BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ព័ត៌មាន

ការប្រមូលផ្តុំហ្សែន T2T, GAP ហ្សែនឥតគិតថ្លៃ

1stពូជស្រូវពីរ1

ចំណងជើង៖ ការជួបប្រជុំ និងសុពលភាពនៃហ្សែនយោងគ្មានគម្លាតពីរសម្រាប់ស្រូវ Xian/indica បង្ហាញពីការយល់ដឹងអំពីស្ថាបត្យកម្ម Plant Centromere

ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073

ម៉ោងផ្សាយ៖ ០១ មករា ២០២១។

វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យកសិកម្ម Huazhong ប្រទេសចិន

សម្ភារៈ

O. sativa xian/indicaពូជស្រូវ 'Zhenshan 97 (ZS97)' និង 'Minghui 63 (MH63)

យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប

NGS អាន + HiFi អាន + CLR អាន + BioNano + Hi-C

ទិន្នន័យ៖

ZS97: 8.34 Gb (~23x) HiFi អាន + 48.39 Gb (~131x) CLR អាន + 25 Gb(~69x) NGS + 2 BioNano Irys cells

MH63: 37.88 Gb (~103x) HiFi អាន + 48.97 Gb (~132x) CLR អាន + 28 Gb(~76x) NGS + 2 BioNano Irys cells

រូបភាព​ទី 1

រូបភាពទី 1 ហ្សែនគ្មានគម្លាតពីរនៃអង្ករ (MH63 និង ZS97)

2ndហ្សែនចេក2

ចំណងជើង៖ ក្រូម៉ូសូមដែលមិនមានចន្លោះពីតេឡូមេរទៅតេឡូមេរនៃចេកដោយប្រើលំដាប់ណាណូ

ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ថ្ងៃទី ១៧ ខែ មេសា ឆ្នាំ ២០២១។

វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យ Paris-Saclay ប្រទេសបារាំង

សម្ភារៈ

haploid ទ្វេMusa acuminatasppmalaccensis(DH-Pahang)

តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖

របៀប HiSeq2500 PE250 + MinION/ PromethION (93Gb,~200X)+ ផែនទីអុបទិក (DLE-1+BspQ1)

តារាងទី 1 ការប្រៀបធៀបការផ្គុំហ្សែន Musa acuminata (DH-Pahang)

តារាងទី 1-ការប្រៀបធៀបនៃ-GRCh38-និង-T2T-CHM13-ហ្សែនមនុស្ស-ការជួបប្រជុំគ្នា
រូបភាព-Musa-genomes-architecture-ប្រៀបធៀប

រូបភាពទី 2 ការប្រៀបធៀបស្ថាបត្យកម្មហ្សែន Musa

3rdហ្សែន Phaeodactylum tricornutum3

ចំណងជើង៖ ការជួបប្រជុំហ្សែននៃតេឡូមេរទៅតេឡូមេរP
heodactylum tricornutum

ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

ម៉ោងផ្សាយ៖ ថ្ងៃទី ០៤ ខែ ឧសភា ឆ្នាំ ២០២១

វិទ្យាស្ថាន៖ សាកលវិទ្យាល័យវេស្ទើន ប្រទេសកាណាដា

សម្ភារៈ

Phaeodactylum tricornutum(ការប្រមូលវប្បធម៌នៃសារាយ និងប្រូហ្សូអា CCAP 1055/1)

តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖

1 Oxford Nanopore minION flow cell + a 2×75 paired-end-end-output NextSeq 550 run

រូបភាព-លំហូរការងារ-សម្រាប់-telomere-to-telomere-genome-assembly-1-1024x740

រូបភាពទី 3 លំហូរការងារសម្រាប់ការផ្គុំហ្សែន telomere-to-telomere

4thហ្សែន CHM13 របស់មនុស្ស4

ចំណងជើង៖ លំដាប់ពេញលេញនៃហ្សែនមនុស្ស

ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

ពេលវេលាបង្ហោះ៖ ថ្ងៃទី ២៧ ខែ ឧសភា ឆ្នាំ ២០២១

វិទ្យាស្ថាន៖ វិទ្យាស្ថានសុខភាពជាតិ (NIH) សហរដ្ឋអាមេរិក

សម្ភារៈ៖ កោសិកា CHM13

តម្រៀបយុទ្ធសាស្ត្រ និងទិន្នន័យ៖

30 × PacBio លំដាប់ជារង្វង់មូលមតិគ្នា (HiFi) , 120 × Oxford Nanopore លំដាប់អានវែងជ្រុល , 100 × Illumina PCR-Free sequencing (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), BioNano និង Strand-seq

តារាងទី 2 ការប្រៀបធៀបការផ្គុំហ្សែនរបស់មនុស្ស GRCh38 និង T2T-CHM13

តារាង-ការប្រៀបធៀប-នៃ-Musa-acuminata-DH-Pahang-genome-assemblies

ឯកសារយោង

1.Sergey Nurk et al ។លំដាប់ពេញលេញនៃហ្សែនរបស់មនុស្ស។bioRxiv 2021.05.26.445798;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

2.Caroline Belser et al ។ក្រូម៉ូសូមដែលមិនមានចន្លោះពី Telomere ទៅ telomere នៃចេកដោយប្រើលំដាប់ណាណូ។bioRxiv 2021.04.16.440017;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

3.Daniel J. Giguere et al ។ការជួបប្រជុំគ្នានៃហ្សែន telomere-to-telomere នៃ Phaeodactylum tricornutum ។bioRxiv 2021.05.04.442596;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

4.Jia-Ming Song et al ។ការជួបប្រជុំគ្នា និងសុពលភាពនៃហ្សែនយោងគ្មានគម្លាតពីរសម្រាប់ស្រូវ Xian/indica បង្ហាញពីការយល់ដឹងអំពីស្ថាបត្យកម្មរុក្ខជាតិ Centromere ។bioRxiv 2020.12.24.424073;ដូយ៖https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073


ពេលវេលាផ្សាយ៖ មករា-០៦-២០២២

ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