BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ផលិតផល

លំដាប់ហ្សែនរបស់រុក្ខជាតិ/សត្វទាំងមូល

ការរៀបចំឡើងវិញនូវហ្សែនទាំងមូល ដែលត្រូវបានគេស្គាល់ថាជា WGS អនុញ្ញាតឱ្យបង្ហាញនូវការផ្លាស់ប្តូរទាំងធម្មតា និងកម្រនៅលើហ្សែនទាំងមូល រួមមាន Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ការបញ្ចូលការលុប (InDel) បំរែបំរួលរចនាសម្ព័ន្ធ (SV) និងបំរែបំរួលលេខចម្លង (CNV) )SVs បង្កើតបានជាផ្នែកធំនៃមូលដ្ឋានបំរែបំរួលជាង SNPs ហើយមានឥទ្ធិពលកាន់តែខ្លាំងលើហ្សែន ដែលមានឥទ្ធិពលយ៉ាងសំខាន់ទៅលើសារពាង្គកាយមានជីវិត។ការអានបន្តបន្ទាប់គ្នាយូរអនុញ្ញាតឱ្យកំណត់អត្តសញ្ញាណបំណែកធំ ៗ និងបំរែបំរួលដ៏ស្មុគស្មាញ ពីព្រោះការអានយូរធ្វើឱ្យវាកាន់តែងាយស្រួលក្នុងការឆ្លងកាត់ក្រូម៉ូសូមលើតំបន់ស្មុគស្មាញដូចជា ការនិយាយឡើងវិញ tandem តំបន់សម្បូរ GC/AT និងតំបន់ hyper-variable ។

វេទិកា៖ Illumina, PacBio, Nanopore


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

ការបោះពុម្ពផ្សាយពិសេស

1. គុណសម្បត្តិនៃសេវាកម្ម

បទពិសោធន៍យ៉ាងទូលំទូលាយក្នុងការរៀបចំលំដាប់ហ្សែនសម្រាប់ជាង 1000 ប្រភេទ។

ករណីដែលបានបោះពុម្ពផ្សាយជាង 800 ដែលមានកត្តាផលប៉ះពាល់លើសពី 4000។

ការវិភាគជីវព័ត៌មានយ៉ាងទូលំទូលាយលើការហៅការប្រែប្រួល និងការវិភាគមុខងារ។

2. លក្ខណៈបច្ចេកទេសនៃសេវាកម្ម

វេទិកា

បណ្ណាល័យ

ជម្រៅ seq ដែលបានណែនាំ

អ៊ីលលូណា

PE 150

សម្រាប់ SNP ការហៅ InDel ≥ 10x

សម្រាប់ SV ការហៅ CNY ≥ 30x

 

 

ណាណូប៉ូរ

 

8 គីឡូបៃ

សម្រាប់ SV ការហៅ CNY ≥ 20x

Pacbio

ស៊ី.ស៊ី.អេស

15 គីឡូបៃ

សម្រាប់ការហៅទូរសព្ទ SNP, InDel, SV, CNY ≥ 10x

3. តម្រូវការគំរូ

វេទិកា

Conc.(ng/μL)

 

បរិមាណ (ng)

 

ភាព​បរិសុទ្ធ

 

ជែល Agarose

 

OD260/280

OD260/230

1. ជម្រះក្រុមតន្រ្តីចម្បងដោយគ្មាន ឬកំណត់ការរិចរិលត្រូវបានគេសង្កេតឃើញនៅលើជែល។

2. គ្មាន ឬកំណត់ RNA ឬការចម្លងរោគប្រូតេអ៊ីន

 

អ៊ីលលូណា

≥1

≥30

 

-

-

ណាណូប៉ូរ

 

