ការវាយបញ្ចូលហ្សែនតាមរយៈកម្រិតខ្ពស់ ជាពិសេសលើចំនួនប្រជាជនក្នុងទ្រង់ទ្រាយធំ គឺជាជំហានជាមូលដ្ឋានក្នុងការសិក្សាអំពីទំនាក់ទំនងហ្សែន ដែលផ្តល់នូវមូលដ្ឋានហ្សែនសម្រាប់ការរកឃើញហ្សែនមុខងារ ការវិភាគការវិវត្តន៍។ល។ ) ត្រូវបានណែនាំដើម្បីកាត់បន្ថយការចំណាយតាមលំដាប់លំដោយក្នុងមួយគំរូ ខណៈពេលដែលរក្សាបាននូវប្រសិទ្ធភាពសមហេតុផលលើការរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែន។នេះត្រូវបានសម្រេចជាទូទៅដោយការស្រង់ចេញបំណែកដាក់កម្រិតនៅក្នុងជួរទំហំដែលបានផ្តល់ឱ្យ ដែលត្រូវបានគេហៅថាបណ្ណាល័យតំណាងកាត់បន្ថយ (RRL) ។ការបែងចែកការបែងចែកតាមទីតាំងជាក់លាក់ (SLAF-Seq) គឺជាយុទ្ធសាស្រ្តដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯងសម្រាប់ការរកឃើញ de novo SNP និងការធ្វើហ្សែន SNP នៃចំនួនប្រជាជនដ៏ធំ។
លំហូរការងារបច្ចេកទេស
SLAF ធៀបនឹងវិធីសាស្ត្រ RRL ដែលមានស្រាប់
អត្ថប្រយោជន៍នៃ SLAF
ប្រសិទ្ធភាពនៃការរកឃើញសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែនខ្ពស់ជាង- រួមផ្សំជាមួយនឹងបច្ចេកវិជ្ជាលំដាប់លំដោយខ្ពស់ SLAF-Seq អាចសម្រេចបានរាប់រយរាប់ពាន់ស្លាកដែលបានរកឃើញនៅក្នុងហ្សែនទាំងមូល ដើម្បីបំពេញសំណើគម្រោងស្រាវជ្រាវចម្រុះ ទាំងជាមួយ ឬជាមួយហ្សែនយោង។
ការរចនាពិសោធន៍តាមបំណង និងអាចបត់បែនបាន។- សម្រាប់គោលដៅស្រាវជ្រាវផ្សេងៗគ្នា ឬប្រភេទផ្សេងៗ យុទ្ធសាស្ត្ររំលាយអាហារអង់ស៊ីមផ្សេងៗគ្នាអាចរកបាន រួមទាំងអង់ស៊ីមតែមួយ អង់ស៊ីមពីរ និងការរំលាយអាហារពហុអង់ស៊ីម។យុទ្ធសាស្ត្ររំលាយអាហារនឹងត្រូវបានវាយតម្លៃជាមុននៅក្នុងស៊ីលីកូ ដើម្បីធានាបាននូវការរចនាអង់ស៊ីមដ៏ល្អប្រសើរ។
ប្រសិទ្ធភាពខ្ពស់ក្នុងការរំលាយអាហារអង់ស៊ីម- ការរំលាយអាហារអង់ស៊ីមដែលបានរចនាជាមុនផ្តល់នូវ SLAFs ចែកចាយស្មើៗគ្នាលើក្រូម៉ូសូម។ការប្រមូលបំណែកដែលមានប្រសិទ្ធភាពអាចសម្រេចបានលើសពី 95% ។
ជៀសវាងលំដាប់ដដែលៗ- ភាគរយនៃលំដាប់ដដែលៗនៅក្នុងទិន្នន័យ SLAF-Seq ត្រូវបានកាត់បន្ថយមកទាបជាង 5% ជាពិសេសនៅក្នុងប្រភេទសត្វដែលមានកម្រិតខ្ពស់នៃធាតុដដែលៗ ដូចជាស្រូវសាលី ពោតជាដើម។
ដំណើរការការងារជីវព័ត៌មានដែលបង្កើតដោយខ្លួនឯង។– BMK បានបង្កើតលំហូរការងារជីវព័ត៌មានរួមបញ្ចូលគ្នាដែលអាចអនុវត្តបានចំពោះបច្ចេកវិទ្យា SLAF-Seq ដើម្បីធានាបាននូវភាពជឿជាក់ និងភាពត្រឹមត្រូវនៃលទ្ធផលចុងក្រោយ។
ការអនុវត្ត SLAF
