ខណៈពេលដែលលំដាប់ mRNA ដែលមានមូលដ្ឋានលើ NGS បម្រើជាឧបករណ៍ចម្រុះសម្រាប់ការកំណត់បរិមាណនៃការបញ្ចេញហ្សែន ការពឹងផ្អែករបស់វាលើការអានខ្លីៗដាក់កម្រិតលើប្រសិទ្ធភាពរបស់វាក្នុងការវិភាគការចម្លងស្មុគ្រស្មាញ។ម៉្យាងវិញទៀត PacBio sequencing (Iso-Seq) ប្រើប្រាស់បច្ចេកវិទ្យាអានវែង ដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានលំដាប់នៃ mRNA transcripts ប្រវែងពេញ។វិធីសាស្រ្តនេះជួយសម្រួលដល់ការរុករកយ៉ាងទូលំទូលាយនៃការភ្ជាប់ជំនួស ការបញ្ចូលហ្សែន និង poly-adenylation ទោះបីជាវាមិនមែនជាជម្រើសចម្បងសម្រាប់បរិមាណនៃការបញ្ចេញហ្សែនក៏ដោយ។ការរួមបញ្ចូលគ្នា 2+3 ភ្ជាប់គម្លាតរវាង Illumina និង PacBio ដោយពឹងផ្អែកលើការអាន PacBio HiFi ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណសំណុំពេញលេញនៃ isoforms ប្រតិចារិក និង NGS លំដាប់សម្រាប់បរិមាណនៃ isoforms ដូចគ្នា។
វេទិកា៖ PacBio Sequel II និង Illumina NovaSeq