≥30

អាស្រ័យលើទិន្នផលទិន្នន័យ

10 μg / កោសិកា

១.៧-២.២

≥1.5

Pacbio

ស៊ី.ស៊ី.អេស

≥50

១.៧-២.២

1.8-2.5

4. ការវិភាគជីវព័ត៌មាន

wps_doc_3

5. លំហូរការងារសេវាកម្ម

ការចែកចាយគំរូ

ការចែកចាយគំរូ

ការពិសោធន៍សាកល្បង

ការទាញយក DNA

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

លំដាប់

លំដាប់

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

数据上传-០៣

ការផ្តល់ទិន្នន័យ


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • 1) ស្ថិតិនៃការធ្វើផែនទីហ្សែន

    តារាងទី 1 ស្ថិតិនៃលទ្ធផលផែនទី

    wps_doc_5

    រូបភាពទី 1 ការចែកចាយទំហំបញ្ចូល និងអានការគ្របដណ្តប់។

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) ការរកឃើញភាពខុសគ្នា

    រូបភាពទី 2 ស្ថិតិ និងចំណារពន្យល់របស់ SNP/INDEL/SV ក្នុងចំណោមគំរូ

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    រូបភាពទី 3 ការចែកចាយហ្សែនធំទូលាយនៃការប្រែប្រួល

    wps_doc_9

    3) ចំណារពន្យល់មុខងារនៃការប្រែប្រួល

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    ឆ្នាំ 2019

    ទំនាក់ទំនងធម្មជាតិ

    ការបន្តហ្សែនទាំងមូលបង្ហាញពីប្រភពដើម Brassica napus និងទីតាំងហ្សែនពាក់ព័ន្ធនឹងការកែលម្អរបស់វា

    ឆ្នាំ ២០២០

    PNAS

    ប្រភពដើមនៃការវិវត្តន៍ និងប្រវត្តិនៃការចិញ្ចឹមត្រីមាស (Carassius auratus)

    2021

    ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ

    ហ្សែនយោងនៃប្រភេទសត្វល្មូនទាំងពីរប្រភេទ

    2021

    ទិនានុប្បវត្តិជីវបច្ចេកវិទ្យារុក្ខជាតិ

    ហត្ថលេខាហ្សែននៃបន្លែ និងប្រេងគ្រាប់ allopolyploid Brassicajuncea និងហ្សែនហ្សែនគ្រប់គ្រងការប្រមូលផ្តុំនៃ glucosinolates

    ឆ្នាំ 2019

    រុក្ខជាតិម៉ូលេគុល

    ការបន្តហ្សែនទាំងមូលនៃការប្រមូលផ្តុំទូទាំងពិភពលោកនៃការចូលប្រើគ្រាប់ពូជ rapeseed បង្ហាញពីមូលដ្ឋានហ្សែននៃភាពខុសគ្នានៃ ecotype របស់ពួកគេ

    ២០២២

    ការស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្ម

    ការវិភាគនៃសមាគមធំទូលាយនៃហ្សែនផ្តល់នូវការយល់ដឹងអំពីម៉ូលេគុលទៅលើការប្រែប្រួលធម្មជាតិនៃទំហំគ្រាប់ឪឡឹក

    2021

    ទិនានុប្បវត្តិនៃការពិសោធន៍រុក្ខសាស្ត្រ

    ការសិក្សាអំពីសមាគមជុំវិញហ្សែនកំណត់អត្តសញ្ញាណបំរែបំរួលនៃ GhSAD1 ដែលផ្តល់ភាពអត់ធ្មត់ត្រជាក់នៅក្នុងកប្បាស

    2021

    ទិនានុប្បវត្តិនៃការពិសោធន៍រុក្ខសាស្ត្រ

    ការសិក្សាអំពីសមាគមជុំវិញហ្សែន និងការប្រៀបធៀបប្រតិចារិកបង្ហាញឱ្យឃើញនូវ QTL ប្រលោមលោក និងហ្សែនបេក្ខជនដែលគ្រប់គ្រងទំហំផ្កានៅក្នុងគ្រាប់ពូជ rapeseed

    ទទួលបានសម្រង់

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