ព័ត៌មាន

Transposable element (TE) amplification ត្រូវបានទទួលស្គាល់ថាជាកម្លាំងជំរុញការសម្រុះសម្រួលការពង្រីកទំហំហ្សែន និងការវិវត្ត ប៉ុន្តែផលវិបាកសម្រាប់ការបង្កើតស្ថាបត្យកម្មហ្សែន 3D នៅតែមិនស្គាល់ភាគច្រើននៅក្នុងរុក្ខជាតិ។នៅទីនេះ យើងរាយការណ៍ពីការជួបប្រជុំហ្សែនថ្នាក់ទីយោងសម្រាប់កប្បាសបីប្រភេទដែលមានទំហំ 3 ដងក្នុងទំហំហ្សែន ពោលគឺGossypium rotundifolium(K2),G. សួនសត្វ(A2), និងG. Raimondii(D5) ដោយប្រើបច្ចេកវិទ្យា Oxford Nanopore Technologies ។ការវិភាគហ្សែនប្រៀបធៀបចងក្រងឯកសារលម្អិតនៃការពង្រីក TE ជាក់លាក់តាមពូជពង្សដែលរួមចំណែកដល់ភាពខុសគ្នានៃទំហំហ្សែនធំ (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) និងបង្ហាញពីខ្លឹមសារហ្សែនដែលត្រូវបានអភិរក្ស និងទំនាក់ទំនងសំយោគក្នុងចំណោមហ្សែន។យើងបានរកឃើញថាប្រហែល 17% នៃហ្សែនសំយោគបង្ហាញការផ្លាស់ប្តូរស្ថានភាពក្រូម៉ាទីនរវាងផ្នែកសកម្ម ("A") និងអសកម្ម ("B") ហើយការពង្រីក TE ត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងការកើនឡើងនៃសមាមាត្រនៃផ្នែក A នៅក្នុងតំបន់ហ្សែន (~ 7,000 ហ្សែន។ ) ក្នុង K2 និង A2 ទាក់ទងទៅនឹង D5 ។មានតែ 42% នៃព្រំដែនដែលជាប់ទាក់ទងគ្នា (TAD) ដែលត្រូវបានអភិរក្សក្នុងចំណោមហ្សែនទាំងបី។ទិន្នន័យរបស់យើងពាក់ព័ន្ធនឹងការពង្រីកថ្មីៗនៃ TEs បន្ទាប់ពីការបង្កើតព្រំដែន TAD ជាក់លាក់តាមពូជពង្ស។ការសិក្សានេះបានបង្ហាញពីតួនាទីនៃការពង្រីកហ្សែនដែលសម្របសម្រួលដោយ transposon ក្នុងការវិវត្តនៃរចនាសម្ព័ន្ធក្រូម៉ាទីនលំដាប់ខ្ពស់នៅក្នុងរុក្ខជាតិ។