ផែនទីតំណពូជ
ការសាងសង់ផែនទីហ្សែនដង់ស៊ីតេខ្ពស់ និងការកំណត់អត្តសញ្ញាណទីតាំងគ្រប់គ្រងលក្ខណៈប្រភេទផ្កានៅក្នុង Chrysanthemum (Chrysanthemum x morifolium Ramat ។ )
ទិនានុប្បវត្តិ៖ ស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្ម បោះពុម្ពផ្សាយ៖ ឆ្នាំ ២០២០.៧
GWAS
ការកំណត់អត្តសញ្ញាណហ្សែនបេក្ខជនដែលត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងមាតិកា isofavone នៅក្នុងគ្រាប់ពូជសណ្តែកសៀង ដោយប្រើការភ្ជាប់ហ្សែន និងផែនទីតំណភ្ជាប់
ទិនានុប្បវត្តិ: ទិនានុប្បវត្តិ Plant បោះពុម្ពផ្សាយ: 2020/08/08
ហ្សែនវិវត្តន៍
ការវិភាគហ្សែនចំនួនប្រជាជន និងការជួបប្រជុំ de Novo បង្ហាញពីប្រភពដើមនៃស្រូវស្មៅជាល្បែងវិវត្តន៍
ទិនានុប្បវត្តិ៖ រុក្ខជាតិម៉ូលេគុលបោះពុម្ភ៖ 2019.5
ការវិភាគផ្នែកដាច់ដោយឡែក (BSA)
GmST1 ដែលអ៊ិនកូដស៊ុលហ្វូតូហ្វឺរ៉ាស ផ្តល់ភាពធន់នឹងមេរោគផ្សិតសណ្តែកសៀងប្រភេទ G2 និង G3
ទិនានុប្បវត្តិ៖ រុក្ខជាតិ កោសិកា និងបរិស្ថាន បោះពុម្ពផ្សាយ៖ 2021.04
ឯកសារយោង
ស៊ុន X, Liu D, Zhang X, et al ។SLAF-Seq៖ វិធីសាស្ត្រដ៏មានប្រសិទ្ធភាពនៃការរកឃើញ និងការធ្វើហ្សែន SNP ខ្នាតធំដោយប្រើប្រាស់លំដាប់លំដោយកម្រិតខ្ពស់[J]។Plos one, 2013, 8(3):e58700
ចម្រៀង X, Xu Y, Gao K, et al ។ការសាងសង់ផែនទីហ្សែនដង់ស៊ីតេខ្ពស់ និងការកំណត់អត្តសញ្ញាណទីតាំងគ្រប់គ្រងលក្ខណៈប្រភេទផ្កានៅក្នុង Chrysanthemum (Chrysanthemum × morifolium Ramat ។ )Hortic Res ។ឆ្នាំ ២០២០; ៧:១០៨។
Wu D, Li D, Zhao X, et al ។ការកំណត់អត្តសញ្ញាណហ្សែនបេក្ខជនដែលត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងមាតិកា isoflavone នៅក្នុងគ្រាប់ពូជសណ្តែកសៀង ដោយប្រើការភ្ជាប់ហ្សែនធំទូលាយ និងការគូសផែនទីតំណភ្ជាប់។Plant J. 2020;104(4): 950-963 ។
Sun J, Ma D, Tang L, et al ។ការវិភាគហ្សែនចំនួនប្រជាជន និងសភា De Novo បង្ហាញពីប្រភពដើមនៃស្រូវ Weedy ជាល្បែងវិវត្តន៍។រុក្ខជាតិម៉ុល។ឆ្នាំ 2019; 12(5): 632-647។រុក្ខជាតិម៉ុល។ឆ្នាំ 2018;១១(១១):១៣៦០-១៣៧៦។
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al ។GmST1 ដែលអ៊ិនកូដស៊ុលហ្វូតូហ្វឺរ៉ាស ផ្តល់ភាពធន់នឹងមេរោគផ្សិតសណ្តែកសៀងប្រភេទ G2 និង G3 ។កោសិការុក្ខជាតិ។2021;10.1111/pce.14066
ពេលវេលាផ្សាយ៖ មករា-០៤-២០២២