ការប្រមូលផ្តុំហ្សែន T2T, GAP ហ្សែនឥតគិតថ្លៃ
1stពូជស្រូវពីរ1
ចំណងជើង៖ ការជួបប្រជុំ និងសុពលភាពនៃហ្សែនយោងគ្មានគម្លាតពីរសម្រាប់ស្រូវ Xian/indica បង្ហាញពីការយល់ដឹងអំពីស្ថាបត្យកម្ម Plant Centromere
ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ម៉ោងផ្សាយ៖ ០១ មករា ២០២១។
វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យកសិកម្ម Huazhong ប្រទេសចិន
សម្ភារៈ
O. sativa xian/indicaពូជស្រូវ 'Zhenshan 97 (ZS97)' និង 'Minghui 63 (MH63)
យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប
NGS អាន + HiFi អាន + CLR អាន + BioNano + Hi-C
ទិន្នន័យ៖
ZS97: 8.34 Gb (~23x) HiFi អាន + 48.39 Gb (~131x) CLR អាន + 25 Gb(~69x) NGS + 2 BioNano Irys cells
MH63: 37.88 Gb (~103x) HiFi អាន + 48.97 Gb (~132x) CLR អាន + 28 Gb(~76x) NGS + 2 BioNano Irys cells
រូបភាពទី 1 ហ្សែនគ្មានគម្លាតពីរនៃអង្ករ (MH63 និង ZS97)
2ndហ្សែនចេក2
ចំណងជើង៖ ក្រូម៉ូសូមដែលមិនមានចន្លោះពីតេឡូមេរទៅតេឡូមេរនៃចេកដោយប្រើលំដាប់ណាណូ
ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ថ្ងៃទី ១៧ ខែ មេសា ឆ្នាំ ២០២១។
វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យ Paris-Saclay ប្រទេសបារាំង
សម្ភារៈ
haploid ទ្វេMusa acuminatasppmalaccensis(DH-Pahang)
តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖
របៀប HiSeq2500 PE250 + MinION/ PromethION (93Gb,~200X)+ ផែនទីអុបទិក (DLE-1+BspQ1)
តារាងទី 1 ការប្រៀបធៀបការផ្គុំហ្សែន Musa acuminata (DH-Pahang)
រូបភាពទី 2 ការប្រៀបធៀបស្ថាបត្យកម្មហ្សែន Musa
3rdហ្សែន Phaeodactylum tricornutum3
ចំណងជើង៖ ការជួបប្រជុំហ្សែននៃតេឡូមេរទៅតេឡូមេរP
heodactylum tricornutum
ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
ម៉ោងផ្សាយ៖ ថ្ងៃទី ០៤ ខែ ឧសភា ឆ្នាំ ២០២១
វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យវេស្ទើន ប្រទេសកាណាដា
សម្ភារៈ
Phaeodactylum tricornutum(ការប្រមូលវប្បធម៌នៃសារាយ និងប្រូហ្សូអា CCAP 1055/1)
តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖
1 Oxford Nanopore minION flow cell + a 2×75 paired-end-end-output NextSeq 550 run
រូបភាពទី 3 លំហូរការងារសម្រាប់ការផ្គុំហ្សែន telomere-to-telomere
4thហ្សែន CHM13 របស់មនុស្ស4
ចំណងជើង៖ លំដាប់ពេញលេញនៃហ្សែនមនុស្ស
ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ថ្ងៃទី ២៧ ខែ ឧសភា ឆ្នាំ ២០២១
វិទ្យាស្ថាន៖ វិទ្យាស្ថានសុខភាពជាតិ (NIH) សហរដ្ឋអាមេរិក
សម្ភារៈ៖ កោសិកា CHM13
តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖
30 × PacBio លំដាប់ជារង្វង់មូលមតិគ្នា (HiFi) , 120 × Oxford Nanopore លំដាប់អានវែងជ្រុល , 100 × Illumina PCR-Free sequencing (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), BioNano និង Strand-seq
តារាងទី 2 ការប្រៀបធៀបការផ្គុំហ្សែនរបស់មនុស្ស GRCh38 និង T2T-CHM13
ឯកសារយោង
1.Sergey Nurk et al ។លំដាប់ពេញលេញនៃហ្សែនរបស់មនុស្ស។bioRxiv 2021.05.26.445798;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Caroline Belser et al ។ក្រូម៉ូសូមដែលមិនមានចន្លោះពី Telomere ទៅ telomere នៃចេកដោយប្រើលំដាប់ណាណូ។bioRxiv 2021.04.16.440017;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al ។ការជួបប្រជុំគ្នានៃហ្សែន telomere-to-telomere នៃ Phaeodactylum tricornutum ។bioRxiv 2021.05.04.442596;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Jia-Ming Song et al ។ការជួបប្រជុំគ្នា និងសុពលភាពនៃហ្សែនយោងគ្មានគម្លាតពីរសម្រាប់ស្រូវ Xian/indica បង្ហាញពីការយល់ដឹងអំពីស្ថាបត្យកម្មរុក្ខជាតិ Centromere ។bioRxiv 2020.12.24.424073;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ពេលវេលាផ្សាយ៖ មករា-០៦-២០២២