ការវិវត្តន៍ហ្សែន
ហ្សែនណូវ៉ូ
ការជួបប្រជុំ|ការកំណត់ភេទ ការងារបន្តបន្ទាប់គ្នាទាំងមូល និងសេវាកម្មជីវព័ត៌មានដោយផ្នែកត្រូវបានផ្តល់ដោយ Biomarker Techonologies ។
អរូបី
“រូបសញ្ញានៃសត្វនាគសមុទ្ររួមមាន ចុងស្លឹកដូចស្លឹក មាត់បំពង់គ្មានធ្មេញ និងការមានផ្ទៃពោះជាបុរសដែលពាក់ព័ន្ធនឹងការភ្ញាស់ពងដែលបង្កកំណើតនៅលើ "បំណះកូន" ។យើង de novo-sequenced genomes បុរស និងស្ត្រីនៃ seadragon ធម្មតា (Phyllopteryx taeniolatus) និងប្រភេទដែលទាក់ទងយ៉ាងជិតស្និទ្ធរបស់វា ត្រីពងក្រពើ (Syngnathoides biaculeatus) ។ទម្រង់ប្រតិចារិកពីភាពថ្មីថ្មោងនៃការវិវត្តន៍ ដែលជាផ្នែកបន្ថែមដូចស្លឹក បង្ហាញថាសំណុំហ្សែនដែលជាធម្មតាពាក់ព័ន្ធនឹងការវិវឌ្ឍន៍ចុងត្រូវបានជ្រើសរើស ក៏ដូចជាការពង្រឹងស្គ្រីបត្រានសម្រាប់ការជួសជុលជាលិកា និងហ្សែនការពារភាពស៊ាំ។zebrafish mutants សម្រាប់ scpp5 ដែលត្រូវបានបាត់បង់នៅក្នុង syngnathids ទាំងអស់ត្រូវបានគេរកឃើញថាមានធ្មេញ pharyngeal ខ្វះខាត ឬខូចទ្រង់ទ្រាយ ដោយគាំទ្រសម្មតិកម្មដែលថាការបាត់បង់ scpp5 បានរួមចំណែកដល់ការបាត់បង់ធ្មេញនៅក្នុង syngnathids ។ការរួមភេទដែលកំណត់ទីតាំងដែលអ៊ិនកូដហ្សែន amhr2y ជាក់លាក់របស់បុរសដែលត្រូវបានចែករំលែកដោយ seadragon ធម្មតា និងត្រី pipefish ក្រពើត្រូវបានកំណត់អត្តសញ្ញាណ។ ”
សំភារៈនិងវិធីសាស្រ្ត:
សម្ភារៈ
Fនាគសមុទ្រធម្មតារបស់យើង (P. taeniolatus) និងត្រីពងក្រពើពីរ (S. biaculeatus) គំរូ។សត្វនាគសមុទ្រធម្មតាពីរ (ឈ្មោលមួយ និងស្រីមួយ) និង ត្រីពងក្រពើពីរ (ឈ្មោលមួយ និងស្រីមួយ) បុគ្គលត្រូវបានប្រើប្រាស់សម្រាប់ការបន្តពូជហ្សែនទាំងមូល ហើយបុគ្គលសត្វនាគសមុទ្រធម្មតាពីរនាក់ទៀតត្រូវបានប្រើសម្រាប់ដំណើរការបន្តពូជហ្សែន។
យុទ្ធសាស្ត្រលំដាប់ហ្សែន
២បណ្ណាល័យ 70/350 bp (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) ឬ Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000)។ ការរៀបចំតាមលំដាប់ និងបុគ្គលនាគសមុទ្រធម្មតាបុរសពីរផ្សេងទៀតត្រូវបានប្រើសម្រាប់ការបន្តហ្សែន។
លំដាប់ប្រតិចារិក
Fឬសត្វនាគសមុទ្រទូទៅ ខួរក្បាល ភ្នែក ក្រអូមមាត់ ថ្លើម បេះដូង តម្រងនោម មេសនតេរី ពោះវៀន សាច់ដុំ ព្រុយ ស្បែក ចុងស្លឹក ពងស្វាស និងអូវែត្រូវបានប្រមូល។
យុទ្ធសាស្រ្តប្រមូលផ្តុំ Genome de Novo
Canu (ការកែតម្រូវ) + WTDBG2 (ការជួបប្រជុំគ្នា) + Pilon (ប៉ូឡូញ) + Lachesis (Hi-C) ។
លទ្ធផលចម្បង
រូបភព 1. លក្ខណៈសំខាន់ៗនៃសត្វនាគសមុទ្រធម្មតា (P. taeniolatus) និងត្រីពងក្រពើ (S. biaculeatus) និងទីតាំង phylogenetic របស់វា។
រូបភព 2. សរីរវិទ្យា និងការបង្កើតហ្សែននៃឧបសម្ព័ន្ធដូចស្លឹកនៅក្នុងនាគសមុទ្រធម្មតា (P. taeniolatus) ។
រូបភព 3. ហ្សែនកំណត់ការរួមភេទដោយដាក់នៅក្នុងសត្វនាគសមុទ្រទូទៅ (P. taeniolatus) និងត្រីពងក្រពើ (S. biaculeatus) ។
រូបភពទី 4. ផូណូតផូណូតផៃ្ទផែរីងហ្គេលនៅក្នុងត្រីហ្សេប្រ៊ូស អេសភីភី៥ មេម៉ូហ្សីហ្កាសស។
ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ០៨-មករា-២០២២