-
លំដាប់មេតាណុល (NGS)
Metagenome សំដៅលើបណ្តុំនៃសម្ភារៈហ្សែនសរុបនៃសហគមន៍ចម្រុះនៃសារពាង្គកាយ ដូចជា metagenome បរិស្ថាន មេតាហ្សែនរបស់មនុស្ស។ល។ វាមានហ្សែននៃអតិសុខុមប្រាណដែលអាចដាំដុះបាន និងមិនអាចដាំដុះបាន។លំដាប់ Metagenomic គឺជាឧបករណ៍ម៉ូលេគុលដែលប្រើដើម្បីវិភាគសម្ភារៈហ្សែនចម្រុះដែលស្រង់ចេញពីសំណាកបរិស្ថាន ដែលផ្តល់ព័ត៌មានលំអិតអំពីភាពសម្បូរបែបនៃប្រភេទសត្វ រចនាសម្ព័ន្ធចំនួនប្រជាជន ទំនាក់ទំនង phylogenetic ហ្សែនមុខងារ និងបណ្តាញទំនាក់ទំនងជាមួយកត្តាបរិស្ថាន។
វេទិកា៖Illumina NovaSeq6000
-
លំដាប់មេតាណុល - ណាណូប៉ូរ៉េ
Metagenomics គឺជាឧបករណ៍ម៉ូលេគុលដែលប្រើដើម្បីវិភាគវត្ថុធាតុហ្សែនចម្រុះដែលស្រង់ចេញពីសំណាកបរិស្ថាន ដែលផ្តល់ព័ត៌មានលម្អិតអំពីភាពចម្រុះនៃប្រភេទសត្វ និងភាពសម្បូរបែប រចនាសម្ព័ន្ធចំនួនប្រជាជន ទំនាក់ទំនង phylogenetic ហ្សែនមុខងារ និងបណ្តាញទំនាក់ទំនងជាមួយកត្តាបរិស្ថាន។ល។ ដល់ការសិក្សាមេតាណិច។ការសម្តែងដ៏ល្អឥតខ្ចោះរបស់វានៅក្នុងប្រវែងអាន ភាគច្រើនបានពង្រឹងការវិភាគមេតាហ្សែនចុះក្រោម ជាពិសេសការផ្គុំមេតាហ្សែន។ឆ្លៀតយកអត្ថប្រយោជន៍នៃប្រវែងអាន ការសិក្សាមេតាហ្សែនដែលមានមូលដ្ឋានលើ Nanopore គឺអាចសម្រេចបាននូវការប្រមូលផ្តុំជាបន្តបន្ទាប់បន្ថែមទៀត បើប្រៀបធៀបជាមួយមេតាណមបាញ់កាំភ្លើង។វាត្រូវបានគេបោះពុម្ភផ្សាយថា metagenomics ដែលមានមូលដ្ឋានលើ Nanopore បានបង្កើតដោយជោគជ័យនូវហ្សែនបាក់តេរីពេញលេញ និងបិទពី microbiomes (Moss, EL, et. al,ជីវបច្ចេកវិទ្យាធម្មជាតិឆ្នាំ ២០២០)
វេទិកា៖Nanopor PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
អង្គភាពរងនៅលើ 16S និង 18S rRNA ដែលមានទាំងតំបន់អភិរក្សខ្ពស់ និងអថេរខ្ពស់ គឺជាស្នាមម្រាមដៃម៉ូលេគុលដ៏ល្អឥតខ្ចោះសម្រាប់ការកំណត់អត្តសញ្ញាណសារពាង្គកាយ prokaryotic និង eukaryotic ។ទាញយកអត្ថប្រយោជន៍នៃលំដាប់លំដោយ amplicons ទាំងនេះអាចត្រូវបានកំណត់គោលដៅដោយផ្អែកលើផ្នែកដែលបានអភិរក្ស ហើយតំបន់អថេរខ្ពស់អាចត្រូវបានកំណត់លក្ខណៈពេញលេញសម្រាប់ការកំណត់អត្តសញ្ញាណអតិសុខុមប្រាណដែលរួមចំណែកដល់ការសិក្សាដែលគ្របដណ្តប់លើការវិភាគភាពចម្រុះនៃអតិសុខុមប្រាណ និក្ខេបបទ phylogeny ជាដើម។ ពេលវេលាពិតតែមួយម៉ូលេគុល(SMRT ) លំដាប់លំដោយនៃវេទិកា PacBio អនុញ្ញាតឱ្យមានការអានដ៏វែងដែលមានភាពត្រឹមត្រូវខ្ពស់ ដែលអាចគ្របដណ្តប់ amplicons ប្រវែងពេញ (ប្រហែល 1.5 Kb) ។ទិដ្ឋភាពទូលំទូលាយនៃវាលហ្សែនបានពង្រឹងយ៉ាងខ្លាំងនូវដំណោះស្រាយនៅក្នុងចំណារពន្យល់អំពីប្រភេទសត្វនៅក្នុងសហគមន៍បាក់តេរី ឬផ្សិត។
