ហ្សែន
ការផ្គុំខ្នាតក្រូម៉ូសូម និងការវិភាគនៃដំណាំជីវម៉ាស Miscanthus lutarioriparius genome
លំដាប់ណាណូផឺ |អ៊ីលីណា |សួស្តី-C |RNA- sequencing |Phylogeny
នៅក្នុងការសិក្សានេះ Biomarker Technologies បានផ្តល់ការគាំទ្រផ្នែកបច្ចេកទេសលើការរៀបចំលំដាប់ Nanopore, de novo genome assembly, Hi-C assisted assembly ជាដើម។
អរូបី
Miscanthusជារុក្ខជាតិដែលមានអាយុច្រើនឆ្នាំ rhizomatous មានសក្តានុពលដ៏អស្ចារ្យសម្រាប់ការផលិតជីវថាមពលសម្រាប់ជីវម៉ាស់ខ្ពស់ និងធន់នឹងភាពតានតឹង។យើងរាយការណ៍ពីការប្រមូលផ្តុំខ្នាតក្រូម៉ូសូមMiscanthus lutarioripariusជីណូមដោយរួមបញ្ចូលគ្នានូវលំដាប់ Oxford Nanopore និងបច្ចេកវិទ្យា Hi-C ។ការជួបប្រជុំគ្នា 2.07-Gb គ្របដណ្តប់ 96.64% នៃហ្សែនដែលមានទំនាក់ទំនង N50 នៃ 1.71 Mb ។លំដាប់ centromere និង telomere ត្រូវបានប្រមូលផ្តុំសម្រាប់ក្រូម៉ូសូមទាំង 19 និងក្រូម៉ូសូម 10 រៀងគ្នា។ប្រភពដើម Allotetraploid នៃ M. lutarioriparius ត្រូវបានបញ្ជាក់ដោយប្រើផ្កាយរណប centromeric ឡើងវិញ។រចនាសម្ព័ន្ធហ្សែន tetraploid និងការរៀបចំឡើងវិញនៃក្រូម៉ូសូមជាច្រើនដែលទាក់ទងទៅនឹង sorghum ត្រូវបានបង្ហាញយ៉ាងច្បាស់។Tandem ចម្លងហ្សែននៃM. lutarioripariusមុខងារត្រូវបានពង្រឹងមិនត្រឹមតែនៅក្នុងលក្ខខណ្ឌដែលទាក់ទងនឹងការឆ្លើយតបទៅនឹងភាពតានតឹងប៉ុណ្ណោះទេថែមទាំងជីវសំយោគជញ្ជាំងកោសិកាផងដែរ។គ្រួសារហ្សែនទាក់ទងនឹងភាពធន់នឹងជំងឺ ជីវសំយោគជញ្ជាំងកោសិកា និងការដឹកជញ្ជូនអ៊ីយ៉ុងដែកត្រូវបានពង្រីក និងវិវឌ្ឍន៍យ៉ាងខ្លាំង។ការពង្រីកគ្រួសារទាំងនេះអាចជាមូលដ្ឋានហ្សែនដ៏សំខាន់សម្រាប់ការពង្រឹងលក្ខណៈគួរឱ្យកត់សម្គាល់នៃM. lutarioriparius ។
ស្ថិតិសំខាន់ៗនៃការប្រមូលផ្តុំហ្សែន
រូប។ទិដ្ឋភាពទូទៅនៃការជួបប្រជុំហ្សែន M. lutarioriparius
ព័ត៌មាន និងចំណុចសំខាន់ មានគោលបំណងចែករំលែកករណីជោគជ័យចុងក្រោយបង្អស់ជាមួយ Biomarker Technologies ដោយចាប់យកសមិទ្ធិផលវិទ្យាសាស្ត្រប្រលោមលោក ក៏ដូចជាបច្ចេកទេសលេចធ្លោដែលបានអនុវត្តក្នុងអំឡុងពេលសិក្សា។
ពេលវេលាផ្សាយ៖ ០៥-មករា-២០២២