នុងរយៈពេលកំណត់។ការជីកយករ៉ែទិន្នន័យផ្ទាល់ខ្លួនអាចរកបានដោយផ្អែកលើការវិភាគស្តង់ដារ រួមទាំងសំណួរហ្សែនដែលបានផ្លាស់ប្តូរ ការរចនាបឋម PCR ជាដើម។
-
mRNA(យោង)
ប្រតិចារិកគឺជាតំណភ្ជាប់រវាងព័ត៌មានហ្សែនហ្សែន និងប្រូតេអូមនៃមុខងារជីវសាស្រ្ត។បទប្បញ្ញត្តិកម្រិតប្រតិចារិកគឺសំខាន់បំផុត និងជាទម្រង់បទប្បញ្ញត្តិដែលត្រូវបានសិក្សាយ៉ាងទូលំទូលាយបំផុតនៃសារពាង្គកាយ។ការធ្វើប្រតិចារិកតាមលំដាប់លំដោយអាចតម្រៀបប្រតិចារិកនៅចំណុចណាមួយក្នុងពេល ឬស្ថិតក្រោមលក្ខខណ្ឌណាមួយ ដោយមានដំណោះស្រាយត្រឹមត្រូវចំពោះនុយក្លេអូទីតតែមួយ។ វាអាចឆ្លុះបញ្ចាំងយ៉ាងស្វាហាប់អំពីកម្រិតនៃការចម្លងហ្សែន កំណត់អត្តសញ្ញាណ និងកំណត់បរិមាណនៃប្រតិចារឹកដ៏កម្រ និងធម្មតាក្នុងពេលដំណាលគ្នា និងផ្តល់ព័ត៌មានរចនាសម្ព័ន្ធនៃ គំរូប្រតិចារឹកជាក់លាក់។
នាពេលបច្ចុប្បន្ននេះ បច្ចេកវិជ្ជា transcriptome sequencing ត្រូវបានប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយនៅក្នុងវិស័យកសិកម្ម វេជ្ជសាស្ត្រ និងផ្នែកស្រាវជ្រាវផ្សេងទៀត រួមទាំងបទប្បញ្ញត្តិនៃការអភិវឌ្ឍន៍សត្វ និងរុក្ខជាតិ ការបន្សាំបរិស្ថាន អន្តរកម្មនៃប្រព័ន្ធភាពស៊ាំ ការធ្វើមូលដ្ឋានីយកម្មហ្សែន ប្រភេទសត្វ ការវិវត្តន៍ហ្សែន និងការរកឃើញដុំសាច់ និងការរកឃើញជំងឺហ្សែន។
-
Metagenomics (NGS)
វេទិកាវិភាគនេះត្រូវបានរចនាឡើងសម្រាប់ការវិភាគទិន្នន័យមេតាណមនៃកាំភ្លើងខ្លីដោយផ្អែកលើបទពិសោធន៍ជាច្រើនឆ្នាំ។វាមានដំណើរការការងាររួមបញ្ចូលគ្នាដែលមានការវិភាគមេតាណូមិកដែលត្រូវការជាទូទៅ រួមទាំងដំណើរការទិន្នន័យ ការសិក្សាកម្រិតប្រភេទ ការសិក្សាកម្រិតមុខងារហ្សែន ការបំប្លែងមេតាហ្សែន។ ការកំណត់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រ ការបង្កើតតួលេខផ្ទាល់ខ្លួន។ល។
-
LncRNA
RNAs ដែលមិនសរសេរកូដវែង (lncRNA) គឺជាប្រភេទនៃប្រតិចារិកដែលមានប្រវែងវែងជាង 200 nt ដែលមិនអាចសរសេរកូដប្រូតេអ៊ីនបាន។ភ័ស្តុតាងប្រមូលផ្តុំបង្ហាញថាភាគច្រើននៃ lncRNAs ទំនងជាមានមុខងារ។បច្ចេកវិជ្ជានៃការរៀបចំលំដាប់លំដោយកម្រិតខ្ពស់ និងឧបករណ៍វិភាគជីវព័ត៌មានផ្តល់អំណាចឱ្យយើងបង្ហាញលំដាប់លំដោយ lncRNA និងព័ត៌មានកំណត់ទីតាំងកាន់តែមានប្រសិទ្ធភាព និងនាំឱ្យយើងរកឃើញ lncRNAs ជាមួយនឹងមុខងារបទប្បញ្ញត្តិសំខាន់ៗ។BMKCloud មានមោទនភាពក្នុងការផ្តល់ជូនអតិថិជនរបស់យើងនូវវេទិកាវិភាគលំដាប់ lncRNA ដើម្បីសម្រេចបាននូវការវិភាគ lncRNA លឿន គួរឱ្យទុកចិត្ត និងអាចបត់បែនបាន។
-
GWAS