វេទិកា៖PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing មានគោលបំណងបង្ហាញពីភាពសំបូរបែបនៃ phylogeny, taxonomy និងប្រភេទសត្វនៅក្នុងសហគមន៍អតិសុខុមប្រាណដោយការស៊ើបអង្កេតផលិតផល PCR នៃសញ្ញាសម្គាល់ហ្សែនថែរក្សាផ្ទះដែលមានទាំងផ្នែកដែលអាចបំប្លែងបានខ្ពស់ និងអថេរ។ការណែនាំនៃស្នាមម្រាមដៃម៉ូលេគុលដ៏ល្អឥតខ្ចោះទាំងនេះដោយ Woeses et al, (1977) ផ្តល់សិទ្ធិអំណាចដល់ការបង្កើតទម្រង់មីក្រូជីវមដែលមិនមានឯកោ។ការដាក់តាមលំដាប់នៃ 16S (បាក់តេរី), 18S (ផ្សិត) និងឧបករណ៍ផ្ទុកទិន្នន័យខាងក្នុង (ITS, ផ្សិត) អនុញ្ញាតឱ្យកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទសត្វច្រើនក្រៃលែង ក៏ដូចជាប្រភេទសត្វកម្រ និងមិនស្គាល់អត្តសញ្ញាណ។បច្ចេកវិទ្យានេះបានក្លាយជាឧបករណ៍ដែលត្រូវបានអនុវត្តយ៉ាងទូលំទូលាយ និងសំខាន់ក្នុងការកំណត់អត្តសញ្ញាណសមាសធាតុអតិសុខុមប្រាណឌីផេរ៉ង់ស្យែលនៅក្នុងបរិយាកាសផ្សេងៗ ដូចជាមាត់មនុស្ស ពោះវៀន លាមកជាដើម។
វេទិកា៖Illumina NovaSeq6000
-
ការបន្តពូជរបស់បាក់តេរី និងផ្សិតទាំងមូលឡើងវិញ
ការរៀបចំឡើងវិញនូវហ្សែនទាំងមូលនៃបាក់តេរី និងផ្សិត គឺជាឧបករណ៍សំខាន់មួយដើម្បីបំពេញហ្សែននៃបាក់តេរី និងផ្សិតដែលគេស្គាល់ ក៏ដូចជាដើម្បីប្រៀបធៀបហ្សែនជាច្រើន ឬដើម្បីគូសផែនទីហ្សែននៃសារពាង្គកាយថ្មី។វាមានសារៈសំខាន់ខ្លាំងណាស់ក្នុងការរៀបចំហ្សែនទាំងមូលនៃបាក់តេរី និងផ្សិត ដើម្បីបង្កើតហ្សែនយោងត្រឹមត្រូវ ធ្វើការកំណត់អត្តសញ្ញាណអតិសុខុមប្រាណ និងការសិក្សាអំពីហ្សែនប្រៀបធៀបផ្សេងទៀត។
វេទិកា៖ Illumina NovaSeq 6000
-
ហ្សែនផ្សិត
Biomarker Technologies ផ្តល់នូវការស្ទង់មតិហ្សែន ហ្សែនដ៏ល្អ និងហ្សែនពេញលេញនៃផ្សិត អាស្រ័យលើគោលដៅស្រាវជ្រាវជាក់លាក់។លំដាប់ហ្សែន ការជួបប្រជុំគ្នា និងចំណារពន្យល់មុខងារអាចសម្រេចបានដោយការរួមបញ្ចូលគ្នានូវលំដាប់ជំនាន់បន្ទាប់ + លំដាប់ជំនាន់ទីបី ដើម្បីសម្រេចបាននូវការផ្គុំហ្សែនកម្រិតខ្ពស់។បច្ចេកវិទ្យា Hi-C ក៏អាចត្រូវបានគេប្រើប្រាស់ផងដែរ ដើម្បីជួយសម្រួលដល់ការប្រមូលផ្តុំហ្សែននៅកម្រិតក្រូម៉ូសូម។
វេទិកា៖PacBio Sequel II
Nanopor PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
បាក់តេរីពេញលេញហ្សែន
Biomarker Technologies ផ្តល់សេវាកម្មលំដាប់លំដោយលើការបង្កើតហ្សែនបាក់តេរីពេញលេញជាមួយនឹងគម្លាតសូន្យ។លំហូរការងារចម្បងនៃបាក់តេរី ការសាងសង់ហ្សែនដែលបានបញ្ចប់រួមមានការបន្តបន្ទាប់គ្នាជំនាន់ទីបី ការជួបប្រជុំគ្នា ចំណារពន្យល់មុខងារ និងការវិភាគជីវព័ត៌មានកម្រិតខ្ពស់ដែលបំពេញគោលដៅស្រាវជ្រាវជាក់លាក់។ការកំណត់រចនាសម្ព័ន្ធហ្សែនរបស់បាក់តេរីកាន់តែទូលំទូលាយផ្តល់អំណាចឱ្យបង្ហាញពីយន្តការមូលដ្ឋានដែលស្ថិតនៅក្រោមដំណើរការជីវសាស្រ្តរបស់ពួកគេ ដែលអាចផ្តល់ឯកសារយោងដ៏មានតម្លៃសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវហ្សែននៅក្នុងប្រភេទ eukaryotic ខ្ពស់ជាង។
វេទិកា៖Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