ការសិក្សាអំពីសមាគមទូទាំងហ្សែន (GWAS) មានគោលបំណងកំណត់អត្តសញ្ញាណការប្រែប្រួលហ្សែន (ហ្សែន) ដែលទាក់ទងនឹងលក្ខណៈជាក់លាក់ (phenotype) ។ការសិក្សារបស់ GWA ស៊ើបអង្កេតសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែនឆ្លងកាត់ហ្សែនទាំងមូលនៃបុគ្គលមួយចំនួនធំ និងព្យាករណ៍ពីសមាគមហ្សែន - phenotype ដោយការវិភាគស្ថិតិនៅកម្រិតប្រជាជន។ការបន្តហ្សែនទាំងមូលអាចរកឃើញនូវការប្រែប្រួលហ្សែនទាំងអស់។ការភ្ជាប់ជាមួយទិន្នន័យ phenotypic GWAS អាចត្រូវបានដំណើរការដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណ SNPs, QTLs ដែលទាក់ទងនឹង phenotypes និងហ្សែនបេក្ខជន ដែលគាំទ្រយ៉ាងខ្លាំងដល់ការបង្កាត់ពូជសត្វ/រុក្ខជាតិទំនើប។SLAF គឺជាយុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀបហ្សែនសាមញ្ញដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯង ដែលរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ដែលចែកចាយទូទាំងហ្សែនគឺ SNP ។SNPs ទាំងនេះ ជាសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែនម៉ូលេគុល អាចត្រូវបានដំណើរការសម្រាប់ការសិក្សាអំពីទំនាក់ទំនងជាមួយនឹងលក្ខណៈគោលដៅ។វាគឺជាយុទ្ធសាស្ត្រដ៏មានប្រសិទ្ធភាពក្នុងការកំណត់អត្តសញ្ញាណលក្ខណៈស្មុគស្មាញដែលទាក់ទងនឹងការប្រែប្រួលហ្សែន។
-
Nanopore ប្រតិចារិកប្រវែងពេញ
isoforms ជំនួសដ៏ស្មុគស្មាញ និងអថេរនៅក្នុងសារពាង្គកាយគឺជាយន្តការហ្សែនដ៏សំខាន់សម្រាប់ការគ្រប់គ្រងការបញ្ចេញហ្សែន និងភាពសម្បូរបែបនៃប្រូតេអ៊ីន។ការកំណត់អត្តសញ្ញាណត្រឹមត្រូវនៃរចនាសម្ព័ន្ធប្រតិចារិកគឺជាមូលដ្ឋានសម្រាប់ការសិក្សាស៊ីជម្រៅនៃទម្រង់បទប្បញ្ញត្តិនៃការបញ្ចេញហ្សែន។វេទិកាលំដាប់ Nanopore បាននាំមកនូវការសិក្សា transcriptomic ដោយជោគជ័យដល់កម្រិត isoform ។វេទិកាវិភាគនេះត្រូវបានរចនាឡើងដើម្បីវិភាគទិន្នន័យ RNA-Seq ដែលបង្កើតនៅលើវេទិកា Nanopore ដោយផ្អែកលើហ្សែនយោង ដែលសម្រេចបាននូវការវិភាគគុណភាព និងបរិមាណទាំងកម្រិតហ្សែន និងកម្រិតប្រតិចារិក។
-
រង្វង់-RNA
Circular RNA (circRNA) គឺជាប្រភេទ RNA ដែលមិនសរសេរកូដ ដែលថ្មីៗនេះត្រូវបានគេរកឃើញថាដើរតួនាទីយ៉ាងសំខាន់ក្នុងបណ្តាញបទប្បញ្ញត្តិពាក់ព័ន្ធនឹងការអភិវឌ្ឍន៍ ភាពធន់នឹងបរិស្ថាន។ល។ ខុសពីម៉ូលេគុល RNA លីនេអ៊ែរ ឧទាហរណ៍ mRNA, lncRNA, 3′ និង 5′ ចុងបញ្ចប់នៃ circRNA ត្រូវបានភ្ជាប់ជាមួយគ្នាដើម្បីបង្កើតជារចនាសម្ព័ន្ធរាងជារង្វង់ ដែលជួយសង្រ្គោះពួកវាពីការរំលាយអាហាររបស់ exonuclease និងមានស្ថេរភាពជាង RNA លីនេអ៊ែរភាគច្រើន។CircRNA ត្រូវបានគេរកឃើញថាមានមុខងារចម្រុះក្នុងការគ្រប់គ្រងការបញ្ចេញហ្សែន។CircRNA អាចដំណើរការជា ceRNA ដែលភ្ជាប់ miRNA ប្រកួតប្រជែង ដែលគេស្គាល់ថាជា អេប៉ុង miRNA ។វេទិកាការវិភាគលំដាប់ CircRNA ផ្តល់អំណាចដល់រចនាសម្ព័ន្ធ circRNA និងការវិភាគការបញ្ចេញមតិ ការព្យាករណ៍គោលដៅ និងការវិភាគរួមគ្នាជាមួយប្រភេទផ្សេងទៀតនៃម៉ូលេគុល RNA
